MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003140	TTTA	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003140	TAAA	2	8	157	164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003140	TAAA	2	8	173	180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003140	AAAG	2	8	268	275	75 %	0 %	25 %	0 %	16119201
5	NC_003140	CTAA	2	8	325	332	50 %	25 %	0 %	25 %	16119201
6	NC_003140	TAAA	2	8	536	543	75 %	25 %	0 %	0 %	16119201
7	NC_003140	ATGA	2	8	781	788	50 %	25 %	25 %	0 %	16119201
8	NC_003140	TGTA	2	8	1592	1599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003140	TTTG	2	8	1889	1896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003140	ATAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003140	TTTC	2	8	2912	2919	0 %	75 %	0 %	25 %	16119203
12	NC_003140	TAAG	2	8	3117	3124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003140	ATTT	2	8	3142	3149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003140	ATGA	2	8	3190	3197	50 %	25 %	25 %	0 %	16119204
15	NC_003140	AAAG	2	8	3374	3381	75 %	0 %	25 %	0 %	16119204
16	NC_003140	TTTC	2	8	3803	3810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_003140	TATT	2	8	3819	3826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003140	TTTC	2	8	3827	3834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003140	AATT	2	8	3923	3930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003140	TTAT	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003140	TTAG	2	8	4654	4661	25 %	50 %	25 %	0 %	16119205
22	NC_003140	TGAA	2	8	4799	4806	50 %	25 %	25 %	0 %	16119205
23	NC_003140	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	16119205
24	NC_003140	TTTA	2	8	5061	5068	25 %	75 %	0 %	0 %	16119205
25	NC_003140	TAAT	2	8	5731	5738	50 %	50 %	0 %	0 %	16119207
26	NC_003140	CATT	2	8	6017	6024	25 %	50 %	0 %	25 %	16119208
27	NC_003140	AATT	2	8	6085	6092	50 %	50 %	0 %	0 %	16119208
28	NC_003140	ATTC	2	8	6442	6449	25 %	50 %	0 %	25 %	16119208
29	NC_003140	TAAC	2	8	6830	6837	50 %	25 %	0 %	25 %	16119208
30	NC_003140	ATAA	2	8	7399	7406	75 %	25 %	0 %	0 %	16119209
31	NC_003140	AAAT	2	8	7820	7827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003140	TATT	2	8	7923	7930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003140	TTAA	2	8	8153	8160	50 %	50 %	0 %	0 %	16119210
34	NC_003140	TTTA	2	8	8242	8249	25 %	75 %	0 %	0 %	16119210
35	NC_003140	TGCT	2	8	9024	9031	0 %	50 %	25 %	25 %	16119211
36	NC_003140	AAGT	2	8	9109	9116	50 %	25 %	25 %	0 %	16119211
37	NC_003140	AAAG	2	8	9597	9604	75 %	0 %	25 %	0 %	16119211
38	NC_003140	CATT	2	8	9740	9747	25 %	50 %	0 %	25 %	16119211
39	NC_003140	ATTA	2	8	9778	9785	50 %	50 %	0 %	0 %	16119211
40	NC_003140	AATT	2	8	9819	9826	50 %	50 %	0 %	0 %	16119211
41	NC_003140	AAAG	2	8	10031	10038	75 %	0 %	25 %	0 %	16119211
42	NC_003140	ATTT	2	8	10073	10080	25 %	75 %	0 %	0 %	16119211
43	NC_003140	TGGA	2	8	10319	10326	25 %	25 %	50 %	0 %	16119211
44	NC_003140	ATTT	2	8	10839	10846	25 %	75 %	0 %	0 %	16119212
45	NC_003140	TAAG	2	8	11173	11180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003140	TAGA	2	8	11475	11482	50 %	25 %	25 %	0 %	16119213
47	NC_003140	AACG	2	8	11528	11535	50 %	0 %	25 %	25 %	16119213
48	NC_003140	ACTT	2	8	11739	11746	25 %	50 %	0 %	25 %	16119213
49	NC_003140	CTAA	2	8	11874	11881	50 %	25 %	0 %	25 %	16119213
50	NC_003140	TTCA	2	8	12949	12956	25 %	50 %	0 %	25 %	16119214
51	NC_003140	CATT	2	8	12962	12969	25 %	50 %	0 %	25 %	16119214
52	NC_003140	AATT	2	8	13207	13214	50 %	50 %	0 %	0 %	16119214
53	NC_003140	AAGA	2	8	13814	13821	75 %	0 %	25 %	0 %	16119215
54	NC_003140	TAAA	2	8	14040	14047	75 %	25 %	0 %	0 %	16119215
55	NC_003140	TGTA	2	8	14388	14395	25 %	50 %	25 %	0 %	16119216
56	NC_003140	TGTT	2	8	14704	14711	0 %	75 %	25 %	0 %	16119217
57	NC_003140	GTAA	2	8	14889	14896	50 %	25 %	25 %	0 %	16119217
58	NC_003140	GTAT	2	8	15286	15293	25 %	50 %	25 %	0 %	16119217
59	NC_003140	AACA	2	8	15350	15357	75 %	0 %	0 %	25 %	16119217
60	NC_003140	ATTT	2	8	15743	15750	25 %	75 %	0 %	0 %	16119218
61	NC_003140	TTGA	2	8	15923	15930	25 %	50 %	25 %	0 %	16119218
62	NC_003140	AACG	2	8	16218	16225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003140	TATT	2	8	16317	16324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003140	ATAA	3	12	16471	16482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003140	TCAT	2	8	17538	17545	25 %	50 %	0 %	25 %	16119220
66	NC_003140	TTAA	2	8	17918	17925	50 %	50 %	0 %	0 %	16119220
67	NC_003140	GGAT	2	8	18161	18168	25 %	25 %	50 %	0 %	16119220
68	NC_003140	AAAG	2	8	19464	19471	75 %	0 %	25 %	0 %	16119222
69	NC_003140	CATA	2	8	19779	19786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_003140	TAAG	2	8	20096	20103	50 %	25 %	25 %	0 %	16119223
71	NC_003140	ATTA	2	8	20232	20239	50 %	50 %	0 %	0 %	16119223
72	NC_003140	AGAT	2	8	20471	20478	50 %	25 %	25 %	0 %	16119224
73	NC_003140	AAAG	2	8	21002	21009	75 %	0 %	25 %	0 %	16119225
74	NC_003140	TCAA	2	8	21040	21047	50 %	25 %	0 %	25 %	16119225
75	NC_003140	GATA	2	8	21152	21159	50 %	25 %	25 %	0 %	16119225
76	NC_003140	TTTG	2	8	21271	21278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003140	ATTT	2	8	21646	21653	25 %	75 %	0 %	0 %	16119227
78	NC_003140	AGAT	2	8	22276	22283	50 %	25 %	25 %	0 %	16119227
79	NC_003140	AGAA	2	8	22381	22388	75 %	0 %	25 %	0 %	16119227
80	NC_003140	TCCT	2	8	22639	22646	0 %	50 %	0 %	50 %	16119228
81	NC_003140	ATTT	2	8	22671	22678	25 %	75 %	0 %	0 %	16119228
82	NC_003140	TTAA	2	8	22697	22704	50 %	50 %	0 %	0 %	16119228
83	NC_003140	TTTC	2	8	22802	22809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_003140	CATT	2	8	22835	22842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003140	TCAT	2	8	23159	23166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_003140	ATAA	2	8	23287	23294	75 %	25 %	0 %	0 %	16119229
87	NC_003140	ATTT	2	8	23375	23382	25 %	75 %	0 %	0 %	16119230
88	NC_003140	TTTG	2	8	23624	23631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003140	CAAA	2	8	23724	23731	75 %	0 %	0 %	25 %	16119231
90	NC_003140	TCTT	2	8	24097	24104	0 %	75 %	0 %	25 %	16119231
91	NC_003140	CATC	2	8	24554	24561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.