MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 918

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	GCC	2	6	216	221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082692
2	NC_003131	CGC	2	6	230	235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082692
3	NC_003131	CTG	2	6	239	244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082692
4	NC_003131	GAC	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082692
5	NC_003131	CTT	2	6	606	611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082692
6	NC_003131	TGG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082692
7	NC_003131	AGC	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082692
8	NC_003131	TGA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082692
9	NC_003131	CAT	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082692
10	NC_003131	TGA	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082692
11	NC_003131	GAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082693
12	NC_003131	TCA	2	6	1271	1276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082693
13	NC_003131	CGG	2	6	1315	1320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082693
14	NC_003131	CAG	3	9	1519	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082693
15	NC_003131	ACG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082693
16	NC_003131	TCA	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082693
17	NC_003131	TGA	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082693
18	NC_003131	GAA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082693
19	NC_003131	TTC	2	6	1665	1670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082693
20	NC_003131	GCA	2	6	1761	1766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082693
21	NC_003131	TGG	2	6	1914	1919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003131	CGT	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_003131	CTG	2	6	2157	2162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_003131	ACA	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_003131	GCT	2	6	2417	2422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003131	CGG	2	6	2428	2433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003131	GAC	2	6	2514	2519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003131	CGA	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_003131	GCC	2	6	2851	2856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_003131	GCG	2	6	2895	2900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003131	TAA	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003131	CAA	2	6	2996	3001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_003131	GTG	3	9	3028	3036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082696
34	NC_003131	TGA	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082696
35	NC_003131	TTA	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082696
36	NC_003131	TCA	2	6	3231	3236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082696
37	NC_003131	GTT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082696
38	NC_003131	AAT	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082696
39	NC_003131	ATA	2	6	3416	3421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003131	AAC	2	6	3509	3514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003131	CAG	2	6	3520	3525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_003131	TAA	2	6	3588	3593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003131	ATC	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082697
44	NC_003131	AGC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082697
45	NC_003131	ATC	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082697
46	NC_003131	GGT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082697
47	NC_003131	TGC	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082697
48	NC_003131	GCA	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082697
49	NC_003131	TGC	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082697
50	NC_003131	TGG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082697
51	NC_003131	TGG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082697
52	NC_003131	GGC	2	6	4157	4162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082697
53	NC_003131	TAC	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082698
54	NC_003131	GCA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082698
55	NC_003131	TCA	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082699
56	NC_003131	GCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40548796
57	NC_003131	TGC	2	6	5051	5056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_003131	CGC	2	6	5057	5062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_003131	CAG	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_003131	CAC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_003131	TCA	2	6	5274	5279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003131	CAT	2	6	5530	5535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_003131	TGA	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003131	CCG	2	6	5588	5593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_003131	GTT	2	6	5621	5626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003131	ATT	2	6	5706	5711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003131	AAG	2	6	6098	6103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003131	TCT	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003131	TTC	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082702
70	NC_003131	TTC	2	6	6381	6386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082702
71	NC_003131	GTA	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082702
72	NC_003131	ATT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082702
73	NC_003131	AAT	2	6	6570	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082702
74	NC_003131	TCG	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082702
75	NC_003131	TCA	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082702
76	NC_003131	CTG	2	6	6843	6848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082702
77	NC_003131	ACG	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082702
78	NC_003131	TAA	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082702
79	NC_003131	TGC	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082702
80	NC_003131	CCG	2	6	7058	7063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082702
81	NC_003131	CAT	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082702
82	NC_003131	TCA	2	6	7154	7159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082702
83	NC_003131	AGC	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
84	NC_003131	AAC	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082703
85	NC_003131	CCG	2	6	7525	7530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082703
86	NC_003131	CAG	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
87	NC_003131	CAT	2	6	7615	7620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082703
88	NC_003131	AGC	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
89	NC_003131	TAA	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082703
90	NC_003131	AAG	2	6	7735	7740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082703
91	NC_003131	AGC	2	6	7784	7789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
92	NC_003131	ATC	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082703
93	NC_003131	ATA	2	6	7808	7813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082703
94	NC_003131	CAA	2	6	7817	7822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082703
95	NC_003131	TCT	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082703
96	NC_003131	CAC	2	6	7972	7977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082703
97	NC_003131	AAC	2	6	8000	8005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082703
98	NC_003131	CAG	2	6	8185	8190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
99	NC_003131	AGC	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
100	NC_003131	TAT	2	6	8327	8332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003131	AAC	2	6	8380	8385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_003131	CGC	2	6	8425	8430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_003131	GAC	2	6	8507	8512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_003131	CTG	2	6	8548	8553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003131	TCG	2	6	8574	8579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_003131	CAG	2	6	8584	8589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_003131	CAC	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_003131	CGC	2	6	8889	8894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_003131	CAT	2	6	8916	8921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_003131	TTA	2	6	9028	9033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003131	CCA	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	40548797
112	NC_003131	TGT	2	6	9161	9166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	40548797
113	NC_003131	ATG	2	6	9204	9209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	40548797
114	NC_003131	AGC	2	6	9232	9237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40548797
115	NC_003131	TCC	2	6	9326	9331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_003131	CAG	2	6	9387	9392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003131	CCA	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082705
118	NC_003131	CAC	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082705
119	NC_003131	CAG	2	6	9741	9746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082705
120	NC_003131	CTG	2	6	9757	9762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082705
121	NC_003131	GCT	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082705
122	NC_003131	GGC	2	6	9869	9874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082705
123	NC_003131	TCA	2	6	9940	9945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082706
124	NC_003131	CTT	3	9	10066	10074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082706
125	NC_003131	CTT	2	6	10388	10393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_003131	GAA	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003131	GCC	2	6	10507	10512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_003131	GTG	2	6	10531	10536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003131	CAA	2	6	10613	10618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_003131	GCC	2	6	10624	10629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_003131	GCA	2	6	10705	10710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_003131	TCT	2	6	10801	10806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_003131	CAC	2	6	11001	11006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_003131	ATC	2	6	11074	11079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_003131	TGA	2	6	11145	11150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003131	ATC	2	6	11207	11212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_003131	GTT	2	6	11343	11348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003131	GCG	2	6	11356	11361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003131	AGG	2	6	11375	11380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003131	GAT	2	6	11473	11478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003131	ATA	2	6	11569	11574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082708
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153	NC_003131	TAA	2	6	12150	12155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003131	TCC	2	6	12253	12258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_003131	ATT	2	6	12267	12272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003131	ATT	2	6	12306	12311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003131	TAT	2	6	12339	12344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003131	TAA	2	6	12411	12416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003131	ACA	2	6	12458	12463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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393	NC_003131	ACT	2	6	27990	27995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_003131	TGC	2	6	28085	28090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
395	NC_003131	TCA	2	6	28209	28214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082728
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401	NC_003131	TTA	2	6	28607	28612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082728
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499	NC_003131	ATC	2	6	35548	35553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_003131	TCT	2	6	35560	35565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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