MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pPCP1

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003132	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003132	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	16082680
3	NC_003132	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	16082680
4	NC_003132	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	16082680
5	NC_003132	CTCA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	0 %	50 %	16082681
6	NC_003132	TCAG	2	8	1641	1648	25 %	25 %	25 %	25 %	16082681
7	NC_003132	CAGA	2	8	1840	1847	50 %	0 %	25 %	25 %	16082681
8	NC_003132	TCAG	2	8	2544	2551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_003132	ACAG	2	8	2559	2566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003132	AACA	2	8	2928	2935	75 %	0 %	0 %	25 %	16082682
11	NC_003132	CTCA	2	8	3425	3432	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003132	TGTA	2	8	4218	4225	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003132	ATTT	2	8	4322	4329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003132	CTGT	2	8	4632	4639	0 %	50 %	25 %	25 %	16082683
15	NC_003132	GAAA	2	8	4732	4739	75 %	0 %	25 %	0 %	16082683
16	NC_003132	TCTT	2	8	5506	5513	0 %	75 %	0 %	25 %	16082684
17	NC_003132	ATGA	2	8	6986	6993	50 %	25 %	25 %	0 %	16082686
18	NC_003132	AATC	2	8	6995	7002	50 %	25 %	0 %	25 %	16082686
19	NC_003132	TACA	2	8	7459	7466	50 %	25 %	0 %	25 %	16082686
20	NC_003132	TCCT	2	8	7810	7817	0 %	50 %	0 %	50 %	16082687
21	NC_003132	ACAG	2	8	8571	8578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003132	ACGA	2	8	8668	8675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003132	TGCC	2	8	8678	8685	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_003132	CTGT	2	8	8951	8958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_003132	ACAA	2	8	9208	9215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003132	TAAT	2	8	9265	9272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.