MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 9624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003197	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003197	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	16763392
3	NC_003197	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	16763392
4	NC_003197	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	16763392
5	NC_003197	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	16763392
6	NC_003197	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	16763392
7	NC_003197	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	16763392
8	NC_003197	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	16763392
9	NC_003197	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	16763392
10	NC_003197	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	16763393
11	NC_003197	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	16763393
12	NC_003197	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	16763394
13	NC_003197	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	16763394
14	NC_003197	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	16763394
15	NC_003197	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	16763394
16	NC_003197	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	16763395
17	NC_003197	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	16763395
18	NC_003197	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	16763395
19	NC_003197	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	16763395
20	NC_003197	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	16763396
21	NC_003197	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	16763396
22	NC_003197	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	16763397
23	NC_003197	CG	3	6	7860	7865	0 %	0 %	50 %	50 %	16763397
24	NC_003197	CG	3	6	7958	7963	0 %	0 %	50 %	50 %	16763397
25	NC_003197	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	16763397
26	NC_003197	GC	3	6	8475	8480	0 %	0 %	50 %	50 %	16763397
27	NC_003197	TG	3	6	8901	8906	0 %	50 %	50 %	0 %	16763398
28	NC_003197	GC	3	6	9573	9578	0 %	0 %	50 %	50 %	16763399
29	NC_003197	CG	3	6	10533	10538	0 %	0 %	50 %	50 %	16763400
30	NC_003197	CG	3	6	12989	12994	0 %	0 %	50 %	50 %	16763402
31	NC_003197	GC	3	6	14550	14555	0 %	0 %	50 %	50 %	16763403
32	NC_003197	GA	3	6	14661	14666	50 %	0 %	50 %	0 %	16763403
33	NC_003197	AT	3	6	15372	15377	50 %	50 %	0 %	0 %	16763404
34	NC_003197	AT	3	6	15647	15652	50 %	50 %	0 %	0 %	16763404
35	NC_003197	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	16763404
36	NC_003197	GA	3	6	17064	17069	50 %	0 %	50 %	0 %	16763407
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41	NC_003197	GC	3	6	21181	21186	0 %	0 %	50 %	50 %	16763409
42	NC_003197	GC	3	6	22039	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	16763409
43	NC_003197	CT	3	6	22794	22799	0 %	50 %	0 %	50 %	16763409
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45	NC_003197	CG	3	6	23652	23657	0 %	0 %	50 %	50 %	16763410
46	NC_003197	GC	4	8	23795	23802	0 %	0 %	50 %	50 %	16763410
47	NC_003197	AT	3	6	24056	24061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003197	CG	3	6	25064	25069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003197	CT	3	6	25350	25355	0 %	50 %	0 %	50 %	16763412
50	NC_003197	AT	3	6	25380	25385	50 %	50 %	0 %	0 %	16763412
51	NC_003197	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
52	NC_003197	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
53	NC_003197	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
54	NC_003197	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
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57	NC_003197	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	16763414
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60	NC_003197	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	16763416
61	NC_003197	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	16763417
62	NC_003197	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	16763417
63	NC_003197	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	16763417
64	NC_003197	GT	3	6	33041	33046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003197	TC	3	6	33485	33490	0 %	50 %	0 %	50 %	16763420
66	NC_003197	AT	3	6	33735	33740	50 %	50 %	0 %	0 %	16763420
67	NC_003197	TA	3	6	33938	33943	50 %	50 %	0 %	0 %	16763420
68	NC_003197	AT	3	6	34434	34439	50 %	50 %	0 %	0 %	16763421
69	NC_003197	AT	3	6	34695	34700	50 %	50 %	0 %	0 %	16763421
70	NC_003197	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	16763422
71	NC_003197	TG	4	8	35656	35663	0 %	50 %	50 %	0 %	16763422
72	NC_003197	GC	3	6	36249	36254	0 %	0 %	50 %	50 %	16763422
73	NC_003197	TA	3	6	37199	37204	50 %	50 %	0 %	0 %	16763423
74	NC_003197	AT	3	6	39515	39520	50 %	50 %	0 %	0 %	16763424
75	NC_003197	AT	3	6	39831	39836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003197	AT	3	6	39946	39951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003197	AT	5	10	40033	40042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003197	AT	3	6	40089	40094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_003197	CG	3	6	41065	41070	0 %	0 %	50 %	50 %	16763425
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89	NC_003197	GA	3	6	46177	46182	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_003197	TG	3	6	47190	47195	0 %	50 %	50 %	0 %	16763429
92	NC_003197	GC	4	8	47329	47336	0 %	0 %	50 %	50 %	16763429
93	NC_003197	GA	3	6	47411	47416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_003197	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	16763439
110	NC_003197	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	16763439
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112	NC_003197	TG	3	6	60723	60728	0 %	50 %	50 %	0 %	16763441
113	NC_003197	TC	3	6	61127	61132	0 %	50 %	0 %	50 %	16763442
114	NC_003197	GC	3	6	62389	62394	0 %	0 %	50 %	50 %	16763443
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118	NC_003197	CG	3	6	66326	66331	0 %	0 %	50 %	50 %	16763445
119	NC_003197	GC	3	6	66733	66738	0 %	0 %	50 %	50 %	16763446
120	NC_003197	AT	3	6	68157	68162	50 %	50 %	0 %	0 %	16763447
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122	NC_003197	GC	3	6	69610	69615	0 %	0 %	50 %	50 %	16763448
123	NC_003197	AC	3	6	69662	69667	50 %	0 %	0 %	50 %	16763448
124	NC_003197	AG	3	6	69808	69813	50 %	0 %	50 %	0 %	16763449
125	NC_003197	CG	3	6	69887	69892	0 %	0 %	50 %	50 %	16763449
126	NC_003197	GC	3	6	69915	69920	0 %	0 %	50 %	50 %	16763449
127	NC_003197	CG	3	6	70544	70549	0 %	0 %	50 %	50 %	16763450
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129	NC_003197	TG	3	6	71465	71470	0 %	50 %	50 %	0 %	16763451
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139	NC_003197	AT	3	6	75464	75469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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