MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	GCC	2	6	216	221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082692
2	NC_003131	CGC	2	6	230	235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082692
3	NC_003131	CTG	2	6	239	244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082692
4	NC_003131	GAC	2	6	449	454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082692
5	NC_003131	CTT	2	6	606	611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082692
6	NC_003131	TGG	2	6	612	617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082692
7	NC_003131	AGC	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082692
8	NC_003131	TGA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082692
9	NC_003131	CAT	2	6	1063	1068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082692
10	NC_003131	TGA	2	6	1108	1113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082692
11	NC_003131	GAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082693
12	NC_003131	TCA	2	6	1271	1276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082693
13	NC_003131	CGG	2	6	1315	1320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082693
14	NC_003131	CAG	3	9	1519	1527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082693
15	NC_003131	ACG	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082693
16	NC_003131	TCA	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082693
17	NC_003131	TGA	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082693
18	NC_003131	GAA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082693
19	NC_003131	TTC	2	6	1665	1670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082693
20	NC_003131	GCA	2	6	1761	1766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082693
21	NC_003131	GTG	3	9	3028	3036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082696
22	NC_003131	TGA	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082696
23	NC_003131	TTA	2	6	3105	3110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082696
24	NC_003131	TCA	2	6	3231	3236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082696
25	NC_003131	GTT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082696
26	NC_003131	AAT	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082696
27	NC_003131	ATC	2	6	3608	3613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082697
28	NC_003131	AGC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082697
29	NC_003131	ATC	2	6	3788	3793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082697
30	NC_003131	GGT	2	6	3854	3859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082697
31	NC_003131	TGC	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082697
32	NC_003131	GCA	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082697
33	NC_003131	TGC	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082697
34	NC_003131	TGG	2	6	4070	4075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082697
35	NC_003131	TGG	2	6	4151	4156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082697
36	NC_003131	GGC	2	6	4157	4162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082697
37	NC_003131	TAC	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082698
38	NC_003131	GCA	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082698
39	NC_003131	TCA	2	6	4670	4675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082699
40	NC_003131	GCA	2	6	4713	4718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40548796
41	NC_003131	TTC	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082702
42	NC_003131	TTC	2	6	6381	6386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082702
43	NC_003131	GTA	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082702
44	NC_003131	ATT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082702
45	NC_003131	AAT	2	6	6570	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082702
46	NC_003131	TCG	2	6	6674	6679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082702
47	NC_003131	TCA	2	6	6721	6726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082702
48	NC_003131	CTG	2	6	6843	6848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082702
49	NC_003131	ACG	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082702
50	NC_003131	TAA	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082702
51	NC_003131	TGC	2	6	6957	6962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082702
52	NC_003131	CCG	2	6	7058	7063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082702
53	NC_003131	CAT	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082702
54	NC_003131	TCA	2	6	7154	7159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082702
55	NC_003131	AGC	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
56	NC_003131	AAC	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082703
57	NC_003131	CCG	2	6	7525	7530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082703
58	NC_003131	CAG	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
59	NC_003131	CAT	2	6	7615	7620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082703
60	NC_003131	AGC	2	6	7643	7648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
61	NC_003131	TAA	2	6	7652	7657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082703
62	NC_003131	AAG	2	6	7735	7740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082703
63	NC_003131	AGC	2	6	7784	7789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
64	NC_003131	ATC	2	6	7790	7795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082703
65	NC_003131	ATA	2	6	7808	7813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082703
66	NC_003131	CAA	2	6	7817	7822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082703
67	NC_003131	TCT	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082703
68	NC_003131	CAC	2	6	7972	7977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082703
69	NC_003131	AAC	2	6	8000	8005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082703
70	NC_003131	CAG	2	6	8185	8190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
71	NC_003131	AGC	2	6	8225	8230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082703
72	NC_003131	CCA	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	40548797
73	NC_003131	TGT	2	6	9161	9166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	40548797
74	NC_003131	ATG	2	6	9204	9209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	40548797
75	NC_003131	AGC	2	6	9232	9237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40548797
76	NC_003131	CCA	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082705
77	NC_003131	CAC	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082705
78	NC_003131	CAG	2	6	9741	9746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082705
79	NC_003131	CTG	2	6	9757	9762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082705
80	NC_003131	GCT	2	6	9766	9771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082705
81	NC_003131	GGC	2	6	9869	9874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082705
82	NC_003131	TCA	2	6	9940	9945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082706
83	NC_003131	CTT	3	9	10066	10074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082706
84	NC_003131	ATA	2	6	11569	11574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082708
85	NC_003131	TCC	2	6	11605	11610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082708
86	NC_003131	GAT	2	6	11625	11630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082708
87	NC_003131	ATA	2	6	11635	11640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082708
88	NC_003131	TCA	2	6	11659	11664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082708
89	NC_003131	TCA	2	6	11683	11688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082708
90	NC_003131	ATT	2	6	11811	11816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082708
91	NC_003131	ATA	2	6	11915	11920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082708
92	NC_003131	AGT	2	6	12002	12007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082708
93	NC_003131	TCT	2	6	12019	12024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082708
94	NC_003131	TAA	2	6	12101	12106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082708
95	NC_003131	ATT	2	6	12650	12655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082709
96	NC_003131	CCA	2	6	12767	12772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082709
97	NC_003131	GCA	2	6	12842	12847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082709
98	NC_003131	TTC	2	6	12980	12985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082709
99	NC_003131	ATA	2	6	12991	12996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082709
100	NC_003131	ACG	2	6	13276	13281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082709
101	NC_003131	ATT	2	6	13302	13307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082709
102	NC_003131	GCG	2	6	13390	13395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082709
103	NC_003131	GTG	2	6	13412	13417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082709
104	NC_003131	TTC	2	6	13423	13428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082709
105	NC_003131	AGG	2	6	13568	13573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082709
106	NC_003131	ATC	2	6	13711	13716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082710
107	NC_003131	GTT	2	6	13730	13735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082710
108	NC_003131	CAA	2	6	13839	13844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082710
109	NC_003131	TGA	2	6	13898	13903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082710
110	NC_003131	ATT	2	6	13964	13969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082710
111	NC_003131	AAT	2	6	14032	14037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082711
112	NC_003131	AAG	2	6	14102	14107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082711
113	NC_003131	ATT	2	6	14113	14118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082711
114	NC_003131	AAT	2	6	14161	14166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082711
115	NC_003131	TAT	2	6	14167	14172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082711
116	NC_003131	TTA	2	6	14175	14180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082711
117	NC_003131	TAA	2	6	14229	14234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082711
118	NC_003131	CCA	2	6	14237	14242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082711
119	NC_003131	TCC	2	6	14260	14265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082711
120	NC_003131	TTG	2	6	14348	14353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082711
121	NC_003131	AAG	2	6	14382	14387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082711
122	NC_003131	TGC	2	6	14402	14407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082711
123	NC_003131	ATT	2	6	14702	14707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082712
124	NC_003131	GCA	2	6	14709	14714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082712
125	NC_003131	CCG	2	6	14718	14723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082712
126	NC_003131	TTA	2	6	14742	14747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082712
127	NC_003131	TAT	3	9	14766	14774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082712
128	NC_003131	GAT	2	6	14876	14881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082712
129	NC_003131	GCT	2	6	14999	15004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082712
130	NC_003131	TCT	2	6	15084	15089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082712
131	NC_003131	TAC	2	6	16334	16339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082715
132	NC_003131	CAT	2	6	16347	16352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082715
133	NC_003131	GAT	2	6	16521	16526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082715
134	NC_003131	TTA	3	9	16583	16591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082715
135	NC_003131	TTC	2	6	16603	16608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082715
136	NC_003131	ATA	2	6	16663	16668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082715
137	NC_003131	TGG	2	6	16675	16680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082715
138	NC_003131	AAG	2	6	16721	16726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082715
139	NC_003131	AAT	2	6	16761	16766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082715
140	NC_003131	AAG	2	6	16850	16855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082715
141	NC_003131	TTC	2	6	16879	16884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082715
142	NC_003131	ATT	2	6	16891	16896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082715
143	NC_003131	CAA	2	6	16902	16907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082715
144	NC_003131	AAG	2	6	16976	16981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082715
145	NC_003131	TTC	2	6	17005	17010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082715
146	NC_003131	ATT	2	6	17017	17022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082715
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150	NC_003131	AAG	2	6	17102	17107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082715
151	NC_003131	ATT	2	6	17143	17148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082715
152	NC_003131	GGT	2	6	17174	17179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082715
153	NC_003131	TTA	2	6	17204	17209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082715
154	NC_003131	ATT	2	6	17326	17331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082715
155	NC_003131	AGA	2	6	17503	17508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082715
156	NC_003131	ACA	2	6	19298	19303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082716
157	NC_003131	GCA	2	6	19424	19429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082716
158	NC_003131	CTT	2	6	19443	19448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082716
159	NC_003131	TGA	2	6	19478	19483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082716
160	NC_003131	AAT	2	6	19577	19582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082716
161	NC_003131	TGC	2	6	19673	19678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082716
162	NC_003131	GTT	2	6	19695	19700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082716
163	NC_003131	AGC	2	6	19792	19797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082716
164	NC_003131	ATG	2	6	19799	19804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082716
165	NC_003131	ACC	2	6	19811	19816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082716
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173	NC_003131	TTG	2	6	20314	20319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082717
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246	NC_003131	ATA	2	6	25025	25030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082722
247	NC_003131	CAG	2	6	25048	25053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
248	NC_003131	CGC	2	6	25155	25160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082722
249	NC_003131	ATA	2	6	25178	25183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082722
250	NC_003131	TCG	2	6	25263	25268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082722
251	NC_003131	TGA	2	6	25425	25430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082722
252	NC_003131	CGA	2	6	25449	25454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082722
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500	NC_003131	AAC	2	6	44103	44108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082749

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