MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003134	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003134	CTAC	3	12	2009	2020	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_003134	CCAA	2	8	2710	2717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_003134	AAAG	2	8	5889	5896	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003134	TTAC	2	8	23171	23178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003134	TAGG	2	8	26542	26549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003134	TACT	3	12	32082	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003134	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003134	ATAA	3	12	35265	35276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003134	ACCT	2	8	38730	38737	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003134	TAAG	2	8	43417	43424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003134	GTTT	2	8	46139	46146	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003134	ACCA	2	8	46364	46371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_003134	AATG	2	8	47688	47695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003134	TGAA	2	8	47953	47960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003134	TGGT	2	8	48108	48115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003134	TTAT	2	8	49184	49191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003134	AGTA	2	8	51216	51223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003134	CGAG	2	8	54721	54728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003134	TACT	2	8	54745	54752	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003134	GAAA	2	8	55243	55250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003134	GAAG	2	8	55269	55276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003134	CGTT	2	8	59210	59217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003134	GGCA	2	8	62216	62223	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003134	AGCG	2	8	62928	62935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003134	ATGA	2	8	65632	65639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003134	CATT	2	8	66194	66201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003134	GCCT	2	8	67803	67810	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003134	CAAA	2	8	67917	67924	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003134	TACA	2	8	70220	70227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003134	TATG	2	8	73538	73545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003134	AGTA	2	8	76226	76233	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003134	TATT	2	8	77815	77822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003134	TCTG	2	8	78069	78076	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_003134	GGTT	2	8	81066	81073	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003134	CAGC	2	8	81102	81109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003134	GGCT	2	8	81184	81191	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003134	TAAA	2	8	82421	82428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003134	CCCT	2	8	86920	86927	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_003134	TTTC	2	8	86937	86944	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003134	AGTG	2	8	87210	87217	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003134	GATT	2	8	87589	87596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003134	ATCA	2	8	88107	88114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003134	CATC	2	8	88231	88238	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_003134	TTTC	2	8	88790	88797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003134	CCTA	2	8	89190	89197	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_003134	TTAC	2	8	91683	91690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003134	ACGA	2	8	91726	91733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_003134	CGCC	2	8	93394	93401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_003134	AGCG	2	8	93760	93767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003134	GCTG	2	8	94102	94109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_003134	TGAA	2	8	94473	94480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003134	GCGT	2	8	95971	95978	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.