MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 87

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003134	A	6	6	1002	1007	100 %	0 %	0 %	0 %	16082782
2	NC_003134	C	6	6	1599	1604	0 %	0 %	0 %	100 %	40787861
3	NC_003134	A	6	6	2917	2922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003134	C	6	6	5921	5926	0 %	0 %	0 %	100 %	16082787
5	NC_003134	T	6	6	5979	5984	0 %	100 %	0 %	0 %	16082787
6	NC_003134	T	6	6	10614	10619	0 %	100 %	0 %	0 %	16082788
7	NC_003134	C	6	6	11379	11384	0 %	0 %	0 %	100 %	16082789
8	NC_003134	T	6	6	19755	19760	0 %	100 %	0 %	0 %	16082796
9	NC_003134	T	6	6	22613	22618	0 %	100 %	0 %	0 %	16082802
10	NC_003134	T	6	6	25067	25072	0 %	100 %	0 %	0 %	16082805
11	NC_003134	T	6	6	26455	26460	0 %	100 %	0 %	0 %	16082805
12	NC_003134	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	16082812
13	NC_003134	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	16082813
14	NC_003134	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	16082814
15	NC_003134	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	16082817
16	NC_003134	T	7	7	35182	35188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003134	A	6	6	35199	35204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003134	A	6	6	35335	35340	100 %	0 %	0 %	0 %	16082818
19	NC_003134	A	6	6	35779	35784	100 %	0 %	0 %	0 %	16082818
20	NC_003134	T	6	6	36030	36035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003134	T	6	6	36302	36307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003134	T	6	6	36350	36355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003134	A	6	6	36455	36460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003134	A	6	6	37952	37957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003134	A	6	6	38686	38691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003134	T	6	6	39320	39325	0 %	100 %	0 %	0 %	16082823
27	NC_003134	T	7	7	41753	41759	0 %	100 %	0 %	0 %	16082825
28	NC_003134	T	7	7	43671	43677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003134	G	7	7	43835	43841	0 %	0 %	100 %	0 %	16082828
30	NC_003134	A	6	6	43886	43891	100 %	0 %	0 %	0 %	16082828
31	NC_003134	A	6	6	44609	44614	100 %	0 %	0 %	0 %	16082828
32	NC_003134	T	6	6	48296	48301	0 %	100 %	0 %	0 %	16082832
33	NC_003134	T	6	6	49629	49634	0 %	100 %	0 %	0 %	16082836
34	NC_003134	T	6	6	49639	49644	0 %	100 %	0 %	0 %	16082837
35	NC_003134	A	6	6	50104	50109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003134	T	6	6	55176	55181	0 %	100 %	0 %	0 %	16082844
37	NC_003134	A	6	6	55664	55669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003134	A	6	6	56308	56313	100 %	0 %	0 %	0 %	16082845
39	NC_003134	G	6	6	57617	57622	0 %	0 %	100 %	0 %	16082847
40	NC_003134	T	6	6	58214	58219	0 %	100 %	0 %	0 %	16082848
41	NC_003134	T	7	7	61213	61219	0 %	100 %	0 %	0 %	16082849
42	NC_003134	T	6	6	61229	61234	0 %	100 %	0 %	0 %	16082849
43	NC_003134	A	6	6	62790	62795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003134	T	6	6	64024	64029	0 %	100 %	0 %	0 %	40787868
45	NC_003134	T	6	6	65158	65163	0 %	100 %	0 %	0 %	16082855
46	NC_003134	A	6	6	67957	67962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003134	A	6	6	70231	70236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003134	A	8	8	70490	70497	100 %	0 %	0 %	0 %	16082860
49	NC_003134	A	6	6	71211	71216	100 %	0 %	0 %	0 %	16082862
50	NC_003134	A	6	6	71272	71277	100 %	0 %	0 %	0 %	16082862
51	NC_003134	A	7	7	73372	73378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003134	T	6	6	73395	73400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003134	A	6	6	73588	73593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003134	T	6	6	73609	73614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003134	T	8	8	73830	73837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003134	C	6	6	74532	74537	0 %	0 %	0 %	100 %	40787870
57	NC_003134	A	7	7	74723	74729	100 %	0 %	0 %	0 %	40787870
58	NC_003134	A	6	6	74886	74891	100 %	0 %	0 %	0 %	40787870
59	NC_003134	A	7	7	75187	75193	100 %	0 %	0 %	0 %	40787870
60	NC_003134	A	6	6	75386	75391	100 %	0 %	0 %	0 %	40787870
61	NC_003134	A	6	6	75487	75492	100 %	0 %	0 %	0 %	40787870
62	NC_003134	A	9	9	75542	75550	100 %	0 %	0 %	0 %	40787870
63	NC_003134	T	6	6	79402	79407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003134	T	6	6	79557	79562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003134	T	7	7	79632	79638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003134	A	7	7	79657	79663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003134	A	6	6	79734	79739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003134	T	7	7	79861	79867	0 %	100 %	0 %	0 %	16082872
69	NC_003134	T	6	6	81224	81229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003134	A	6	6	81590	81595	100 %	0 %	0 %	0 %	16082873
71	NC_003134	A	6	6	81993	81998	100 %	0 %	0 %	0 %	16082873
72	NC_003134	G	6	6	83125	83130	0 %	0 %	100 %	0 %	16082874
73	NC_003134	G	6	6	84289	84294	0 %	0 %	100 %	0 %	16082875
74	NC_003134	G	6	6	84411	84416	0 %	0 %	100 %	0 %	16082875
75	NC_003134	A	8	8	84626	84633	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
76	NC_003134	A	6	6	84879	84884	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
77	NC_003134	T	7	7	84936	84942	0 %	100 %	0 %	0 %	16082875
78	NC_003134	A	6	6	85004	85009	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
79	NC_003134	A	6	6	85352	85357	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
80	NC_003134	A	6	6	85738	85743	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
81	NC_003134	A	6	6	85811	85816	100 %	0 %	0 %	0 %	16082875
82	NC_003134	A	7	7	85953	85959	100 %	0 %	0 %	0 %	16082876
83	NC_003134	T	7	7	86757	86763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003134	T	6	6	86884	86889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003134	T	7	7	87032	87038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003134	T	6	6	88403	88408	0 %	100 %	0 %	0 %	16082878
87	NC_003134	A	7	7	91421	91427	100 %	0 %	0 %	0 %	16082880

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.