MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis Z2491 chromosome

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003116	AAGGGA	2	12	27233	27244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003116	TTAAAT	2	12	59001	59012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003116	TATTTT	2	12	75280	75291	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003116	GGTTTA	2	12	88561	88572	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003116	CTTTTC	2	12	136726	136737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_003116	TGCGTA	2	12	149715	149726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_003116	CTTTGT	2	12	197902	197913	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_003116	CACCAT	2	12	221022	221033	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003116	TTAAAT	2	12	229600	229611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003116	TTGCCG	2	12	252776	252787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_003116	TGGCGG	2	12	252789	252800	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_003116	CGGTGG	2	12	253002	253013	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003116	CTTTGG	2	12	253362	253373	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003116	CGGAGG	2	12	255544	255555	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_003116	CGGTGG	2	12	256080	256091	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_003116	GGCTTG	2	12	262936	262947	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_003116	TTGCCG	2	12	271193	271204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003116	CGGCAT	2	12	271922	271933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_003116	AAAATA	2	12	297184	297195	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003116	ATTTTT	2	12	300086	300097	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003116	GCTGTT	2	12	300630	300641	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_003116	TTTTGA	2	12	302727	302738	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003116	TTAAAT	2	12	307936	307947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003116	TATTTT	2	12	311859	311870	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003116	CGCGGT	2	12	319827	319838	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003116	ACAAAG	2	12	393319	393330	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_003116	AAGCCG	2	12	413345	413356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003116	GGAAGC	2	12	434607	434618	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003116	ATTTAA	2	12	507996	508007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003116	CAAAAA	2	12	510887	510898	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_003116	GCAGGG	2	12	512272	512283	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_003116	GGGGCG	2	12	520379	520390	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_003116	ATTTAA	2	12	553182	553193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003116	CAACCC	2	12	578951	578962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_003116	TTTTGT	2	12	589914	589925	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003116	TTAAAT	2	12	604281	604292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003116	TTCAGA	2	12	617903	617914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_003116	ACCGAA	2	12	632455	632466	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003116	ACCGAA	2	12	632655	632666	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_003116	AACCGG	2	12	635472	635483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003116	GCTGCC	2	12	657303	657314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003116	TTAAAT	2	12	664448	664459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003116	ATTTAA	2	12	670112	670123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003116	TTAAAT	2	12	716806	716817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003116	CAAATC	2	12	717008	717019	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_003116	GGTTTT	2	12	728901	728912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003116	AATTTA	2	12	732331	732342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003116	ATGCCG	2	12	739182	739193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_003116	CGAAAA	2	12	747110	747121	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_003116	ATTTAA	2	12	754940	754951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003116	AAATCC	2	12	757945	757956	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_003116	TCGGTT	2	12	758334	758345	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_003116	TCGGTT	2	12	758687	758698	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_003116	AAAAAC	2	12	760035	760046	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_003116	ATAGAA	2	12	766758	766769	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003116	TCAAAA	2	12	771747	771758	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_003116	GACGGT	2	12	772125	772136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_003116	AACGGC	2	12	772254	772265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_003116	CGGTAA	2	12	772529	772540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003116	TAAAGC	2	12	772964	772975	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003116	TGGCAA	2	12	773993	774004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_003116	TTCAAA	2	12	774808	774819	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_003116	ATCCGC	2	12	784546	784557	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003116	TTAAAT	2	12	796495	796506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003116	CGGACA	2	12	805103	805114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003116	TTATGT	2	12	834217	834228	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003116	TTCGGT	2	12	862427	862438	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_003116	TTTTTG	2	12	879797	879808	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003116	ATTTAA	2	12	881405	881416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003116	CCTTAA	2	12	886857	886868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003116	CATTCC	2	12	886959	886970	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_003116	ATTTAA	2	12	887182	887193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003116	CCGAAC	2	12	887235	887246	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_003116	TTAAAT	2	12	896598	896609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003116	TTAAAT	2	12	903501	903512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003116	CGCCTG	2	12	923263	923274	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_003116	AAAATA	2	12	926795	926806	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003116	TTCGGA	2	12	936582	936593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_003116	ATTTAA	2	12	940816	940827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003116	GTCGAT	2	12	1017638	1017649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_003116	TTAAAT	2	12	1030920	1030931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003116	AAGGAT	2	12	1036947	1036958	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003116	AAGGAA	2	12	1049612	1049623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003116	TTAAAT	2	12	1049745	1049756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003116	ATTTAT	2	12	1050513	1050524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003116	TTCAAT	2	12	1050525	1050536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_003116	GGTTTT	2	12	1064619	1064630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003116	TAATCA	2	12	1065581	1065592	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_003116	TTTAAA	2	12	1068117	1068128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003116	ATTTAA	2	12	1068195	1068206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003116	ATTTAA	2	12	1101750	1101761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003116	TTTTTG	2	12	1106644	1106655	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003116	TCTTTG	2	12	1114096	1114107	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_003116	ATTTTT	2	12	1121534	1121545	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003116	TTAAAT	2	12	1127055	1127066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003116	CGTTTG	2	12	1127210	1127221	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_003116	GACGAA	2	12	1128633	1128644	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_003116	TTGTTT	2	12	1144474	1144485	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003116	ATTTAA	2	12	1145748	1145759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003116	CCCAAA	2	12	1153132	1153143	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_003116	TTAAAT	2	12	1153339	1153350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003116	GGGGTG	2	12	1154300	1154311	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003116	ATTTAA	2	12	1155765	1155776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003116	TTCGGC	2	12	1165402	1165413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003116	ATTTAA	2	12	1179507	1179518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003116	AATTTG	2	12	1190508	1190519	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003116	ATTTAA	2	12	1199830	1199841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003116	GGAAAA	2	12	1199870	1199881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003116	TTGATG	2	12	1207154	1207165	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003116	ACCTGC	2	12	1226852	1226863	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_003116	CAAAGC	2	12	1237466	1237477	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003116	GAAAAA	2	12	1280686	1280697	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003116	GAAACC	2	12	1289501	1289512	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_003116	GGCTTT	2	12	1291988	1291999	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003116	GGCAAG	2	12	1292271	1292282	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_003116	TGCGGG	2	12	1322048	1322059	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_003116	TCTTTG	2	12	1325518	1325529	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_003116	TGCCGA	2	12	1342142	1342153	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_003116	TTTCAG	2	12	1400891	1400902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_003116	CCGGCT	2	12	1401004	1401015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003116	AAACAC	2	12	1417265	1417276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003116	GCTGCC	2	12	1434866	1434877	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
123	NC_003116	GCCAAA	2	12	1477339	1477350	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003116	CAAAAA	2	12	1490678	1490689	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_003116	GCGTTG	2	12	1495698	1495709	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_003116	AACAAA	2	12	1496354	1496365	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_003116	AGATTT	2	12	1502666	1502677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003116	TGCCTT	2	12	1503709	1503720	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_003116	TTAAAT	2	12	1507921	1507932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003116	TAAATA	2	12	1520220	1520231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003116	TCTTTG	2	12	1523102	1523113	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_003116	ATTTAA	2	12	1536678	1536689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003116	AATTTA	2	12	1597871	1597882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003116	ATTTAA	2	12	1598291	1598302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003116	GGCTGC	2	12	1600255	1600266	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_003116	TTCGGT	2	12	1630616	1630627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_003116	CCGGAA	2	12	1641294	1641305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_003116	ATCGGA	2	12	1643347	1643358	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_003116	TTAAAT	2	12	1649683	1649694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003116	ATTTAA	2	12	1649760	1649771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003116	TTAAAT	2	12	1662906	1662917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003116	ATTTAA	2	12	1725515	1725526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003116	TTCGGT	2	12	1733579	1733590	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_003116	CTCCAA	2	12	1733750	1733761	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_003116	TTTCTT	2	12	1739476	1739487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_003116	AAAAAC	2	12	1745283	1745294	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_003116	GATTCA	2	12	1746143	1746154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_003116	TTTAAA	2	12	1751740	1751751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003116	ACCGAA	2	12	1751851	1751862	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_003116	ACCGAA	2	12	1752166	1752177	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_003116	TTAAAT	2	12	1752421	1752432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003116	GCCCAA	2	12	1752680	1752691	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
153	NC_003116	TTCGGT	2	12	1759818	1759829	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_003116	AACCGA	2	12	1761675	1761686	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_003116	AAAATC	2	12	1834780	1834791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_003116	CTTTGT	2	12	1844913	1844924	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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162	NC_003116	CGGAAA	2	12	1982301	1982312	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_003116	GCAGCC	2	12	1985571	1985582	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
164	NC_003116	AAATCA	2	12	2024145	2024156	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.