MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 250

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003134	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003134	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	16082782
3	NC_003134	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	16082782
4	NC_003134	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	16082782
5	NC_003134	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	40787861
6	NC_003134	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	40787861
7	NC_003134	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	40787861
8	NC_003134	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003134	TTTA	2	8	2021	2028	25 %	75 %	0 %	0 %	16082784
10	NC_003134	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003134	TGAG	2	8	3064	3071	25 %	25 %	50 %	0 %	40787862
12	NC_003134	GGTT	2	8	3400	3407	0 %	50 %	50 %	0 %	40787862
13	NC_003134	AGCC	2	8	4173	4180	25 %	0 %	25 %	50 %	40787862
14	NC_003134	TCCA	2	8	4258	4265	25 %	25 %	0 %	50 %	40787862
15	NC_003134	CTAT	2	8	4481	4488	25 %	50 %	0 %	25 %	40787862
16	NC_003134	CTTC	2	8	5613	5620	0 %	50 %	0 %	50 %	40787862
17	NC_003134	ACTT	2	8	5867	5874	25 %	50 %	0 %	25 %	40787862
18	NC_003134	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003134	TCGT	2	8	5997	6004	0 %	50 %	25 %	25 %	16082787
20	NC_003134	ATTA	2	8	6246	6253	50 %	50 %	0 %	0 %	16082787
21	NC_003134	TTCA	2	8	6566	6573	25 %	50 %	0 %	25 %	16082788
22	NC_003134	GATT	2	8	6666	6673	25 %	50 %	25 %	0 %	16082788
23	NC_003134	CTGC	2	8	7029	7036	0 %	25 %	25 %	50 %	16082788
24	NC_003134	CTGC	2	8	7189	7196	0 %	25 %	25 %	50 %	16082788
25	NC_003134	TGTT	2	8	8550	8557	0 %	75 %	25 %	0 %	16082788
26	NC_003134	CAAC	2	8	8800	8807	50 %	0 %	0 %	50 %	16082788
27	NC_003134	TTGA	2	8	9174	9181	25 %	50 %	25 %	0 %	16082788
28	NC_003134	ACGC	2	8	9380	9387	25 %	0 %	25 %	50 %	16082788
29	NC_003134	AAGG	2	8	9680	9687	50 %	0 %	50 %	0 %	16082788
30	NC_003134	TGCG	2	8	9730	9737	0 %	25 %	50 %	25 %	16082788
31	NC_003134	GACG	2	8	9909	9916	25 %	0 %	50 %	25 %	16082788
32	NC_003134	CAGG	2	8	10266	10273	25 %	0 %	50 %	25 %	16082788
33	NC_003134	ACGA	2	8	10381	10388	50 %	0 %	25 %	25 %	16082788
34	NC_003134	CCAC	2	8	10489	10496	25 %	0 %	0 %	75 %	16082788
35	NC_003134	TGAC	2	8	10846	10853	25 %	25 %	25 %	25 %	16082788
36	NC_003134	CTGC	2	8	11326	11333	0 %	25 %	25 %	50 %	16082789
37	NC_003134	ACCA	2	8	11467	11474	50 %	0 %	0 %	50 %	16082789
38	NC_003134	AACT	2	8	11762	11769	50 %	25 %	0 %	25 %	16082789
39	NC_003134	TGAA	2	8	11939	11946	50 %	25 %	25 %	0 %	16082790
40	NC_003134	TTCG	2	8	12478	12485	0 %	50 %	25 %	25 %	16082790
41	NC_003134	AGAT	2	8	12506	12513	50 %	25 %	25 %	0 %	16082790
42	NC_003134	GCGT	2	8	12620	12627	0 %	25 %	50 %	25 %	16082791
43	NC_003134	AGTC	2	8	13663	13670	25 %	25 %	25 %	25 %	16082792
44	NC_003134	GTTA	2	8	13718	13725	25 %	50 %	25 %	0 %	16082793
45	NC_003134	GTTG	2	8	14421	14428	0 %	50 %	50 %	0 %	16082793
46	NC_003134	TGCC	2	8	14867	14874	0 %	25 %	25 %	50 %	16082793
47	NC_003134	GCCG	2	8	15309	15316	0 %	0 %	50 %	50 %	16082793
48	NC_003134	CTTC	2	8	15338	15345	0 %	50 %	0 %	50 %	16082793
49	NC_003134	AGCC	2	8	16779	16786	25 %	0 %	25 %	50 %	16082793
50	NC_003134	CGAA	2	8	16847	16854	50 %	0 %	25 %	25 %	16082793
51	NC_003134	AAGC	2	8	16880	16887	50 %	0 %	25 %	25 %	16082793
52	NC_003134	CGCA	2	8	17025	17032	25 %	0 %	25 %	50 %	16082793
53	NC_003134	CAAG	2	8	17555	17562	50 %	0 %	25 %	25 %	16082793
54	NC_003134	CGCC	2	8	17608	17615	0 %	0 %	25 %	75 %	16082793
55	NC_003134	CATC	2	8	17729	17736	25 %	25 %	0 %	50 %	16082793
56	NC_003134	CCCG	2	8	18226	18233	0 %	0 %	25 %	75 %	16082793
57	NC_003134	GCGA	2	8	18463	18470	25 %	0 %	50 %	25 %	16082794
58	NC_003134	CGCA	2	8	18496	18503	25 %	0 %	25 %	50 %	16082794
59	NC_003134	CAGT	2	8	18740	18747	25 %	25 %	25 %	25 %	16082795
60	NC_003134	CAGT	2	8	19219	19226	25 %	25 %	25 %	25 %	16082796
61	NC_003134	TCAA	2	8	19895	19902	50 %	25 %	0 %	25 %	16082797
62	NC_003134	AACC	2	8	19948	19955	50 %	0 %	0 %	50 %	16082797
63	NC_003134	TGGC	2	8	20148	20155	0 %	25 %	50 %	25 %	16082797
64	NC_003134	GATA	2	8	20388	20395	50 %	25 %	25 %	0 %	16082798
65	NC_003134	CAGA	2	8	21268	21275	50 %	0 %	25 %	25 %	16082800
66	NC_003134	TGAA	2	8	22861	22868	50 %	25 %	25 %	0 %	16082802
67	NC_003134	ACGG	2	8	22926	22933	25 %	0 %	50 %	25 %	16082802
68	NC_003134	AAGC	2	8	22980	22987	50 %	0 %	25 %	25 %	16082802
69	NC_003134	GCTC	2	8	23008	23015	0 %	25 %	25 %	50 %	16082802
70	NC_003134	TTAC	2	8	23171	23178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_003134	GCAG	2	8	23370	23377	25 %	0 %	50 %	25 %	16082803
72	NC_003134	TGCT	2	8	23382	23389	0 %	50 %	25 %	25 %	16082803
73	NC_003134	CGAT	2	8	23987	23994	25 %	25 %	25 %	25 %	16082803
74	NC_003134	GGCT	2	8	24324	24331	0 %	25 %	50 %	25 %	16082804
75	NC_003134	GAAG	2	8	24444	24451	50 %	0 %	50 %	0 %	16082804
76	NC_003134	CATC	2	8	24881	24888	25 %	25 %	0 %	50 %	16082804
77	NC_003134	TAAG	2	8	25028	25035	50 %	25 %	25 %	0 %	16082805
78	NC_003134	GTCA	2	8	25222	25229	25 %	25 %	25 %	25 %	16082805
79	NC_003134	CCAT	2	8	25293	25300	25 %	25 %	0 %	50 %	16082805
80	NC_003134	GATG	2	8	26158	26165	25 %	25 %	50 %	0 %	16082805
81	NC_003134	ATGA	2	8	26269	26276	50 %	25 %	25 %	0 %	16082805
82	NC_003134	CGCC	2	8	26414	26421	0 %	0 %	25 %	75 %	16082805
83	NC_003134	TAGG	2	8	26542	26549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003134	ACTT	2	8	26551	26558	25 %	50 %	0 %	25 %	16082806
85	NC_003134	GTGC	2	8	26871	26878	0 %	25 %	50 %	25 %	16082806
86	NC_003134	CCGA	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	16082807
87	NC_003134	CGCA	2	8	28227	28234	25 %	0 %	25 %	50 %	16082807
88	NC_003134	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	16082808
89	NC_003134	ACTC	2	8	29222	29229	25 %	25 %	0 %	50 %	16082809
90	NC_003134	CGGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	50 %	25 %	16082809
91	NC_003134	TGTC	2	8	29810	29817	0 %	50 %	25 %	25 %	16082809
92	NC_003134	GCGG	2	8	30189	30196	0 %	0 %	75 %	25 %	40787863
93	NC_003134	CAGC	2	8	30712	30719	25 %	0 %	25 %	50 %	16082812
94	NC_003134	GCAA	2	8	30795	30802	50 %	0 %	25 %	25 %	16082812
95	NC_003134	CCAG	2	8	31173	31180	25 %	0 %	25 %	50 %	16082812
96	NC_003134	CTCG	2	8	31548	31555	0 %	25 %	25 %	50 %	16082813
97	NC_003134	TACT	3	12	32082	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003134	CTCG	2	8	32568	32575	0 %	25 %	25 %	50 %	16082814
99	NC_003134	AATC	2	8	32610	32617	50 %	25 %	0 %	25 %	16082814
100	NC_003134	AATA	2	8	33575	33582	75 %	25 %	0 %	0 %	16082814
101	NC_003134	CATC	2	8	34225	34232	25 %	25 %	0 %	50 %	16082816
102	NC_003134	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003134	ATAA	3	12	35265	35276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003134	AGCA	2	8	35559	35566	50 %	0 %	25 %	25 %	16082818
105	NC_003134	CCAA	2	8	35822	35829	50 %	0 %	0 %	50 %	16082818
106	NC_003134	AATC	2	8	35832	35839	50 %	25 %	0 %	25 %	16082818
107	NC_003134	TAAT	2	8	35962	35969	50 %	50 %	0 %	0 %	16082818
108	NC_003134	AAAG	2	8	36884	36891	75 %	0 %	25 %	0 %	40787864
109	NC_003134	GCCA	2	8	36921	36928	25 %	0 %	25 %	50 %	40787864
110	NC_003134	GGTG	2	8	37533	37540	0 %	25 %	75 %	0 %	40787865
111	NC_003134	TTAC	2	8	38084	38091	25 %	50 %	0 %	25 %	40787866
112	NC_003134	ACCT	2	8	38730	38737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_003134	TTGC	2	8	38874	38881	0 %	50 %	25 %	25 %	16082823
114	NC_003134	CTTC	2	8	38933	38940	0 %	50 %	0 %	50 %	16082823
115	NC_003134	CACG	2	8	39009	39016	25 %	0 %	25 %	50 %	16082823
116	NC_003134	ATCA	2	8	39468	39475	50 %	25 %	0 %	25 %	16082824
117	NC_003134	GCGT	2	8	39690	39697	0 %	25 %	50 %	25 %	16082824
118	NC_003134	TGCG	2	8	40054	40061	0 %	25 %	50 %	25 %	16082824
119	NC_003134	CGAG	2	8	41047	41054	25 %	0 %	50 %	25 %	16082825
120	NC_003134	AGCG	2	8	41222	41229	25 %	0 %	50 %	25 %	16082825
121	NC_003134	GCCA	2	8	41266	41273	25 %	0 %	25 %	50 %	16082825
122	NC_003134	TGCG	2	8	41412	41419	0 %	25 %	50 %	25 %	16082825
123	NC_003134	AGCC	2	8	42607	42614	25 %	0 %	25 %	50 %	16082827
124	NC_003134	TAAG	2	8	43417	43424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003134	CCTG	2	8	43847	43854	0 %	25 %	25 %	50 %	16082828
126	NC_003134	GAAA	2	8	44315	44322	75 %	0 %	25 %	0 %	16082828
127	NC_003134	CAAG	2	8	44717	44724	50 %	0 %	25 %	25 %	16082828
128	NC_003134	TCGT	2	8	44960	44967	0 %	50 %	25 %	25 %	16082829
129	NC_003134	TGTT	2	8	45660	45667	0 %	75 %	25 %	0 %	16082830
130	NC_003134	GCGT	2	8	45724	45731	0 %	25 %	50 %	25 %	16082830
131	NC_003134	GTTT	2	8	46139	46146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003134	ACCA	2	8	46364	46371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_003134	AATG	2	8	47688	47695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003134	TGAA	2	8	47953	47960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003134	TGGT	2	8	48108	48115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003134	CAAC	2	8	48333	48340	50 %	0 %	0 %	50 %	16082832
137	NC_003134	TTAT	2	8	49184	49191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003134	CTGG	2	8	49763	49770	0 %	25 %	50 %	25 %	16082837
139	NC_003134	TCAT	2	8	49989	49996	25 %	50 %	0 %	25 %	16082837
140	NC_003134	CCCA	2	8	50459	50466	25 %	0 %	0 %	75 %	16082838
141	NC_003134	TACC	2	8	50487	50494	25 %	25 %	0 %	50 %	16082838
142	NC_003134	TTAC	2	8	50976	50983	25 %	50 %	0 %	25 %	16082838
143	NC_003134	TGAG	2	8	51000	51007	25 %	25 %	50 %	0 %	16082839
144	NC_003134	AGTA	2	8	51216	51223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003134	TCGC	2	8	51306	51313	0 %	25 %	25 %	50 %	16082840
146	NC_003134	AACA	2	8	52640	52647	75 %	0 %	0 %	25 %	16082842
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199	NC_003134	ATTG	2	8	75793	75800	25 %	50 %	25 %	0 %	40787870
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249	NC_003134	TGAA	2	8	94473	94480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.