MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 9352

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003198	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003198	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
3	NC_003198	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	16758995
4	NC_003198	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	16758995
5	NC_003198	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
6	NC_003198	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	16758995
7	NC_003198	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	16758995
8	NC_003198	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
9	NC_003198	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	16758995
10	NC_003198	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	16758996
11	NC_003198	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	16758996
12	NC_003198	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	16758997
13	NC_003198	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	16758997
14	NC_003198	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	16758998
15	NC_003198	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	16758998
16	NC_003198	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	16758998
17	NC_003198	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	16758998
18	NC_003198	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	16758999
19	NC_003198	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	16758999
20	NC_003198	CG	3	6	6991	6996	0 %	0 %	50 %	50 %	16758999
21	NC_003198	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	16759000
22	NC_003198	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	16759000
23	NC_003198	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	16759000
24	NC_003198	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	16759000
25	NC_003198	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	16759002
26	NC_003198	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	16759003
27	NC_003198	CG	3	6	12990	12995	0 %	0 %	50 %	50 %	16759005
28	NC_003198	GC	3	6	13302	13307	0 %	0 %	50 %	50 %	16759005
29	NC_003198	GC	3	6	14551	14556	0 %	0 %	50 %	50 %	16759006
30	NC_003198	GA	3	6	14662	14667	50 %	0 %	50 %	0 %	16759006
31	NC_003198	AT	3	6	15378	15383	50 %	50 %	0 %	0 %	16759007
32	NC_003198	AT	3	6	15653	15658	50 %	50 %	0 %	0 %	16759007
33	NC_003198	AT	3	6	15906	15911	50 %	50 %	0 %	0 %	16759007
34	NC_003198	AC	3	6	15967	15972	50 %	0 %	0 %	50 %	16759007
35	NC_003198	GA	3	6	17070	17075	50 %	0 %	50 %	0 %	16759010
36	NC_003198	GC	3	6	18372	18377	0 %	0 %	50 %	50 %	16759011
37	NC_003198	CT	3	6	20346	20351	0 %	50 %	0 %	50 %	16759012
38	NC_003198	GC	3	6	20662	20667	0 %	0 %	50 %	50 %	16759012
39	NC_003198	GC	3	6	20782	20787	0 %	0 %	50 %	50 %	16759012
40	NC_003198	GC	3	6	21187	21192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_003198	GC	3	6	22045	22050	0 %	0 %	50 %	50 %	16759013
42	NC_003198	CT	3	6	22800	22805	0 %	50 %	0 %	50 %	16759013
43	NC_003198	AT	3	6	23588	23593	50 %	50 %	0 %	0 %	16759014
44	NC_003198	CG	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	16759014
45	NC_003198	GC	4	8	23801	23808	0 %	0 %	50 %	50 %	16759014
46	NC_003198	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003198	CG	3	6	25068	25073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_003198	CT	3	6	25354	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	16759016
49	NC_003198	AT	3	6	25384	25389	50 %	50 %	0 %	0 %	16759016
50	NC_003198	GC	3	6	26087	26092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003198	CG	3	6	28017	28022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003198	GC	3	6	28145	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003198	TC	3	6	28377	28382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003198	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	16759017
55	NC_003198	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	16759017
56	NC_003198	CT	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	16759019
57	NC_003198	CG	3	6	30172	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	16759019
58	NC_003198	CG	3	6	30435	30440	0 %	0 %	50 %	50 %	16759019
59	NC_003198	AT	3	6	30536	30541	50 %	50 %	0 %	0 %	16759020
60	NC_003198	GC	3	6	30767	30772	0 %	0 %	50 %	50 %	16759020
61	NC_003198	GC	3	6	31057	31062	0 %	0 %	50 %	50 %	16759020
62	NC_003198	GT	3	6	33045	33050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003198	TC	3	6	33489	33494	0 %	50 %	0 %	50 %	16759024
64	NC_003198	AT	3	6	33739	33744	50 %	50 %	0 %	0 %	16759024
65	NC_003198	TA	3	6	33942	33947	50 %	50 %	0 %	0 %	16759024
66	NC_003198	TA	3	6	34437	34442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003198	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	16759025
68	NC_003198	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	16759026
69	NC_003198	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	16759026
70	NC_003198	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	16759026
71	NC_003198	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	16759027
72	NC_003198	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	16759028
73	NC_003198	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003198	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003198	AT	4	8	40032	40039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003198	AT	3	6	40086	40091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003198	CG	3	6	40374	40379	0 %	0 %	50 %	50 %	16759029
78	NC_003198	CG	3	6	41062	41067	0 %	0 %	50 %	50 %	16759029
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80	NC_003198	TG	3	6	42798	42803	0 %	50 %	50 %	0 %	16759030
81	NC_003198	CG	3	6	43312	43317	0 %	0 %	50 %	50 %	16759031
82	NC_003198	TA	3	6	43685	43690	50 %	50 %	0 %	0 %	16759031
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84	NC_003198	GC	3	6	45701	45706	0 %	0 %	50 %	50 %	16759032
85	NC_003198	TA	3	6	46106	46111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003198	GA	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003198	TA	3	6	46805	46810	50 %	50 %	0 %	0 %	16759033
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89	NC_003198	GC	4	8	47325	47332	0 %	0 %	50 %	50 %	16759033
90	NC_003198	GA	3	6	47407	47412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003198	GA	3	6	48239	48244	50 %	0 %	50 %	0 %	16759034
92	NC_003198	CG	4	8	49306	49313	0 %	0 %	50 %	50 %	16759035
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108	NC_003198	GC	4	8	58111	58118	0 %	0 %	50 %	50 %	16759043
109	NC_003198	TG	3	6	60720	60725	0 %	50 %	50 %	0 %	16759045
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111	NC_003198	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	16759047
112	NC_003198	AT	3	6	63061	63066	50 %	50 %	0 %	0 %	16759047
113	NC_003198	GT	3	6	63387	63392	0 %	50 %	50 %	0 %	16759047
114	NC_003198	GC	4	8	64117	64124	0 %	0 %	50 %	50 %	16759048
115	NC_003198	GC	3	6	64582	64587	0 %	0 %	50 %	50 %	16759048
116	NC_003198	GC	3	6	66226	66231	0 %	0 %	50 %	50 %	16759049
117	NC_003198	CG	3	6	66323	66328	0 %	0 %	50 %	50 %	16759049
118	NC_003198	GC	3	6	66729	66734	0 %	0 %	50 %	50 %	16759050
119	NC_003198	AT	3	6	68153	68158	50 %	50 %	0 %	0 %	16759051
120	NC_003198	GC	3	6	69032	69037	0 %	0 %	50 %	50 %	16759052
121	NC_003198	GC	3	6	69606	69611	0 %	0 %	50 %	50 %	16759052
122	NC_003198	AC	3	6	69658	69663	50 %	0 %	0 %	50 %	16759052
123	NC_003198	AG	3	6	69804	69809	50 %	0 %	50 %	0 %	16759053
124	NC_003198	CG	3	6	69883	69888	0 %	0 %	50 %	50 %	16759053
125	NC_003198	GC	3	6	69911	69916	0 %	0 %	50 %	50 %	16759053
126	NC_003198	CG	3	6	70540	70545	0 %	0 %	50 %	50 %	16759054
127	NC_003198	CG	3	6	70820	70825	0 %	0 %	50 %	50 %	16759054
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136	NC_003198	GC	3	6	73959	73964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_003198	AT	3	6	74894	74899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003198	TA	3	6	75213	75218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_003198	GC	3	6	79455	79460	0 %	0 %	50 %	50 %	16759060
147	NC_003198	TG	3	6	80362	80367	0 %	50 %	50 %	0 %	16759061
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