MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 109

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003134	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	16082782
2	NC_003134	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	16082782
3	NC_003134	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	16082782
4	NC_003134	GA	3	6	2327	2332	50 %	0 %	50 %	0 %	16082784
5	NC_003134	AT	3	6	2557	2562	50 %	50 %	0 %	0 %	16082784
6	NC_003134	TG	3	6	3012	3017	0 %	50 %	50 %	0 %	40787862
7	NC_003134	TG	3	6	3194	3199	0 %	50 %	50 %	0 %	40787862
8	NC_003134	AC	3	6	3534	3539	50 %	0 %	0 %	50 %	40787862
9	NC_003134	AC	3	6	3570	3575	50 %	0 %	0 %	50 %	40787862
10	NC_003134	AT	3	6	3693	3698	50 %	50 %	0 %	0 %	40787862
11	NC_003134	GC	3	6	5333	5338	0 %	0 %	50 %	50 %	40787862
12	NC_003134	CA	3	6	5960	5965	50 %	0 %	0 %	50 %	16082787
13	NC_003134	TC	3	6	6684	6689	0 %	50 %	0 %	50 %	16082788
14	NC_003134	AT	3	6	6695	6700	50 %	50 %	0 %	0 %	16082788
15	NC_003134	CG	3	6	7422	7427	0 %	0 %	50 %	50 %	16082788
16	NC_003134	CT	3	6	8538	8543	0 %	50 %	0 %	50 %	16082788
17	NC_003134	CG	3	6	8726	8731	0 %	0 %	50 %	50 %	16082788
18	NC_003134	AG	3	6	8922	8927	50 %	0 %	50 %	0 %	16082788
19	NC_003134	TG	3	6	10328	10333	0 %	50 %	50 %	0 %	16082788
20	NC_003134	GT	3	6	11822	11827	0 %	50 %	50 %	0 %	16082790
21	NC_003134	AC	3	6	13102	13107	50 %	0 %	0 %	50 %	16082791
22	NC_003134	CG	3	6	13474	13479	0 %	0 %	50 %	50 %	16082792
23	NC_003134	GA	3	6	15222	15227	50 %	0 %	50 %	0 %	16082793
24	NC_003134	AG	3	6	15472	15477	50 %	0 %	50 %	0 %	16082793
25	NC_003134	GA	3	6	16905	16910	50 %	0 %	50 %	0 %	16082793
26	NC_003134	AC	3	6	17588	17593	50 %	0 %	0 %	50 %	16082793
27	NC_003134	CA	3	6	19176	19181	50 %	0 %	0 %	50 %	16082796
28	NC_003134	GA	3	6	19264	19269	50 %	0 %	50 %	0 %	16082796
29	NC_003134	CT	3	6	20314	20319	0 %	50 %	0 %	50 %	16082798
30	NC_003134	AG	3	6	23243	23248	50 %	0 %	50 %	0 %	16082803
31	NC_003134	AT	3	6	25014	25019	50 %	50 %	0 %	0 %	16082805
32	NC_003134	AG	3	6	25265	25270	50 %	0 %	50 %	0 %	16082805
33	NC_003134	CG	4	8	25977	25984	0 %	0 %	50 %	50 %	16082805
34	NC_003134	GC	4	8	26072	26079	0 %	0 %	50 %	50 %	16082805
35	NC_003134	AT	3	6	26847	26852	50 %	50 %	0 %	0 %	16082806
36	NC_003134	CA	3	6	26955	26960	50 %	0 %	0 %	50 %	16082806
37	NC_003134	CG	3	6	27670	27675	0 %	0 %	50 %	50 %	16082806
38	NC_003134	CA	3	6	27723	27728	50 %	0 %	0 %	50 %	16082806
39	NC_003134	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	16082807
40	NC_003134	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	16082814
41	NC_003134	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	16082814
42	NC_003134	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	16082816
43	NC_003134	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	16082817
44	NC_003134	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	16082817
45	NC_003134	GC	3	6	36192	36197	0 %	0 %	50 %	50 %	16082819
46	NC_003134	CT	3	6	36839	36844	0 %	50 %	0 %	50 %	40787864
47	NC_003134	CA	3	6	38366	38371	50 %	0 %	0 %	50 %	40787866
48	NC_003134	AG	3	6	40301	40306	50 %	0 %	50 %	0 %	16082825
49	NC_003134	TG	3	6	40521	40526	0 %	50 %	50 %	0 %	16082825
50	NC_003134	GT	3	6	41619	41624	0 %	50 %	50 %	0 %	16082825
51	NC_003134	AG	3	6	42963	42968	50 %	0 %	50 %	0 %	16082827
52	NC_003134	AC	3	6	43915	43920	50 %	0 %	0 %	50 %	16082828
53	NC_003134	TC	4	8	44880	44887	0 %	50 %	0 %	50 %	16082829
54	NC_003134	TG	3	6	48609	48614	0 %	50 %	50 %	0 %	16082833
55	NC_003134	GT	3	6	49370	49375	0 %	50 %	50 %	0 %	16082836
56	NC_003134	CG	4	8	51784	51791	0 %	0 %	50 %	50 %	16082840
57	NC_003134	AG	3	6	51896	51901	50 %	0 %	50 %	0 %	16082840
58	NC_003134	CG	3	6	53030	53035	0 %	0 %	50 %	50 %	16082842
59	NC_003134	GA	3	6	53203	53208	50 %	0 %	50 %	0 %	16082842
60	NC_003134	GT	4	8	53821	53828	0 %	50 %	50 %	0 %	16082843
61	NC_003134	CA	3	6	54391	54396	50 %	0 %	0 %	50 %	16082843
62	NC_003134	GA	3	6	54858	54863	50 %	0 %	50 %	0 %	16082844
63	NC_003134	TA	3	6	55224	55229	50 %	50 %	0 %	0 %	16082844
64	NC_003134	CT	3	6	55770	55775	0 %	50 %	0 %	50 %	16082845
65	NC_003134	CA	3	6	56178	56183	50 %	0 %	0 %	50 %	16082845
66	NC_003134	GA	3	6	58480	58485	50 %	0 %	50 %	0 %	16082848
67	NC_003134	CG	3	6	58594	58599	0 %	0 %	50 %	50 %	16082848
68	NC_003134	GA	4	8	58821	58828	50 %	0 %	50 %	0 %	16082848
69	NC_003134	GC	3	6	60861	60866	0 %	0 %	50 %	50 %	16082849
70	NC_003134	CG	3	6	63520	63525	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
71	NC_003134	GC	3	6	63548	63553	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
72	NC_003134	CG	3	6	63919	63924	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
73	NC_003134	CA	3	6	64609	64614	50 %	0 %	0 %	50 %	16082854
74	NC_003134	GC	3	6	64718	64723	0 %	0 %	50 %	50 %	16082855
75	NC_003134	TG	3	6	64865	64870	0 %	50 %	50 %	0 %	16082855
76	NC_003134	GC	3	6	65748	65753	0 %	0 %	50 %	50 %	16082856
77	NC_003134	TG	3	6	67400	67405	0 %	50 %	50 %	0 %	16082857
78	NC_003134	TC	3	6	68142	68147	0 %	50 %	0 %	50 %	16082858
79	NC_003134	GA	4	8	68440	68447	50 %	0 %	50 %	0 %	16082858
80	NC_003134	CG	3	6	68746	68751	0 %	0 %	50 %	50 %	16082858
81	NC_003134	AT	3	6	68975	68980	50 %	50 %	0 %	0 %	16082859
82	NC_003134	AT	4	8	69880	69887	50 %	50 %	0 %	0 %	16082859
83	NC_003134	TC	3	6	72513	72518	0 %	50 %	0 %	50 %	16082863
84	NC_003134	TC	3	6	73960	73965	0 %	50 %	0 %	50 %	16082865
85	NC_003134	TA	3	6	74513	74518	50 %	50 %	0 %	0 %	40787870
86	NC_003134	AT	3	6	74649	74654	50 %	50 %	0 %	0 %	40787870
87	NC_003134	CA	3	6	75008	75013	50 %	0 %	0 %	50 %	40787870
88	NC_003134	AG	3	6	76692	76697	50 %	0 %	50 %	0 %	16082867
89	NC_003134	TG	3	6	80681	80686	0 %	50 %	50 %	0 %	16082872
90	NC_003134	AT	3	6	81541	81546	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
91	NC_003134	TC	3	6	81832	81837	0 %	50 %	0 %	50 %	16082873
92	NC_003134	AT	3	6	82076	82081	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
93	NC_003134	AT	3	6	82199	82204	50 %	50 %	0 %	0 %	16082873
94	NC_003134	AG	3	6	82908	82913	50 %	0 %	50 %	0 %	16082874
95	NC_003134	AT	3	6	82958	82963	50 %	50 %	0 %	0 %	16082874
96	NC_003134	TG	3	6	83390	83395	0 %	50 %	50 %	0 %	16082875
97	NC_003134	GA	3	6	83474	83479	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
98	NC_003134	AC	3	6	84362	84367	50 %	0 %	0 %	50 %	16082875
99	NC_003134	GT	3	6	85133	85138	0 %	50 %	50 %	0 %	16082875
100	NC_003134	AG	3	6	85477	85482	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
101	NC_003134	GA	3	6	85767	85772	50 %	0 %	50 %	0 %	16082875
102	NC_003134	AT	3	6	85946	85951	50 %	50 %	0 %	0 %	16082876
103	NC_003134	TC	3	6	86305	86310	0 %	50 %	0 %	50 %	16082876
104	NC_003134	GA	3	6	88572	88577	50 %	0 %	50 %	0 %	16082878
105	NC_003134	GA	3	6	89573	89578	50 %	0 %	50 %	0 %	16082880
106	NC_003134	CA	3	6	89680	89685	50 %	0 %	0 %	50 %	16082880
107	NC_003134	TC	3	6	91950	91955	0 %	50 %	0 %	50 %	16082881
108	NC_003134	AC	3	6	92160	92165	50 %	0 %	0 %	50 %	16082881
109	NC_003134	GT	3	6	92508	92513	0 %	50 %	50 %	0 %	16082881

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.