MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	A	6	6	1003	1008	100 %	0 %	0 %	0 %	16082692
2	NC_003131	C	6	6	1600	1605	0 %	0 %	0 %	100 %	16082693
3	NC_003131	C	6	6	3152	3157	0 %	0 %	0 %	100 %	16082696
4	NC_003131	T	6	6	3529	3534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003131	T	6	6	4347	4352	0 %	100 %	0 %	0 %	16082698
6	NC_003131	A	6	6	4720	4725	100 %	0 %	0 %	0 %	40548796
7	NC_003131	A	7	7	5367	5373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003131	T	6	6	5374	5379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003131	A	8	8	5408	5415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003131	A	7	7	5761	5767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003131	T	7	7	6326	6332	0 %	100 %	0 %	0 %	16082702
12	NC_003131	A	6	6	8367	8372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003131	A	6	6	8659	8664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003131	G	7	7	9154	9160	0 %	0 %	100 %	0 %	40548797
15	NC_003131	G	6	6	10856	10861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003131	T	6	6	10891	10896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003131	T	7	7	10977	10983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003131	T	6	6	11491	11496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003131	T	7	7	11673	11679	0 %	100 %	0 %	0 %	16082708
20	NC_003131	T	6	6	11745	11750	0 %	100 %	0 %	0 %	16082708
21	NC_003131	A	6	6	12437	12442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003131	A	7	7	13348	13354	100 %	0 %	0 %	0 %	16082709
23	NC_003131	A	6	6	14355	14360	100 %	0 %	0 %	0 %	16082711
24	NC_003131	A	6	6	14466	14471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003131	C	8	8	14669	14676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_003131	A	6	6	14966	14971	100 %	0 %	0 %	0 %	16082712
27	NC_003131	A	7	7	15126	15132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003131	A	6	6	15134	15139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003131	A	6	6	15201	15206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003131	T	6	6	15209	15214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003131	G	7	7	15616	15622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003131	T	6	6	15820	15825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003131	A	6	6	16015	16020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003131	A	6	6	16698	16703	100 %	0 %	0 %	0 %	16082715
35	NC_003131	T	6	6	16939	16944	0 %	100 %	0 %	0 %	16082715
36	NC_003131	T	6	6	17065	17070	0 %	100 %	0 %	0 %	16082715
37	NC_003131	A	6	6	17528	17533	100 %	0 %	0 %	0 %	16082715
38	NC_003131	A	6	6	18132	18137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003131	A	6	6	18689	18694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003131	C	7	7	18892	18898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_003131	T	6	6	18947	18952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003131	T	7	7	20112	20118	0 %	100 %	0 %	0 %	16082716
43	NC_003131	G	6	6	21354	21359	0 %	0 %	100 %	0 %	16082717
44	NC_003131	T	6	6	22054	22059	0 %	100 %	0 %	0 %	16082719
45	NC_003131	T	7	7	22219	22225	0 %	100 %	0 %	0 %	16082719
46	NC_003131	T	6	6	23946	23951	0 %	100 %	0 %	0 %	16082722
47	NC_003131	G	8	8	25686	25693	0 %	0 %	100 %	0 %	16082722
48	NC_003131	G	6	6	26469	26474	0 %	0 %	100 %	0 %	16082724
49	NC_003131	A	7	7	27142	27148	100 %	0 %	0 %	0 %	16082727
50	NC_003131	T	6	6	28129	28134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003131	G	6	6	28534	28539	0 %	0 %	100 %	0 %	16082728
52	NC_003131	G	9	9	28699	28707	0 %	0 %	100 %	0 %	16082728
53	NC_003131	A	6	6	29678	29683	100 %	0 %	0 %	0 %	16082729
54	NC_003131	A	6	6	30140	30145	100 %	0 %	0 %	0 %	16082730
55	NC_003131	A	6	6	30592	30597	100 %	0 %	0 %	0 %	16082730
56	NC_003131	C	7	7	32396	32402	0 %	0 %	0 %	100 %	16082732
57	NC_003131	T	7	7	32597	32603	0 %	100 %	0 %	0 %	16082732
58	NC_003131	T	7	7	34199	34205	0 %	100 %	0 %	0 %	16082735
59	NC_003131	A	7	7	34310	34316	100 %	0 %	0 %	0 %	16082735
60	NC_003131	T	8	8	35302	35309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003131	T	7	7	35387	35393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003131	C	7	7	35645	35651	0 %	0 %	0 %	100 %	16082736
63	NC_003131	T	6	6	36345	36350	0 %	100 %	0 %	0 %	16082737
64	NC_003131	T	6	6	36357	36362	0 %	100 %	0 %	0 %	16082737
65	NC_003131	T	8	8	36939	36946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003131	T	7	7	37212	37218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003131	A	6	6	37344	37349	100 %	0 %	0 %	0 %	16082739
68	NC_003131	T	6	6	37769	37774	0 %	100 %	0 %	0 %	16082740
69	NC_003131	A	6	6	38278	38283	100 %	0 %	0 %	0 %	16082740
70	NC_003131	T	6	6	39829	39834	0 %	100 %	0 %	0 %	16082741
71	NC_003131	T	6	6	39976	39981	0 %	100 %	0 %	0 %	16082741
72	NC_003131	A	6	6	40100	40105	100 %	0 %	0 %	0 %	16082741
73	NC_003131	A	6	6	40347	40352	100 %	0 %	0 %	0 %	16082741
74	NC_003131	G	6	6	40613	40618	0 %	0 %	100 %	0 %	16082741
75	NC_003131	A	6	6	40909	40914	100 %	0 %	0 %	0 %	16082742
76	NC_003131	G	7	7	42471	42477	0 %	0 %	100 %	0 %	16082746
77	NC_003131	T	6	6	44566	44571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003131	A	7	7	44600	44606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003131	G	6	6	44743	44748	0 %	0 %	100 %	0 %	16082750
80	NC_003131	G	6	6	45360	45365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003131	C	6	6	45514	45519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_003131	A	7	7	45835	45841	100 %	0 %	0 %	0 %	16082751
83	NC_003131	A	6	6	46812	46817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003131	T	6	6	47502	47507	0 %	100 %	0 %	0 %	16082755
85	NC_003131	A	6	6	48570	48575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003131	T	6	6	48578	48583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003131	T	6	6	48669	48674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003131	T	6	6	48714	48719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003131	A	6	6	48720	48725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003131	T	6	6	49704	49709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003131	T	6	6	49966	49971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003131	T	8	8	50326	50333	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
93	NC_003131	T	6	6	50388	50393	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
94	NC_003131	T	7	7	50532	50538	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
95	NC_003131	T	6	6	50815	50820	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
96	NC_003131	T	6	6	51369	51374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003131	C	6	6	52209	52214	0 %	0 %	0 %	100 %	16082760
98	NC_003131	C	8	8	52267	52274	0 %	0 %	0 %	100 %	16082760
99	NC_003131	A	7	7	53908	53914	100 %	0 %	0 %	0 %	16082761
100	NC_003131	T	6	6	55102	55107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003131	T	7	7	55804	55810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003131	A	6	6	56062	56067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003131	T	7	7	57070	57076	0 %	100 %	0 %	0 %	16082764
104	NC_003131	T	6	6	57613	57618	0 %	100 %	0 %	0 %	16082766
105	NC_003131	C	6	6	57938	57943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
106	NC_003131	A	6	6	60476	60481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003131	T	6	6	60979	60984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003131	T	6	6	61039	61044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003131	T	8	8	61629	61636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003131	A	6	6	62008	62013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003131	A	9	9	62150	62158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003131	A	7	7	62227	62233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003131	T	7	7	62286	62292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003131	A	6	6	62314	62319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003131	A	7	7	62323	62329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003131	A	7	7	62444	62450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003131	G	6	6	63507	63512	0 %	0 %	100 %	0 %	16082773
118	NC_003131	T	6	6	64570	64575	0 %	100 %	0 %	0 %	16082773
119	NC_003131	T	6	6	65276	65281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003131	A	7	7	65825	65831	100 %	0 %	0 %	0 %	16082774
121	NC_003131	T	6	6	66512	66517	0 %	100 %	0 %	0 %	16082775
122	NC_003131	A	6	6	67186	67191	100 %	0 %	0 %	0 %	16082776
123	NC_003131	T	7	7	68639	68645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003131	A	8	8	68824	68831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003131	T	6	6	69289	69294	0 %	100 %	0 %	0 %	16082779

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.