MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 9590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003197	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	16763392
2	NC_003197	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	16763392
3	NC_003197	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	16763393
4	NC_003197	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	16763394
5	NC_003197	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	16763394
6	NC_003197	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	16763394
7	NC_003197	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	16763394
8	NC_003197	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	16763396
9	NC_003197	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	16763396
10	NC_003197	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	16763397
11	NC_003197	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	16763397
12	NC_003197	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	16763399
13	NC_003197	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	16763400
14	NC_003197	TTGA	2	8	10977	10984	25 %	50 %	25 %	0 %	16763401
15	NC_003197	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	16763401
16	NC_003197	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	16763401
17	NC_003197	ATGG	2	8	11647	11654	25 %	25 %	50 %	0 %	16763402
18	NC_003197	TGGT	2	8	11738	11745	0 %	50 %	50 %	0 %	16763402
19	NC_003197	CAAC	2	8	12251	12258	50 %	0 %	0 %	50 %	16763402
20	NC_003197	AAGA	2	8	12325	12332	75 %	0 %	25 %	0 %	16763402
21	NC_003197	CCAT	2	8	12902	12909	25 %	25 %	0 %	50 %	16763402
22	NC_003197	GCGT	2	8	12930	12937	0 %	25 %	50 %	25 %	16763402
23	NC_003197	GGCT	2	8	13422	13429	0 %	25 %	50 %	25 %	16763402
24	NC_003197	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	16763403
25	NC_003197	TCAG	2	8	15243	15250	25 %	25 %	25 %	25 %	16763404
26	NC_003197	TTTG	2	8	15533	15540	0 %	75 %	25 %	0 %	16763404
27	NC_003197	CGAA	2	8	15748	15755	50 %	0 %	25 %	25 %	16763404
28	NC_003197	ATTG	2	8	15760	15767	25 %	50 %	25 %	0 %	16763404
29	NC_003197	ATTA	2	8	16428	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	16763405
30	NC_003197	ATAA	2	8	16520	16527	75 %	25 %	0 %	0 %	16763406
31	NC_003197	AATA	2	8	17996	18003	75 %	25 %	0 %	0 %	16763408
32	NC_003197	GGGC	2	8	18582	18589	0 %	0 %	75 %	25 %	16763408
33	NC_003197	CGTG	2	8	19282	19289	0 %	25 %	50 %	25 %	16763408
34	NC_003197	CCAA	2	8	21283	21290	50 %	0 %	0 %	50 %	16763409
35	NC_003197	GACG	2	8	21629	21636	25 %	0 %	50 %	25 %	16763409
36	NC_003197	TGGC	2	8	22282	22289	0 %	25 %	50 %	25 %	16763409
37	NC_003197	TGGC	2	8	22388	22395	0 %	25 %	50 %	25 %	16763409
38	NC_003197	CGCC	2	8	22654	22661	0 %	0 %	25 %	75 %	16763409
39	NC_003197	CTGG	2	8	23000	23007	0 %	25 %	50 %	25 %	16763409
40	NC_003197	TTTA	2	8	23498	23505	25 %	75 %	0 %	0 %	16763410
41	NC_003197	TCTG	2	8	23955	23962	0 %	50 %	25 %	25 %	16763410
42	NC_003197	TGAA	2	8	24466	24473	50 %	25 %	25 %	0 %	16763411
43	NC_003197	CCAG	2	8	24737	24744	25 %	0 %	25 %	50 %	16763411
44	NC_003197	ACCG	2	8	25414	25421	25 %	0 %	25 %	50 %	16763412
45	NC_003197	AAAT	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	16763412
46	NC_003197	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	16763413
47	NC_003197	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	16763413
48	NC_003197	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	16763413
49	NC_003197	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	16763413
50	NC_003197	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	16763413
51	NC_003197	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
52	NC_003197	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
53	NC_003197	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
54	NC_003197	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	16763414
55	NC_003197	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	16763414
56	NC_003197	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	16763415
57	NC_003197	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	16763417
58	NC_003197	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	16763417
59	NC_003197	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	16763417
60	NC_003197	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	16763417
61	NC_003197	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	16763418
62	NC_003197	ACCG	2	8	32226	32233	25 %	0 %	25 %	50 %	39546288
63	NC_003197	AGGC	2	8	32264	32271	25 %	0 %	50 %	25 %	39546288
64	NC_003197	CCTG	2	8	32700	32707	0 %	25 %	25 %	50 %	16763419
65	NC_003197	CGCA	2	8	32890	32897	25 %	0 %	25 %	50 %	16763419
66	NC_003197	TAAA	2	8	32960	32967	75 %	25 %	0 %	0 %	16763419
67	NC_003197	TTAT	2	8	33529	33536	25 %	75 %	0 %	0 %	16763420
68	NC_003197	TTGG	2	8	33913	33920	0 %	50 %	50 %	0 %	16763420
69	NC_003197	CTTT	2	8	34293	34300	0 %	75 %	0 %	25 %	16763420
70	NC_003197	GAAG	2	8	34333	34340	50 %	0 %	50 %	0 %	16763420
71	NC_003197	TAAA	2	8	34385	34392	75 %	25 %	0 %	0 %	16763421
72	NC_003197	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	16763421
73	NC_003197	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	16763421
74	NC_003197	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	16763421
75	NC_003197	TGGA	2	8	35549	35556	25 %	25 %	50 %	0 %	16763422
76	NC_003197	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	16763422
77	NC_003197	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	16763423
78	NC_003197	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	16763423
79	NC_003197	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	16763423
80	NC_003197	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	16763423
81	NC_003197	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	16763423
82	NC_003197	GCGG	2	8	40539	40546	0 %	0 %	75 %	25 %	16763425
83	NC_003197	CTGG	2	8	40757	40764	0 %	25 %	50 %	25 %	16763425
84	NC_003197	CCGA	2	8	41274	41281	25 %	0 %	25 %	50 %	16763425
85	NC_003197	ATCG	2	8	41430	41437	25 %	25 %	25 %	25 %	16763425
86	NC_003197	TCAA	2	8	41491	41498	50 %	25 %	0 %	25 %	16763425
87	NC_003197	ACCG	2	8	41758	41765	25 %	0 %	25 %	50 %	16763426
88	NC_003197	GAAA	2	8	41809	41816	75 %	0 %	25 %	0 %	16763426
89	NC_003197	GGTC	2	8	42381	42388	0 %	25 %	50 %	25 %	16763426
90	NC_003197	TTTG	2	8	42905	42912	0 %	75 %	25 %	0 %	16763426
91	NC_003197	GTAT	2	8	43200	43207	25 %	50 %	25 %	0 %	16763427
92	NC_003197	TCCG	2	8	43594	43601	0 %	25 %	25 %	50 %	16763427
93	NC_003197	ATGA	2	8	45656	45663	50 %	25 %	25 %	0 %	16763428
94	NC_003197	AACG	2	8	45958	45965	50 %	0 %	25 %	25 %	16763428
95	NC_003197	GAAA	2	8	46906	46913	75 %	0 %	25 %	0 %	16763429
96	NC_003197	TCGC	2	8	46921	46928	0 %	25 %	25 %	50 %	16763429
97	NC_003197	GCTG	2	8	47112	47119	0 %	25 %	50 %	25 %	16763429
98	NC_003197	CACG	2	8	47810	47817	25 %	0 %	25 %	50 %	16763430
99	NC_003197	CAGC	2	8	47837	47844	25 %	0 %	25 %	50 %	16763430
100	NC_003197	CTGC	2	8	47974	47981	0 %	25 %	25 %	50 %	16763430
101	NC_003197	CATG	2	8	48542	48549	25 %	25 %	25 %	25 %	16763431
102	NC_003197	AAGT	2	8	49336	49343	50 %	25 %	25 %	0 %	16763431
103	NC_003197	CCAG	2	8	49394	49401	25 %	0 %	25 %	50 %	16763431
104	NC_003197	TTGA	2	8	50175	50182	25 %	50 %	25 %	0 %	16763431
105	NC_003197	GAAA	2	8	50510	50517	75 %	0 %	25 %	0 %	16763432
106	NC_003197	GCCA	2	8	50851	50858	25 %	0 %	25 %	50 %	16763432
107	NC_003197	TAAA	2	8	51244	51251	75 %	25 %	0 %	0 %	16763432
108	NC_003197	TCTT	2	8	51363	51370	0 %	75 %	0 %	25 %	16763432
109	NC_003197	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	16763435
110	NC_003197	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	16763435
111	NC_003197	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	16763435
112	NC_003197	GTTC	2	8	56031	56038	0 %	50 %	25 %	25 %	16763436
113	NC_003197	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	16763438
114	NC_003197	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	16763438
115	NC_003197	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	16763438
116	NC_003197	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	16763439
117	NC_003197	TGGA	2	8	58994	59001	25 %	25 %	50 %	0 %	16763440
118	NC_003197	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	16763440
119	NC_003197	GATT	2	8	59392	59399	25 %	50 %	25 %	0 %	16763440
120	NC_003197	GATC	2	8	59761	59768	25 %	25 %	25 %	25 %	16763440
121	NC_003197	CTGG	2	8	60886	60893	0 %	25 %	50 %	25 %	16763441
122	NC_003197	GTGG	2	8	61051	61058	0 %	25 %	75 %	0 %	16763441
123	NC_003197	CTGC	2	8	61261	61268	0 %	25 %	25 %	50 %	16763442
124	NC_003197	ACCA	2	8	61897	61904	50 %	0 %	0 %	50 %	16763443
125	NC_003197	GTGG	2	8	61932	61939	0 %	25 %	75 %	0 %	16763443
126	NC_003197	CATT	2	8	62122	62129	25 %	50 %	0 %	25 %	16763443
127	NC_003197	TCAA	2	8	63163	63170	50 %	25 %	0 %	25 %	16763443
128	NC_003197	GCCA	2	8	64749	64756	25 %	0 %	25 %	50 %	16763444
129	NC_003197	GCTG	2	8	65137	65144	0 %	25 %	50 %	25 %	16763445
130	NC_003197	CGCC	2	8	65974	65981	0 %	0 %	25 %	75 %	16763445
131	NC_003197	CCAG	2	8	66169	66176	25 %	0 %	25 %	50 %	16763445
132	NC_003197	GAAG	2	8	67637	67644	50 %	0 %	50 %	0 %	16763447
133	NC_003197	CAGA	2	8	67810	67817	50 %	0 %	25 %	25 %	16763447
134	NC_003197	TTTC	2	8	68083	68090	0 %	75 %	0 %	25 %	16763447
135	NC_003197	AGTC	2	8	68242	68249	25 %	25 %	25 %	25 %	16763447
136	NC_003197	TAAT	2	8	68284	68291	50 %	50 %	0 %	0 %	16763447
137	NC_003197	ATTT	2	8	68670	68677	25 %	75 %	0 %	0 %	16763448
138	NC_003197	GTCG	2	8	68702	68709	0 %	25 %	50 %	25 %	16763448
139	NC_003197	GCAG	2	8	68987	68994	25 %	0 %	50 %	25 %	16763448
140	NC_003197	ACCG	2	8	69213	69220	25 %	0 %	25 %	50 %	16763448
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