MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	CAGGAG	2	12	409	420	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082692
2	NC_003131	ATCTAT	2	12	4426	4437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082698
3	NC_003131	GATGTC	2	12	7953	7964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16082703
4	NC_003131	TTTCCA	2	12	9973	9984	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16082706
5	NC_003131	TACATT	2	12	13661	13672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082710
6	NC_003131	ATTTTT	2	12	18458	18469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003131	TTAAAC	2	12	20227	20238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16082717
8	NC_003131	TTATTT	2	12	23228	23239	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003131	CAAGAT	2	12	24582	24593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082722
10	NC_003131	AATTAC	2	12	28016	28027	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_003131	TGAGCG	2	12	29798	29809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082729
12	NC_003131	GAAGAT	2	12	29883	29894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16082729
13	NC_003131	CAAGAA	2	12	29925	29936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16082729
14	NC_003131	TAGAAC	2	12	31047	31058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082730
15	NC_003131	TTGGTT	2	12	36002	36013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003131	TAACGT	2	12	37503	37514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082739
17	NC_003131	GTTACT	2	12	37796	37807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082740
18	NC_003131	TTATGT	2	12	37853	37864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16082740
19	NC_003131	TTTTGC	2	12	43163	43174	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16082747
20	NC_003131	GGTTAT	2	12	45256	45267	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003131	AATTGA	2	12	46289	46300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003131	TGAATG	2	12	48118	48129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082755
23	NC_003131	AGGCAC	2	12	49098	49109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_003131	AAGATT	2	12	50853	50864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082759
25	NC_003131	CCGGTT	2	12	55470	55481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003131	CCAATC	2	12	55494	55505	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_003131	TTTCCA	2	12	59016	59027	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003131	TGGAAA	2	12	60166	60177	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003131	CAATTG	2	12	61245	61256	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.