MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Neisseria meningitidis MC58 chromosome

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003112	GGCTTG	2	12	29808	29819	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_003112	TTCGGT	2	12	45398	45409	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003112	TTCGGT	2	12	45718	45729	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_003112	TTCGGT	2	12	45966	45977	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_003112	TTCGGT	2	12	46847	46858	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_003112	GCGCAA	2	12	48215	48226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_003112	ACGCAA	2	12	48227	48238	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_003112	TGGTTT	2	12	48352	48363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003112	CGGCAA	2	12	50065	50076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_003112	TGTATG	2	12	50256	50267	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003112	ACAAAG	2	12	62940	62951	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_003112	CAGGAG	2	12	86581	86592	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_003112	CGCGGT	2	12	103456	103467	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_003112	AAATTT	2	12	104206	104217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003112	AACAAG	2	12	106392	106403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_003112	GTTTTA	2	12	108177	108188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003112	CGCGGT	2	12	110088	110099	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003112	CTTATG	2	12	114243	114254	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_003112	GGAAAA	2	12	131581	131592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003112	CTGAAA	2	12	149522	149533	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_003112	CAAAAA	2	12	189696	189707	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_003112	CAAAAA	2	12	190012	190023	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_003112	TTCGGT	2	12	196363	196374	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_003112	TTCGGT	2	12	196535	196546	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_003112	TTCGGT	2	12	196704	196715	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_003112	TGAAAA	2	12	207229	207240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003112	CAAAAA	2	12	220108	220119	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_003112	AGCAAA	2	12	221074	221085	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_003112	CAAAAA	2	12	221131	221142	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_003112	TCCCTT	2	12	234635	234646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_003112	TGCGCC	2	12	265938	265949	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_003112	TTCTTT	2	12	292893	292904	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_003112	TTTTGA	2	12	293237	293248	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003112	AAGCCG	2	12	294102	294113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_003112	ACAAAG	2	12	309690	309701	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_003112	CTTTGC	2	12	315707	315718	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_003112	TTCGGT	2	12	319809	319820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_003112	TTCGGT	2	12	320330	320341	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_003112	TTCGGT	2	12	320852	320863	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003112	TTTTCA	2	12	321388	321399	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_003112	TTAAAT	2	12	337251	337262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003112	TTTGAA	2	12	347413	347424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003112	TTAAAT	2	12	383272	383283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003112	TTGATA	2	12	404054	404065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003112	TGATTT	2	12	418042	418053	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003112	ACCGAA	2	12	449981	449992	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_003112	GGCTGC	2	12	455576	455587	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_003112	TTTCCG	2	12	459295	459306	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_003112	TTAAAT	2	12	463393	463404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003112	TTCGGT	2	12	480688	480699	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_003112	ATAAAA	2	12	502613	502624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003112	ACCGAA	2	12	504716	504727	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_003112	CAAATC	2	12	570484	570495	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_003112	GTGTGG	2	12	580778	580789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003112	GGTTTT	2	12	581251	581262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003112	GTTTTT	2	12	581591	581602	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003112	AATTTA	2	12	585049	585060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003112	ATGCCG	2	12	592053	592064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_003112	CGAAAA	2	12	599983	599994	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_003112	TCGGTT	2	12	611128	611139	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003112	AAAAAC	2	12	611674	611685	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_003112	TTCAAA	2	12	618273	618284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_003112	ATCCGC	2	12	627990	628001	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003112	TTAAAT	2	12	640121	640132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003112	CGGACA	2	12	647478	647489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003112	TTCGGT	2	12	713518	713529	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003112	TTAAAT	2	12	717811	717822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003112	ATTTAA	2	12	732320	732331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003112	CCTTAA	2	12	737943	737954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_003112	ATTTAA	2	12	738268	738279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003112	CCGAAC	2	12	738321	738332	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_003112	TTAAAT	2	12	754334	754345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003112	CGCCTG	2	12	775679	775690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_003112	AAAATA	2	12	779212	779223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003112	TTCGGA	2	12	789001	789012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_003112	TTTCTG	2	12	789943	789954	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_003112	ACGGAT	2	12	871731	871742	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_003112	AAGGAT	2	12	890435	890446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003112	AAGGAA	2	12	902979	902990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003112	ATTTAT	2	12	903880	903891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003112	TTCAAT	2	12	903892	903903	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_003112	CAGTTT	2	12	908077	908088	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_003112	GTTTGC	2	12	916832	916843	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_003112	GGTTTT	2	12	931091	931102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003112	TAATCA	2	12	932053	932064	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_003112	TTTAAA	2	12	934589	934600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003112	ATTTAA	2	12	934667	934678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003112	TGGTTT	2	12	939802	939813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003112	GGCTGC	2	12	940231	940242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_003112	ACCGAA	2	12	940681	940692	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_003112	ATTTAA	2	12	971910	971921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003112	TCTTTG	2	12	983170	983181	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003112	TTTCGG	2	12	988502	988513	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_003112	ATTTTT	2	12	990604	990615	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003112	TTAAAT	2	12	995828	995839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003112	GCAAAA	2	12	998199	998210	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_003112	AAAACC	2	12	1000618	1000629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_003112	CCACAC	2	12	1001087	1001098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_003112	TTGTTT	2	12	1011315	1011326	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003112	ATTTAA	2	12	1012589	1012600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003112	TTAAAT	2	12	1020444	1020455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003112	TGGCGG	2	12	1022692	1022703	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_003112	GTGTTT	2	12	1025428	1025439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003112	TTCGGC	2	12	1030512	1030523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003112	GGTTTG	2	12	1039585	1039596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003112	TCGGCA	2	12	1054772	1054783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_003112	ATTTAA	2	12	1060482	1060493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003112	ATTTAA	2	12	1073269	1073280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003112	AATTTG	2	12	1083046	1083057	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003112	ATTTAA	2	12	1097296	1097307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003112	AAATCA	2	12	1105978	1105989	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_003112	GAACTG	2	12	1106669	1106680	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_003112	TCGTGT	2	12	1134491	1134502	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_003112	CAAAGC	2	12	1135173	1135184	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_003112	TTGATT	2	12	1145349	1145360	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003112	TTTCCG	2	12	1171704	1171715	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003112	TTGATT	2	12	1177385	1177396	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003112	GAAAAA	2	12	1210534	1210545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003112	GAAACC	2	12	1228440	1228451	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_003112	CCTGAA	2	12	1282094	1282105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003112	ACCGTT	2	12	1284767	1284778	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_003112	CGCCTC	2	12	1284832	1284843	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_003112	TTTCAG	2	12	1309197	1309208	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_003112	AAACAC	2	12	1325569	1325580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_003112	ATTTAA	2	12	1382307	1382318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003112	ATCCGA	2	12	1401428	1401439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_003112	AACAAA	2	12	1401817	1401828	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_003112	CGATAG	2	12	1403076	1403087	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_003112	CCCAAT	2	12	1403749	1403760	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_003112	AGATTT	2	12	1408131	1408142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003112	TAAATA	2	12	1425597	1425608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003112	ATTTTT	2	12	1453361	1453372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003112	ATTTAA	2	12	1453409	1453420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003112	CCGATA	2	12	1492764	1492775	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_003112	ACAGGC	2	12	1512293	1512304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_003112	ATTTAA	2	12	1512458	1512469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003112	ATTTAA	2	12	1512926	1512937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003112	GGCTGC	2	12	1515219	1515230	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003112	CGACCG	2	12	1528018	1528029	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
140	NC_003112	AACCCA	2	12	1541693	1541704	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_003112	TTCGGT	2	12	1546408	1546419	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_003112	TTCGGT	2	12	1546688	1546699	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_003112	TTCGGT	2	12	1546838	1546849	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_003112	TTCGGT	2	12	1547690	1547701	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_003112	ATCGGA	2	12	1561263	1561274	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_003112	TTAAAT	2	12	1567600	1567611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003112	ATTTAA	2	12	1567677	1567688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003112	AAAACG	2	12	1575447	1575458	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
149	NC_003112	TTAAAT	2	12	1580646	1580657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003112	TTTCTT	2	12	1602765	1602776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_003112	GCAGTT	2	12	1628559	1628570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_003112	TCGGCT	2	12	1628852	1628863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_003112	ATTTAA	2	12	1652223	1652234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003112	GATTCA	2	12	1665093	1665104	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_003112	TTTAAA	2	12	1670541	1670552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003112	ACCGAA	2	12	1670981	1670992	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_003112	GCCCAA	2	12	1671493	1671504	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
158	NC_003112	TTATTT	2	12	1690650	1690661	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003112	TTCGGT	2	12	1699184	1699195	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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161	NC_003112	AGACAA	2	12	1700461	1700472	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_003112	AAACCA	2	12	1700823	1700834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_003112	CTTTGT	2	12	1728597	1728608	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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169	NC_003112	GGCATA	2	12	1832831	1832842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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172	NC_003112	GGTTTG	2	12	1873976	1873987	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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200	NC_003112	TTAAAT	2	12	2268033	2268044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.