MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	GTTCG	2	10	427	436	0 %	40 %	40 %	20 %	16082692
2	NC_003131	AAGGT	2	10	776	785	40 %	20 %	40 %	0 %	16082692
3	NC_003131	AGCGC	2	10	1176	1185	20 %	0 %	40 %	40 %	16082693
4	NC_003131	TCAAA	2	10	1814	1823	60 %	20 %	0 %	20 %	16082693
5	NC_003131	CAGCC	2	10	6543	6552	20 %	0 %	20 %	60 %	16082702
6	NC_003131	TTTGG	2	10	8019	8028	0 %	60 %	40 %	0 %	16082703
7	NC_003131	GCTTG	2	10	13622	13631	0 %	40 %	40 %	20 %	16082710
8	NC_003131	GATGC	2	10	20948	20957	20 %	20 %	40 %	20 %	16082717
9	NC_003131	GCCGC	2	10	21191	21200	0 %	0 %	40 %	60 %	16082717
10	NC_003131	CCATC	2	10	25071	25080	20 %	20 %	0 %	60 %	16082722
11	NC_003131	GCATC	2	10	25344	25353	20 %	20 %	20 %	40 %	16082722
12	NC_003131	TTCAC	2	10	32924	32933	20 %	40 %	0 %	40 %	16082733
13	NC_003131	TTGTT	2	10	33233	33242	0 %	80 %	20 %	0 %	16082734
14	NC_003131	GCAGA	2	10	34133	34142	40 %	0 %	40 %	20 %	16082735
15	NC_003131	TTTCT	2	10	35618	35627	0 %	80 %	0 %	20 %	16082736
16	NC_003131	CCAAG	2	10	36886	36895	40 %	0 %	20 %	40 %	16082737
17	NC_003131	TTTGG	2	10	38021	38030	0 %	60 %	40 %	0 %	16082740
18	NC_003131	CGTCT	2	10	38077	38086	0 %	40 %	20 %	40 %	16082740
19	NC_003131	CTGAA	2	10	38920	38929	40 %	20 %	20 %	20 %	16082740
20	NC_003131	GTACG	2	10	39238	39247	20 %	20 %	40 %	20 %	16082740
21	NC_003131	CATTC	2	10	40189	40198	20 %	40 %	0 %	40 %	16082741
22	NC_003131	AAAGT	2	10	40398	40407	60 %	20 %	20 %	0 %	16082741
23	NC_003131	ATTGC	2	10	41367	41376	20 %	40 %	20 %	20 %	16082744
24	NC_003131	GAATG	2	10	41608	41617	40 %	20 %	40 %	0 %	16082744
25	NC_003131	TGGAT	2	10	52563	52572	20 %	40 %	40 %	0 %	16082760
26	NC_003131	GCCAT	2	10	53073	53082	20 %	20 %	20 %	40 %	16082760
27	NC_003131	TGGCT	2	10	53336	53345	0 %	40 %	40 %	20 %	16082760
28	NC_003131	AGCGC	2	10	56782	56791	20 %	0 %	40 %	40 %	16082764
29	NC_003131	GCTAA	2	10	65726	65735	40 %	20 %	20 %	20 %	16082774
30	NC_003131	ACCTT	2	10	69865	69874	20 %	40 %	0 %	40 %	16082780

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.