MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003140	AATAT	2	10	1193	1202	60 %	40 %	0 %	0 %	16119201
2	NC_003140	TTAAA	2	10	1740	1749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003140	TAGAT	2	10	3447	3456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003140	TGTGA	2	10	5155	5164	20 %	40 %	40 %	0 %	16119206
5	NC_003140	GCTGT	2	10	5684	5693	0 %	40 %	40 %	20 %	16119207
6	NC_003140	CTTTT	2	10	6322	6331	0 %	80 %	0 %	20 %	16119208
7	NC_003140	ATGAT	2	10	6951	6960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003140	AGAAA	2	10	7311	7320	80 %	0 %	20 %	0 %	16119209
9	NC_003140	TAGCT	2	10	7475	7484	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_003140	TAATT	2	10	8306	8315	40 %	60 %	0 %	0 %	16119210
11	NC_003140	CATAA	2	10	9131	9140	60 %	20 %	0 %	20 %	16119211
12	NC_003140	GATAC	2	10	9335	9344	40 %	20 %	20 %	20 %	16119211
13	NC_003140	CTCAA	2	10	10263	10272	40 %	20 %	0 %	40 %	16119211
14	NC_003140	AATTA	2	10	10275	10284	60 %	40 %	0 %	0 %	16119211
15	NC_003140	AATAT	2	10	10692	10701	60 %	40 %	0 %	0 %	16119212
16	NC_003140	TAATT	2	10	11641	11650	40 %	60 %	0 %	0 %	16119213
17	NC_003140	GTTTA	2	10	13931	13940	20 %	60 %	20 %	0 %	16119215
18	NC_003140	GGAAA	2	10	15797	15806	60 %	0 %	40 %	0 %	16119218
19	NC_003140	AACAA	2	10	16394	16403	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_003140	TATTT	2	10	16449	16458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003140	AAACA	2	10	16769	16778	80 %	0 %	0 %	20 %	16119219
22	NC_003140	ATAAA	2	10	18093	18102	80 %	20 %	0 %	0 %	16119220
23	NC_003140	TACTT	2	10	19254	19263	20 %	60 %	0 %	20 %	16119222
24	NC_003140	ATGAA	2	10	21598	21607	60 %	20 %	20 %	0 %	16119227
25	NC_003140	TAACG	2	10	23107	23116	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.