MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 70338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003197	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003197	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003197	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763391
4	NC_003197	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763391
5	NC_003197	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_003197	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763392
7	NC_003197	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763392
8	NC_003197	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763392
9	NC_003197	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763392
10	NC_003197	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
11	NC_003197	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
12	NC_003197	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
13	NC_003197	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763392
14	NC_003197	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
15	NC_003197	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
16	NC_003197	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763392
17	NC_003197	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763392
18	NC_003197	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763392
19	NC_003197	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763392
20	NC_003197	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763392
21	NC_003197	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763392
22	NC_003197	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
23	NC_003197	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763392
24	NC_003197	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763392
25	NC_003197	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
26	NC_003197	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763392
27	NC_003197	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763392
28	NC_003197	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763392
29	NC_003197	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763392
30	NC_003197	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763392
31	NC_003197	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763392
32	NC_003197	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763392
33	NC_003197	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763392
34	NC_003197	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763392
35	NC_003197	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763392
36	NC_003197	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763392
37	NC_003197	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763392
38	NC_003197	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763392
39	NC_003197	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763392
40	NC_003197	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
41	NC_003197	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763392
42	NC_003197	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763392
43	NC_003197	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763392
44	NC_003197	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763392
45	NC_003197	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763392
46	NC_003197	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763392
47	NC_003197	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763392
48	NC_003197	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763392
49	NC_003197	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763392
50	NC_003197	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763393
51	NC_003197	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763393
52	NC_003197	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763393
53	NC_003197	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763393
54	NC_003197	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763393
55	NC_003197	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763393
56	NC_003197	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763393
57	NC_003197	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763393
58	NC_003197	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763393
59	NC_003197	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763393
60	NC_003197	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763393
61	NC_003197	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763393
62	NC_003197	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763393
63	NC_003197	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763393
64	NC_003197	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763394
65	NC_003197	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763394
66	NC_003197	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763394
67	NC_003197	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763394
68	NC_003197	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763394
69	NC_003197	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763394
70	NC_003197	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763394
71	NC_003197	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763394
72	NC_003197	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763394
73	NC_003197	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763394
74	NC_003197	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763394
75	NC_003197	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763394
76	NC_003197	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763394
77	NC_003197	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763394
78	NC_003197	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763394
79	NC_003197	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763394
80	NC_003197	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763394
81	NC_003197	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763394
82	NC_003197	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763394
83	NC_003197	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763394
84	NC_003197	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763394
85	NC_003197	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763394
86	NC_003197	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763394
87	NC_003197	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003197	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763395
89	NC_003197	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763395
90	NC_003197	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763395
91	NC_003197	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763395
92	NC_003197	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763395
93	NC_003197	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763395
94	NC_003197	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763395
95	NC_003197	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763395
96	NC_003197	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763395
97	NC_003197	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763395
98	NC_003197	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763395
99	NC_003197	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_003197	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763396
101	NC_003197	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763396
102	NC_003197	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763396
103	NC_003197	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763396
104	NC_003197	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763396
105	NC_003197	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763396
106	NC_003197	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763396
107	NC_003197	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763396
108	NC_003197	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763396
109	NC_003197	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763396
110	NC_003197	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763396
111	NC_003197	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763396
112	NC_003197	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763396
113	NC_003197	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763396
114	NC_003197	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763396
115	NC_003197	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763396
116	NC_003197	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763396
117	NC_003197	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003197	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003197	GGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003197	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003197	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003197	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763397
123	NC_003197	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763397
124	NC_003197	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763397
125	NC_003197	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763397
126	NC_003197	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763397
127	NC_003197	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763397
128	NC_003197	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763397
129	NC_003197	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763397
130	NC_003197	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763397
131	NC_003197	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763397
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133	NC_003197	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763397
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