MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 154

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003134	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	16082782
2	NC_003134	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	16082782
3	NC_003134	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	16082782
4	NC_003134	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003134	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	16082784
6	NC_003134	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	16082784
7	NC_003134	AT	3	6	2752	2757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003134	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	40787862
9	NC_003134	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	40787862
10	NC_003134	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	40787862
11	NC_003134	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	40787862
12	NC_003134	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	40787862
13	NC_003134	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	40787862
14	NC_003134	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	16082787
15	NC_003134	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	16082788
16	NC_003134	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	16082788
17	NC_003134	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	16082788
18	NC_003134	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	16082788
19	NC_003134	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	16082788
20	NC_003134	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	16082788
21	NC_003134	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	16082788
22	NC_003134	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	16082790
23	NC_003134	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	16082791
24	NC_003134	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	16082792
25	NC_003134	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	16082793
26	NC_003134	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	16082793
27	NC_003134	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	16082793
28	NC_003134	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	16082793
29	NC_003134	AG	3	6	18991	18996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003134	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	16082796
31	NC_003134	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	16082796
32	NC_003134	TA	3	6	19833	19838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003134	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	16082798
34	NC_003134	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	16082803
35	NC_003134	AT	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	16082805
36	NC_003134	AG	3	6	25265	25270	50 %	0 %	50 %	0 %	16082805
37	NC_003134	CG	4	8	25977	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	16082805
38	NC_003134	GC	4	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	16082805
39	NC_003134	AT	3	6	26847	26852	50 %	50 %	0 %	0 %	16082806
40	NC_003134	CA	3	6	26955	26960	50 %	0 %	0 %	50 %	16082806
41	NC_003134	CG	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	16082806
42	NC_003134	CA	3	6	27723	27728	50 %	0 %	0 %	50 %	16082806
43	NC_003134	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	16082807
44	NC_003134	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003134	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003134	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003134	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	16082814
48	NC_003134	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	16082814
49	NC_003134	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	16082816
50	NC_003134	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	16082817
51	NC_003134	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	16082817
52	NC_003134	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003134	GC	3	6	36192	36197	0 %	0 %	50 %	50 %	16082819
54	NC_003134	TG	3	6	36424	36429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003134	CT	3	6	36839	36844	0 %	50 %	0 %	50 %	40787864
56	NC_003134	CA	3	6	38366	38371	50 %	0 %	0 %	50 %	40787866
57	NC_003134	AG	3	6	40301	40306	50 %	0 %	50 %	0 %	16082825
58	NC_003134	TG	3	6	40521	40526	0 %	50 %	50 %	0 %	16082825
59	NC_003134	GT	3	6	41619	41624	0 %	50 %	50 %	0 %	16082825
60	NC_003134	AG	3	6	42963	42968	50 %	0 %	50 %	0 %	16082827
61	NC_003134	AC	3	6	43915	43920	50 %	0 %	0 %	50 %	16082828
62	NC_003134	TC	4	8	44880	44887	0 %	50 %	0 %	50 %	16082829
63	NC_003134	AG	3	6	45863	45868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003134	AG	3	6	45972	45977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003134	CT	3	6	46008	46013	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_003134	AT	3	6	46111	46116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003134	CA	3	6	46151	46156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_003134	AG	3	6	46334	46339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003134	AG	3	6	46376	46381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003134	AG	3	6	47564	47569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003134	CT	3	6	47766	47771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_003134	CT	3	6	47971	47976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_003134	CG	4	8	48078	48085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_003134	TG	3	6	48609	48614	0 %	50 %	50 %	0 %	16082833
75	NC_003134	TA	3	6	48862	48867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003134	GT	3	6	49370	49375	0 %	50 %	50 %	0 %	16082836
77	NC_003134	TA	3	6	51226	51231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003134	CG	4	8	51784	51791	0 %	0 %	50 %	50 %	16082840
79	NC_003134	AG	3	6	51896	51901	50 %	0 %	50 %	0 %	16082840
80	NC_003134	CG	3	6	53030	53035	0 %	0 %	50 %	50 %	16082842
81	NC_003134	GA	3	6	53203	53208	50 %	0 %	50 %	0 %	16082842
82	NC_003134	GT	4	8	53821	53828	0 %	50 %	50 %	0 %	16082843
83	NC_003134	CA	3	6	54391	54396	50 %	0 %	0 %	50 %	16082843
84	NC_003134	GA	3	6	54858	54863	50 %	0 %	50 %	0 %	16082844
85	NC_003134	TA	3	6	55224	55229	50 %	50 %	0 %	0 %	16082844
86	NC_003134	CT	3	6	55770	55775	0 %	50 %	0 %	50 %	16082845
87	NC_003134	CA	3	6	56178	56183	50 %	0 %	0 %	50 %	16082845
88	NC_003134	GA	3	6	58480	58485	50 %	0 %	50 %	0 %	16082848
89	NC_003134	CG	3	6	58594	58599	0 %	0 %	50 %	50 %	16082848
90	NC_003134	GA	4	8	58821	58828	50 %	0 %	50 %	0 %	16082848
91	NC_003134	CA	3	6	59235	59240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_003134	GC	3	6	60861	60866	0 %	0 %	50 %	50 %	16082849
93	NC_003134	CG	3	6	61806	61811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_003134	GC	3	6	62241	62246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_003134	CG	3	6	63520	63525	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
96	NC_003134	GC	3	6	63548	63553	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
97	NC_003134	CG	3	6	63919	63924	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
98	NC_003134	CA	3	6	64609	64614	50 %	0 %	0 %	50 %	16082854
99	NC_003134	GC	3	6	64718	64723	0 %	0 %	50 %	50 %	16082855
100	NC_003134	TG	3	6	64865	64870	0 %	50 %	50 %	0 %	16082855
101	NC_003134	GC	3	6	65748	65753	0 %	0 %	50 %	50 %	16082856
102	NC_003134	AT	3	6	66173	66178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003134	TG	3	6	67400	67405	0 %	50 %	50 %	0 %	16082857
104	NC_003134	TC	3	6	68142	68147	0 %	50 %	0 %	50 %	16082858
105	NC_003134	GA	4	8	68440	68447	50 %	0 %	50 %	0 %	16082858
106	NC_003134	CG	3	6	68746	68751	0 %	0 %	50 %	50 %	16082858
107	NC_003134	AT	3	6	68975	68980	50 %	50 %	0 %	0 %	16082859
108	NC_003134	AT	4	8	69880	69887	50 %	50 %	0 %	0 %	16082859
109	NC_003134	AT	3	6	70190	70195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003134	CA	3	6	70226	70231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_003134	TC	3	6	72513	72518	0 %	50 %	0 %	50 %	16082863
112	NC_003134	TA	3	6	73476	73481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003134	TC	3	6	73960	73965	0 %	50 %	0 %	50 %	16082865
114	NC_003134	TA	3	6	74513	74518	50 %	50 %	0 %	0 %	40787870
115	NC_003134	AT	3	6	74649	74654	50 %	50 %	0 %	0 %	40787870
116	NC_003134	CA	3	6	75008	75013	50 %	0 %	0 %	50 %	40787870
117	NC_003134	AG	3	6	76692	76697	50 %	0 %	50 %	0 %	16082867
118	NC_003134	GA	3	6	78098	78103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003134	CG	3	6	78161	78166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_003134	AC	3	6	79440	79445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003134	TG	3	6	80681	80686	0 %	50 %	50 %	0 %	16082872
122	NC_003134	AT	3	6	81541	81546	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
123	NC_003134	TC	3	6	81832	81837	0 %	50 %	0 %	50 %	16082873
124	NC_003134	AT	3	6	82076	82081	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
125	NC_003134	AT	3	6	82199	82204	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
126	NC_003134	TG	3	6	82409	82414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003134	AG	3	6	82908	82913	50 %	0 %	50 %	0 %	16082874
128	NC_003134	AT	3	6	82958	82963	50 %	50 %	0 %	0 %	16082874
129	NC_003134	TG	3	6	83390	83395	0 %	50 %	50 %	0 %	16082875
130	NC_003134	GA	3	6	83474	83479	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
131	NC_003134	AC	3	6	84362	84367	50 %	0 %	0 %	50 %	16082875
132	NC_003134	GT	3	6	85133	85138	0 %	50 %	50 %	0 %	16082875
133	NC_003134	AG	3	6	85477	85482	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
134	NC_003134	GA	3	6	85767	85772	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
135	NC_003134	CT	3	6	85902	85907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_003134	AT	3	6	85946	85951	50 %	50 %	0 %	0 %	16082876
137	NC_003134	TC	3	6	86305	86310	0 %	50 %	0 %	50 %	16082876
138	NC_003134	AG	3	6	86666	86671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003134	CG	3	6	87658	87663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_003134	GA	3	6	88572	88577	50 %	0 %	50 %	0 %	16082878
141	NC_003134	AC	3	6	89247	89252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_003134	GA	3	6	89573	89578	50 %	0 %	50 %	0 %	16082880
143	NC_003134	CA	3	6	89680	89685	50 %	0 %	0 %	50 %	16082880
144	NC_003134	AT	3	6	91702	91707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003134	TA	3	6	91709	91714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003134	TC	3	6	91950	91955	0 %	50 %	0 %	50 %	16082881
147	NC_003134	AC	3	6	92160	92165	50 %	0 %	0 %	50 %	16082881
148	NC_003134	GT	3	6	92508	92513	0 %	50 %	50 %	0 %	16082881
149	NC_003134	CT	3	6	93012	93017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_003134	GA	3	6	93247	93252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003134	AG	3	6	93415	93420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_003134	AG	3	6	94927	94932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.