MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	T	6	6	3529	3534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003131	A	7	7	5367	5373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003131	T	6	6	5374	5379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003131	A	8	8	5408	5415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003131	A	7	7	5761	5767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003131	A	6	6	8367	8372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003131	A	6	6	8659	8664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003131	G	6	6	10856	10861	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003131	T	6	6	10891	10896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003131	T	7	7	10977	10983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003131	T	6	6	11491	11496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003131	A	6	6	12437	12442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003131	A	6	6	14466	14471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003131	C	8	8	14669	14676	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_003131	A	7	7	15126	15132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003131	A	6	6	15134	15139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003131	A	6	6	15201	15206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003131	T	6	6	15209	15214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003131	G	7	7	15616	15622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003131	T	6	6	15820	15825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003131	A	6	6	16015	16020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003131	A	6	6	18132	18137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003131	A	6	6	18689	18694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003131	C	7	7	18892	18898	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_003131	T	6	6	18947	18952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003131	T	6	6	28129	28134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003131	T	8	8	35302	35309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003131	T	7	7	35387	35393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003131	T	8	8	36939	36946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003131	T	7	7	37212	37218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003131	T	6	6	44566	44571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003131	A	7	7	44600	44606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003131	G	6	6	45360	45365	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003131	C	6	6	45514	45519	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_003131	A	6	6	46812	46817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003131	A	6	6	48570	48575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003131	T	6	6	48578	48583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003131	T	6	6	48669	48674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003131	T	6	6	48714	48719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003131	A	6	6	48720	48725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003131	T	6	6	49704	49709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003131	T	6	6	49966	49971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003131	T	6	6	51369	51374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003131	T	6	6	55102	55107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003131	T	7	7	55804	55810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003131	A	6	6	56062	56067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003131	C	6	6	57938	57943	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_003131	A	6	6	60476	60481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003131	T	6	6	60979	60984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003131	T	6	6	61039	61044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003131	T	8	8	61629	61636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003131	A	6	6	62008	62013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003131	A	9	9	62150	62158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003131	A	7	7	62227	62233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003131	T	7	7	62286	62292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003131	A	6	6	62314	62319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003131	A	7	7	62323	62329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003131	A	7	7	62444	62450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003131	T	6	6	65276	65281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003131	T	7	7	68639	68645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003131	A	8	8	68824	68831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.