MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 11338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003197	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003197	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	16763392
3	NC_003197	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	16763392
4	NC_003197	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	16763393
5	NC_003197	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	16763394
6	NC_003197	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	16763394
7	NC_003197	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	16763394
8	NC_003197	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	16763394
9	NC_003197	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	16763396
10	NC_003197	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	16763396
11	NC_003197	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	16763397
12	NC_003197	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	16763397
13	NC_003197	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_003197	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	16763399
15	NC_003197	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	16763400
16	NC_003197	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	16763401
17	NC_003197	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	16763401
18	NC_003197	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	16763401
19	NC_003197	TCTG	2	8	11389	11396	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003197	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	16763402
21	NC_003197	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	16763402
22	NC_003197	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	16763402
23	NC_003197	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	16763402
24	NC_003197	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	16763402
25	NC_003197	GCGT	2	8	12930	12937	0 %	25 %	50 %	25 %	16763402
26	NC_003197	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	16763402
27	NC_003197	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	16763403
28	NC_003197	TCAG	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	16763404
29	NC_003197	TTTG	2	8	15533	15540	0 %	75 %	25 %	0 %	16763404
30	NC_003197	CGAA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	25 %	25 %	16763404
31	NC_003197	ATTG	2	8	15760	15767	25 %	50 %	25 %	0 %	16763404
32	NC_003197	ATTA	2	8	16428	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	16763405
33	NC_003197	ATAA	2	8	16520	16527	75 %	25 %	0 %	0 %	16763406
34	NC_003197	AATA	2	8	17996	18003	75 %	25 %	0 %	0 %	16763408
35	NC_003197	GGGC	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	16763408
36	NC_003197	CGTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	50 %	25 %	16763408
37	NC_003197	CCAA	2	8	21283	21290	50 %	0 %	0 %	50 %	16763409
38	NC_003197	GACG	2	8	21629	21636	25 %	0 %	50 %	25 %	16763409
39	NC_003197	TGGC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	50 %	25 %	16763409
40	NC_003197	TGGC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	50 %	25 %	16763409
41	NC_003197	CGCC	2	8	22654	22661	0 %	0 %	25 %	75 %	16763409
42	NC_003197	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	16763409
43	NC_003197	TTAT	2	8	23265	23272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003197	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	16763410
45	NC_003197	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	16763410
46	NC_003197	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	16763411
47	NC_003197	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	16763411
48	NC_003197	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	16763412
49	NC_003197	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	16763412
50	NC_003197	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	16763413
51	NC_003197	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	16763413
52	NC_003197	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	16763413
53	NC_003197	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	16763413
54	NC_003197	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	16763413
55	NC_003197	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
56	NC_003197	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
57	NC_003197	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
58	NC_003197	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	16763414
59	NC_003197	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	16763414
60	NC_003197	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	16763415
61	NC_003197	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	16763417
62	NC_003197	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	16763417
63	NC_003197	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	16763417
64	NC_003197	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	16763417
65	NC_003197	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	16763418
66	NC_003197	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	39546288
67	NC_003197	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	39546288
68	NC_003197	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	16763419
69	NC_003197	CGCA	2	8	32890	32897	25 %	0 %	25 %	50 %	16763419
70	NC_003197	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	16763419
71	NC_003197	CCAG	2	8	33346	33353	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_003197	TTAT	2	8	33529	33536	25 %	75 %	0 %	0 %	16763420
73	NC_003197	TTGG	2	8	33913	33920	0 %	50 %	50 %	0 %	16763420
74	NC_003197	CTTT	2	8	34293	34300	0 %	75 %	0 %	25 %	16763420
75	NC_003197	GAAG	2	8	34333	34340	50 %	0 %	50 %	0 %	16763420
76	NC_003197	TAAA	2	8	34385	34392	75 %	25 %	0 %	0 %	16763421
77	NC_003197	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	16763421
78	NC_003197	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	16763421
79	NC_003197	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	16763421
80	NC_003197	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003197	TGGA	2	8	35549	35556	25 %	25 %	50 %	0 %	16763422
82	NC_003197	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	16763422
83	NC_003197	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	16763423
84	NC_003197	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	16763423
85	NC_003197	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	16763423
86	NC_003197	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	16763423
87	NC_003197	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	16763423
88	NC_003197	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003197	AATT	2	8	40048	40055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003197	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	16763425
91	NC_003197	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	16763425
92	NC_003197	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	16763425
93	NC_003197	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	16763425
94	NC_003197	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	16763425
95	NC_003197	ACCG	2	8	41758	41765	25 %	0 %	25 %	50 %	16763426
96	NC_003197	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	16763426
97	NC_003197	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	16763426
98	NC_003197	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	16763426
99	NC_003197	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	16763427
100	NC_003197	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	16763427
101	NC_003197	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	16763428
102	NC_003197	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	16763428
103	NC_003197	TGAC	2	8	46042	46049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003197	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	16763429
105	NC_003197	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	16763429
106	NC_003197	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	16763429
107	NC_003197	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	16763430
108	NC_003197	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	16763430
109	NC_003197	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	16763430
110	NC_003197	TACC	2	8	48321	48328	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_003197	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	16763431
112	NC_003197	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	16763431
113	NC_003197	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	16763431
114	NC_003197	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	16763431
115	NC_003197	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	16763432
116	NC_003197	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	16763432
117	NC_003197	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	16763432
118	NC_003197	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	16763432
119	NC_003197	AGTA	2	8	51937	51944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003197	ATCA	2	8	51977	51984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_003197	GAAA	2	8	52097	52104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003197	AGGG	2	8	52130	52137	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003197	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	16763435
124	NC_003197	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	16763435
125	NC_003197	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	16763435
126	NC_003197	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	16763436
127	NC_003197	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	16763438
128	NC_003197	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	16763438
129	NC_003197	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	16763438
130	NC_003197	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	16763439
131	NC_003197	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	16763440
132	NC_003197	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	16763440
133	NC_003197	GATT	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	16763440
134	NC_003197	GATC	2	8	59761	59768	25 %	25 %	25 %	25 %	16763440
135	NC_003197	CTGG	2	8	60886	60893	0 %	25 %	50 %	25 %	16763441
136	NC_003197	GTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	75 %	0 %	16763441
137	NC_003197	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	16763442
138	NC_003197	ACCA	2	8	61897	61904	50 %	0 %	0 %	50 %	16763443
139	NC_003197	GTGG	2	8	61932	61939	0 %	25 %	75 %	0 %	16763443
140	NC_003197	CATT	2	8	62122	62129	25 %	50 %	0 %	25 %	16763443
141	NC_003197	TCAA	2	8	63163	63170	50 %	25 %	0 %	25 %	16763443
142	NC_003197	TACT	2	8	63482	63489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_003197	TTTC	2	8	63490	63497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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