MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	CAGGAG	2	12	409	420	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16082692
2	NC_003131	ATCTAT	2	12	4426	4437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082698
3	NC_003131	GATGTC	2	12	7953	7964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16082703
4	NC_003131	TTTCCA	2	12	9973	9984	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	16082706
5	NC_003131	TACATT	2	12	13661	13672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	16082710
6	NC_003131	TTAAAC	2	12	20227	20238	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	16082717
7	NC_003131	CAAGAT	2	12	24582	24593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082722
8	NC_003131	TGAGCG	2	12	29798	29809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16082729
9	NC_003131	GAAGAT	2	12	29883	29894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16082729
10	NC_003131	CAAGAA	2	12	29925	29936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	16082729
11	NC_003131	TAGAAC	2	12	31047	31058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16082730
12	NC_003131	TAACGT	2	12	37503	37514	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16082739
13	NC_003131	GTTACT	2	12	37796	37807	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16082740
14	NC_003131	TTATGT	2	12	37853	37864	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	16082740
15	NC_003131	TTTTGC	2	12	43163	43174	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16082747
16	NC_003131	TGAATG	2	12	48118	48129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082755
17	NC_003131	AAGATT	2	12	50853	50864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16082759

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.