MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003134	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082782
2	NC_003134	ATAGTG	2	12	3002	3013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	40787862
3	NC_003134	GCTGAA	2	12	5261	5272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	40787862
4	NC_003134	GTGCCA	2	12	5756	5767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	40787862
5	NC_003134	CGAGTT	2	12	11312	11323	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16082789
6	NC_003134	AGTGAT	2	12	19589	19600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082796
7	NC_003134	GTTACG	2	12	22695	22706	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16082802
8	NC_003134	AACGGT	2	12	24271	24282	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16082804
9	NC_003134	GGCTGC	2	12	27020	27031	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16082806
10	NC_003134	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082809
11	NC_003134	GGTGGC	2	12	33464	33475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16082814
12	NC_003134	CGCGCC	2	12	40712	40723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082825
13	NC_003134	TGTGGT	2	12	42685	42696	0 %	50 %	50 %	0 %	16082827
14	NC_003134	GCTTAT	2	12	43586	43597	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_003134	TGGATA	2	12	46761	46772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082831
16	NC_003134	AGGGTT	2	12	49684	49695	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16082837
17	NC_003134	GCCAGT	2	12	52316	52327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16082840
18	NC_003134	TCAGCA	2	12	52610	52621	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082841
19	NC_003134	TGCTTG	2	12	53082	53093	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16082842
20	NC_003134	TCGCCA	2	12	53148	53159	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16082842
21	NC_003134	TGGGTT	2	12	55481	55492	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003134	CGCCAG	2	12	56626	56637	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082846
23	NC_003134	GCTCCT	2	12	58801	58812	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16082848
24	NC_003134	AGCCGA	2	12	60766	60777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082849
25	NC_003134	TCCTGG	2	12	62608	62619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082851
26	NC_003134	AGGGGT	2	12	69334	69345	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	16082859
27	NC_003134	AAAGCG	2	12	71669	71680	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16082862
28	NC_003134	AACATG	2	12	75059	75070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	40787870
29	NC_003134	AAAGAA	2	12	82792	82803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	16082874
30	NC_003134	TGAATT	2	12	85223	85234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	16082875
31	NC_003134	CAATTA	2	12	86095	86106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16082876
32	NC_003134	GTAACC	2	12	86436	86447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082876
33	NC_003134	TGGACG	2	12	91893	91904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082881
34	NC_003134	GCTGGC	2	12	92434	92445	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16082881

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.