MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	AACG	2	8	5	12	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_003131	CTGG	2	8	2068	2075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003131	GTTC	2	8	2107	2114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_003131	GTCA	2	8	2799	2806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003131	AGCC	2	8	4990	4997	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_003131	GGAT	2	8	5503	5510	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003131	AGAT	2	8	5565	5572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003131	TAAA	2	8	6146	6153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003131	CTTT	2	8	8562	8569	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_003131	TCAG	2	8	8674	8681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003131	CCCT	2	8	9366	9373	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_003131	CCGG	2	8	10379	10386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003131	TGTT	2	8	10447	10454	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003131	CGAC	2	8	11277	11284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_003131	ATAA	2	8	15236	15243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003131	TTAT	2	8	15404	15411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003131	AATG	2	8	16185	16192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003131	ATTT	2	8	16252	16259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003131	CAAA	2	8	17612	17619	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003131	ACAT	2	8	17621	17628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003131	TTAT	2	8	17676	17683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003131	ATAA	2	8	17731	17738	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003131	CATT	2	8	18500	18507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_003131	TTAA	2	8	19266	19273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003131	TGTT	2	8	35351	35358	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003131	GAAA	2	8	35396	35403	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003131	AGGG	2	8	35579	35586	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003131	CGCA	2	8	36036	36043	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_003131	TTAT	2	8	37278	37285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003131	ATAA	2	8	44637	44644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003131	TACA	2	8	46624	46631	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_003131	GACG	2	8	46760	46767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_003131	TTAT	2	8	46783	46790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003131	TTTA	2	8	47092	47099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003131	AATA	2	8	47108	47115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003131	TTAA	2	8	48539	48546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003131	GCTG	2	8	48852	48859	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_003131	CGGA	2	8	49018	49025	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003131	GGTC	2	8	49241	49248	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003131	CAGA	2	8	49326	49333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_003131	GGGA	2	8	49647	49654	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003131	CTTT	2	8	49976	49983	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_003131	CAGG	2	8	50119	50126	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003131	AGAA	2	8	50161	50168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003131	CCCT	2	8	54667	54674	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_003131	GGGC	2	8	55917	55924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003131	TTAT	3	12	55963	55974	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003131	GCCA	2	8	57388	57395	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003131	CACT	2	8	57424	57431	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_003131	CAGT	2	8	57874	57881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003131	ATCC	2	8	58101	58108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_003131	GCCA	2	8	58746	58753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003131	CTGC	2	8	58995	59002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003131	TGAC	2	8	59726	59733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003131	GCAG	2	8	60191	60198	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003131	TTAC	2	8	60881	60888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003131	TTTC	2	8	61113	61120	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003131	CTTA	2	8	61441	61448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003131	CCTC	2	8	62302	62309	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_003131	CCTG	2	8	65176	65183	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_003131	ATAA	2	8	66370	66377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003131	ACAA	2	8	66836	66843	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_003131	GGGA	2	8	68053	68060	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.