MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pCD1

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003131	A	6	6	1003	1008	100 %	0 %	0 %	0 %	16082692
2	NC_003131	C	6	6	1600	1605	0 %	0 %	0 %	100 %	16082693
3	NC_003131	C	6	6	3152	3157	0 %	0 %	0 %	100 %	16082696
4	NC_003131	T	6	6	4347	4352	0 %	100 %	0 %	0 %	16082698
5	NC_003131	A	6	6	4720	4725	100 %	0 %	0 %	0 %	40548796
6	NC_003131	T	7	7	6326	6332	0 %	100 %	0 %	0 %	16082702
7	NC_003131	G	7	7	9154	9160	0 %	0 %	100 %	0 %	40548797
8	NC_003131	T	7	7	11673	11679	0 %	100 %	0 %	0 %	16082708
9	NC_003131	T	6	6	11745	11750	0 %	100 %	0 %	0 %	16082708
10	NC_003131	A	7	7	13348	13354	100 %	0 %	0 %	0 %	16082709
11	NC_003131	A	6	6	14355	14360	100 %	0 %	0 %	0 %	16082711
12	NC_003131	A	6	6	14966	14971	100 %	0 %	0 %	0 %	16082712
13	NC_003131	A	6	6	16698	16703	100 %	0 %	0 %	0 %	16082715
14	NC_003131	T	6	6	16939	16944	0 %	100 %	0 %	0 %	16082715
15	NC_003131	T	6	6	17065	17070	0 %	100 %	0 %	0 %	16082715
16	NC_003131	A	6	6	17528	17533	100 %	0 %	0 %	0 %	16082715
17	NC_003131	T	7	7	20112	20118	0 %	100 %	0 %	0 %	16082716
18	NC_003131	G	6	6	21354	21359	0 %	0 %	100 %	0 %	16082717
19	NC_003131	T	6	6	22054	22059	0 %	100 %	0 %	0 %	16082719
20	NC_003131	T	7	7	22219	22225	0 %	100 %	0 %	0 %	16082719
21	NC_003131	T	6	6	23946	23951	0 %	100 %	0 %	0 %	16082722
22	NC_003131	G	8	8	25686	25693	0 %	0 %	100 %	0 %	16082722
23	NC_003131	G	6	6	26469	26474	0 %	0 %	100 %	0 %	16082724
24	NC_003131	A	7	7	27142	27148	100 %	0 %	0 %	0 %	16082727
25	NC_003131	G	6	6	28534	28539	0 %	0 %	100 %	0 %	16082728
26	NC_003131	G	9	9	28699	28707	0 %	0 %	100 %	0 %	16082728
27	NC_003131	A	6	6	29678	29683	100 %	0 %	0 %	0 %	16082729
28	NC_003131	A	6	6	30140	30145	100 %	0 %	0 %	0 %	16082730
29	NC_003131	A	6	6	30592	30597	100 %	0 %	0 %	0 %	16082730
30	NC_003131	C	7	7	32396	32402	0 %	0 %	0 %	100 %	16082732
31	NC_003131	T	7	7	32597	32603	0 %	100 %	0 %	0 %	16082732
32	NC_003131	T	7	7	34199	34205	0 %	100 %	0 %	0 %	16082735
33	NC_003131	A	7	7	34310	34316	100 %	0 %	0 %	0 %	16082735
34	NC_003131	C	7	7	35645	35651	0 %	0 %	0 %	100 %	16082736
35	NC_003131	T	6	6	36345	36350	0 %	100 %	0 %	0 %	16082737
36	NC_003131	T	6	6	36357	36362	0 %	100 %	0 %	0 %	16082737
37	NC_003131	A	6	6	37344	37349	100 %	0 %	0 %	0 %	16082739
38	NC_003131	T	6	6	37769	37774	0 %	100 %	0 %	0 %	16082740
39	NC_003131	A	6	6	38278	38283	100 %	0 %	0 %	0 %	16082740
40	NC_003131	T	6	6	39829	39834	0 %	100 %	0 %	0 %	16082741
41	NC_003131	T	6	6	39976	39981	0 %	100 %	0 %	0 %	16082741
42	NC_003131	A	6	6	40100	40105	100 %	0 %	0 %	0 %	16082741
43	NC_003131	A	6	6	40347	40352	100 %	0 %	0 %	0 %	16082741
44	NC_003131	G	6	6	40613	40618	0 %	0 %	100 %	0 %	16082741
45	NC_003131	A	6	6	40909	40914	100 %	0 %	0 %	0 %	16082742
46	NC_003131	G	7	7	42471	42477	0 %	0 %	100 %	0 %	16082746
47	NC_003131	G	6	6	44743	44748	0 %	0 %	100 %	0 %	16082750
48	NC_003131	A	7	7	45835	45841	100 %	0 %	0 %	0 %	16082751
49	NC_003131	T	6	6	47502	47507	0 %	100 %	0 %	0 %	16082755
50	NC_003131	T	8	8	50326	50333	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
51	NC_003131	T	6	6	50388	50393	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
52	NC_003131	T	7	7	50532	50538	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
53	NC_003131	T	6	6	50815	50820	0 %	100 %	0 %	0 %	16082759
54	NC_003131	C	6	6	52209	52214	0 %	0 %	0 %	100 %	16082760
55	NC_003131	C	8	8	52267	52274	0 %	0 %	0 %	100 %	16082760
56	NC_003131	A	7	7	53908	53914	100 %	0 %	0 %	0 %	16082761
57	NC_003131	T	7	7	57070	57076	0 %	100 %	0 %	0 %	16082764
58	NC_003131	T	6	6	57613	57618	0 %	100 %	0 %	0 %	16082766
59	NC_003131	G	6	6	63507	63512	0 %	0 %	100 %	0 %	16082773
60	NC_003131	T	6	6	64570	64575	0 %	100 %	0 %	0 %	16082773
61	NC_003131	A	7	7	65825	65831	100 %	0 %	0 %	0 %	16082774
62	NC_003131	T	6	6	66512	66517	0 %	100 %	0 %	0 %	16082775
63	NC_003131	A	6	6	67186	67191	100 %	0 %	0 %	0 %	16082776
64	NC_003131	T	6	6	69289	69294	0 %	100 %	0 %	0 %	16082779

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.