MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003140	TA	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003140	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003140	GA	3	6	2061	2066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003140	AC	3	6	2167	2172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_003140	TA	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003140	AT	3	6	2691	2696	50 %	50 %	0 %	0 %	16119203
7	NC_003140	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003140	AT	3	6	3210	3215	50 %	50 %	0 %	0 %	16119204
9	NC_003140	AT	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003140	AT	3	6	3684	3689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003140	AG	3	6	4781	4786	50 %	0 %	50 %	0 %	16119205
12	NC_003140	TA	3	6	5047	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	16119205
13	NC_003140	TG	3	6	5306	5311	0 %	50 %	50 %	0 %	16119206
14	NC_003140	TA	3	6	5375	5380	50 %	50 %	0 %	0 %	16119206
15	NC_003140	AG	3	6	5449	5454	50 %	0 %	50 %	0 %	16119206
16	NC_003140	TA	3	6	5525	5530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003140	TC	3	6	5600	5605	0 %	50 %	0 %	50 %	16119207
18	NC_003140	AG	3	6	5622	5627	50 %	0 %	50 %	0 %	16119207
19	NC_003140	TA	3	6	5826	5831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003140	AT	3	6	6039	6044	50 %	50 %	0 %	0 %	16119208
21	NC_003140	AT	3	6	6117	6122	50 %	50 %	0 %	0 %	16119208
22	NC_003140	AG	3	6	6985	6990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003140	TA	3	6	7489	7494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003140	AT	3	6	7658	7663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003140	TA	3	6	7782	7787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003140	AT	3	6	9427	9432	50 %	50 %	0 %	0 %	16119211
27	NC_003140	AT	3	6	9484	9489	50 %	50 %	0 %	0 %	16119211
28	NC_003140	AT	3	6	9729	9734	50 %	50 %	0 %	0 %	16119211
29	NC_003140	TA	3	6	10798	10803	50 %	50 %	0 %	0 %	16119212
30	NC_003140	AT	3	6	11105	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003140	TA	3	6	11269	11274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003140	TC	3	6	12259	12264	0 %	50 %	0 %	50 %	16119214
33	NC_003140	GT	3	6	12540	12545	0 %	50 %	50 %	0 %	16119214
34	NC_003140	AT	3	6	12728	12733	50 %	50 %	0 %	0 %	16119214
35	NC_003140	GT	3	6	13063	13068	0 %	50 %	50 %	0 %	16119214
36	NC_003140	TA	4	8	13875	13882	50 %	50 %	0 %	0 %	16119215
37	NC_003140	TA	4	8	14019	14026	50 %	50 %	0 %	0 %	16119215
38	NC_003140	TA	3	6	14066	14071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003140	AT	3	6	14971	14976	50 %	50 %	0 %	0 %	16119217
40	NC_003140	TC	3	6	14977	14982	0 %	50 %	0 %	50 %	16119217
41	NC_003140	AT	3	6	15900	15905	50 %	50 %	0 %	0 %	16119218
42	NC_003140	CT	3	6	16202	16207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003140	TA	4	8	16382	16389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003140	AT	3	6	16801	16806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003140	AG	3	6	17195	17200	50 %	0 %	50 %	0 %	16119220
46	NC_003140	AT	3	6	17529	17534	50 %	50 %	0 %	0 %	16119220
47	NC_003140	AT	4	8	17802	17809	50 %	50 %	0 %	0 %	16119220
48	NC_003140	AT	3	6	17907	17912	50 %	50 %	0 %	0 %	16119220
49	NC_003140	AT	4	8	19303	19310	50 %	50 %	0 %	0 %	16119222
50	NC_003140	AT	3	6	21331	21336	50 %	50 %	0 %	0 %	16119226
51	NC_003140	GA	3	6	21577	21582	50 %	0 %	50 %	0 %	16119227
52	NC_003140	TA	3	6	21589	21594	50 %	50 %	0 %	0 %	16119227
53	NC_003140	AG	3	6	22545	22550	50 %	0 %	50 %	0 %	16119228
54	NC_003140	AT	3	6	22584	22589	50 %	50 %	0 %	0 %	16119228
55	NC_003140	AG	3	6	22748	22753	50 %	0 %	50 %	0 %	16119228
56	NC_003140	AT	3	6	22968	22973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003140	CT	3	6	23179	23184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_003140	GA	3	6	23202	23207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003140	TA	3	6	23275	23280	50 %	50 %	0 %	0 %	16119229
60	NC_003140	TA	3	6	23666	23671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003140	AT	3	6	23868	23873	50 %	50 %	0 %	0 %	16119231
62	NC_003140	CT	3	6	24056	24061	0 %	50 %	0 %	50 %	16119231

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.