MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003140	AAAG	2	8	268	275	75 %	0 %	25 %	0 %	16119201
2	NC_003140	CTAA	2	8	325	332	50 %	25 %	0 %	25 %	16119201
3	NC_003140	TAAA	2	8	536	543	75 %	25 %	0 %	0 %	16119201
4	NC_003140	ATGA	2	8	781	788	50 %	25 %	25 %	0 %	16119201
5	NC_003140	TTTC	2	8	2912	2919	0 %	75 %	0 %	25 %	16119203
6	NC_003140	ATGA	2	8	3190	3197	50 %	25 %	25 %	0 %	16119204
7	NC_003140	AAAG	2	8	3374	3381	75 %	0 %	25 %	0 %	16119204
8	NC_003140	TTAG	2	8	4654	4661	25 %	50 %	25 %	0 %	16119205
9	NC_003140	TGAA	2	8	4799	4806	50 %	25 %	25 %	0 %	16119205
10	NC_003140	TTAC	2	8	4921	4928	25 %	50 %	0 %	25 %	16119205
11	NC_003140	TTTA	2	8	5061	5068	25 %	75 %	0 %	0 %	16119205
12	NC_003140	TAAT	2	8	5731	5738	50 %	50 %	0 %	0 %	16119207
13	NC_003140	CATT	2	8	6017	6024	25 %	50 %	0 %	25 %	16119208
14	NC_003140	AATT	2	8	6085	6092	50 %	50 %	0 %	0 %	16119208
15	NC_003140	ATTC	2	8	6442	6449	25 %	50 %	0 %	25 %	16119208
16	NC_003140	TAAC	2	8	6830	6837	50 %	25 %	0 %	25 %	16119208
17	NC_003140	ATAA	2	8	7399	7406	75 %	25 %	0 %	0 %	16119209
18	NC_003140	TTAA	2	8	8153	8160	50 %	50 %	0 %	0 %	16119210
19	NC_003140	TTTA	2	8	8242	8249	25 %	75 %	0 %	0 %	16119210
20	NC_003140	TGCT	2	8	9024	9031	0 %	50 %	25 %	25 %	16119211
21	NC_003140	AAGT	2	8	9109	9116	50 %	25 %	25 %	0 %	16119211
22	NC_003140	AAAG	2	8	9597	9604	75 %	0 %	25 %	0 %	16119211
23	NC_003140	CATT	2	8	9740	9747	25 %	50 %	0 %	25 %	16119211
24	NC_003140	ATTA	2	8	9778	9785	50 %	50 %	0 %	0 %	16119211
25	NC_003140	AATT	2	8	9819	9826	50 %	50 %	0 %	0 %	16119211
26	NC_003140	AAAG	2	8	10031	10038	75 %	0 %	25 %	0 %	16119211
27	NC_003140	ATTT	2	8	10073	10080	25 %	75 %	0 %	0 %	16119211
28	NC_003140	TGGA	2	8	10319	10326	25 %	25 %	50 %	0 %	16119211
29	NC_003140	ATTT	2	8	10839	10846	25 %	75 %	0 %	0 %	16119212
30	NC_003140	TAGA	2	8	11475	11482	50 %	25 %	25 %	0 %	16119213
31	NC_003140	AACG	2	8	11528	11535	50 %	0 %	25 %	25 %	16119213
32	NC_003140	ACTT	2	8	11739	11746	25 %	50 %	0 %	25 %	16119213
33	NC_003140	CTAA	2	8	11874	11881	50 %	25 %	0 %	25 %	16119213
34	NC_003140	TTCA	2	8	12949	12956	25 %	50 %	0 %	25 %	16119214
35	NC_003140	CATT	2	8	12962	12969	25 %	50 %	0 %	25 %	16119214
36	NC_003140	AATT	2	8	13207	13214	50 %	50 %	0 %	0 %	16119214
37	NC_003140	AAGA	2	8	13814	13821	75 %	0 %	25 %	0 %	16119215
38	NC_003140	TAAA	2	8	14040	14047	75 %	25 %	0 %	0 %	16119215
39	NC_003140	TGTA	2	8	14388	14395	25 %	50 %	25 %	0 %	16119216
40	NC_003140	TGTT	2	8	14704	14711	0 %	75 %	25 %	0 %	16119217
41	NC_003140	GTAA	2	8	14889	14896	50 %	25 %	25 %	0 %	16119217
42	NC_003140	GTAT	2	8	15286	15293	25 %	50 %	25 %	0 %	16119217
43	NC_003140	AACA	2	8	15350	15357	75 %	0 %	0 %	25 %	16119217
44	NC_003140	ATTT	2	8	15743	15750	25 %	75 %	0 %	0 %	16119218
45	NC_003140	TTGA	2	8	15923	15930	25 %	50 %	25 %	0 %	16119218
46	NC_003140	TCAT	2	8	17538	17545	25 %	50 %	0 %	25 %	16119220
47	NC_003140	TTAA	2	8	17918	17925	50 %	50 %	0 %	0 %	16119220
48	NC_003140	GGAT	2	8	18161	18168	25 %	25 %	50 %	0 %	16119220
49	NC_003140	AAAG	2	8	19464	19471	75 %	0 %	25 %	0 %	16119222
50	NC_003140	TAAG	2	8	20096	20103	50 %	25 %	25 %	0 %	16119223
51	NC_003140	ATTA	2	8	20232	20239	50 %	50 %	0 %	0 %	16119223
52	NC_003140	AGAT	2	8	20471	20478	50 %	25 %	25 %	0 %	16119224
53	NC_003140	AAAG	2	8	21002	21009	75 %	0 %	25 %	0 %	16119225
54	NC_003140	TCAA	2	8	21040	21047	50 %	25 %	0 %	25 %	16119225
55	NC_003140	GATA	2	8	21152	21159	50 %	25 %	25 %	0 %	16119225
56	NC_003140	ATTT	2	8	21646	21653	25 %	75 %	0 %	0 %	16119227
57	NC_003140	AGAT	2	8	22276	22283	50 %	25 %	25 %	0 %	16119227
58	NC_003140	AGAA	2	8	22381	22388	75 %	0 %	25 %	0 %	16119227
59	NC_003140	TCCT	2	8	22639	22646	0 %	50 %	0 %	50 %	16119228
60	NC_003140	ATTT	2	8	22671	22678	25 %	75 %	0 %	0 %	16119228
61	NC_003140	TTAA	2	8	22697	22704	50 %	50 %	0 %	0 %	16119228
62	NC_003140	ATAA	2	8	23287	23294	75 %	25 %	0 %	0 %	16119229
63	NC_003140	ATTT	2	8	23375	23382	25 %	75 %	0 %	0 %	16119230
64	NC_003140	CAAA	2	8	23724	23731	75 %	0 %	0 %	25 %	16119231
65	NC_003140	TCTT	2	8	24097	24104	0 %	75 %	0 %	25 %	16119231

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.