MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Neisseria meningitidis MC58 chromosome

Total Repeats: 1243

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003112	AAAAT	2	10	823	832	80 %	20 %	0 %	0 %	15675950
2	NC_003112	CGCAA	2	10	1306	1315	40 %	0 %	20 %	40 %	15675951
3	NC_003112	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	15675951
4	NC_003112	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	15675951
5	NC_003112	AAGGC	2	10	6081	6090	40 %	0 %	40 %	20 %	15675957
6	NC_003112	GCTTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	15675958
7	NC_003112	TACCG	2	10	8590	8599	20 %	20 %	20 %	40 %	15675959
8	NC_003112	TCAAT	2	10	9657	9666	40 %	40 %	0 %	20 %	15675960
9	NC_003112	CGCGC	2	10	10670	10679	0 %	0 %	40 %	60 %	15675961
10	NC_003112	CCCGT	2	10	10691	10700	0 %	20 %	20 %	60 %	15675961
11	NC_003112	CGCGC	2	10	13214	13223	0 %	0 %	40 %	60 %	15675963
12	NC_003112	TGTCG	2	10	13296	13305	0 %	40 %	40 %	20 %	15675963
13	NC_003112	AGGGC	2	10	27700	27709	20 %	0 %	60 %	20 %	15675970
14	NC_003112	AAACC	2	10	28403	28412	60 %	0 %	0 %	40 %	15675971
15	NC_003112	TCCGC	2	10	31703	31712	0 %	20 %	20 %	60 %	15675973
16	NC_003112	CATTC	2	10	36286	36295	20 %	40 %	0 %	40 %	15675977
17	NC_003112	AGGTG	2	10	36732	36741	20 %	20 %	60 %	0 %	15675978
18	NC_003112	GGGCT	2	10	39396	39405	0 %	20 %	60 %	20 %	15675981
19	NC_003112	GGCGG	2	10	42894	42903	0 %	0 %	80 %	20 %	15675984
20	NC_003112	GCGGT	2	10	43370	43379	0 %	20 %	60 %	20 %	15675985
21	NC_003112	GCGCG	2	10	43767	43776	0 %	0 %	60 %	40 %	15675985
22	NC_003112	ACGGC	2	10	44312	44321	20 %	0 %	40 %	40 %	15675985
23	NC_003112	GTTGG	2	10	53909	53918	0 %	40 %	60 %	0 %	15675988
24	NC_003112	AAACC	2	10	56299	56308	60 %	0 %	0 %	40 %	15675989
25	NC_003112	GTGCG	2	10	58650	58659	0 %	20 %	60 %	20 %	15675991
26	NC_003112	TGCCG	2	10	69006	69015	0 %	20 %	40 %	40 %	15675998
27	NC_003112	TGGCT	2	10	69335	69344	0 %	40 %	40 %	20 %	15675998
28	NC_003112	TGCCC	2	10	69942	69951	0 %	20 %	20 %	60 %	15675998
29	NC_003112	TCTTT	2	10	71835	71844	0 %	80 %	0 %	20 %	15675999
30	NC_003112	GCGTA	2	10	72061	72070	20 %	20 %	40 %	20 %	15676000
31	NC_003112	GGGTA	2	10	73425	73434	20 %	20 %	60 %	0 %	15676001
32	NC_003112	TCGGC	2	10	73818	73827	0 %	20 %	40 %	40 %	15676001
33	NC_003112	TGCTA	2	10	75227	75236	20 %	40 %	20 %	20 %	15676002
34	NC_003112	AAGCA	2	10	77884	77893	60 %	0 %	20 %	20 %	15676004
35	NC_003112	TTTAA	2	10	78134	78143	40 %	60 %	0 %	0 %	15676004
36	NC_003112	GATTT	2	10	80047	80056	20 %	60 %	20 %	0 %	15676006
37	NC_003112	TGTAT	2	10	81449	81458	20 %	60 %	20 %	0 %	15676007
38	NC_003112	AAAAG	2	10	81633	81642	80 %	0 %	20 %	0 %	15676008
39	NC_003112	TTTGA	2	10	82256	82265	20 %	60 %	20 %	0 %	15676008
40	NC_003112	TGGCT	2	10	83189	83198	0 %	40 %	40 %	20 %	15676009
41	NC_003112	GCAAG	2	10	84470	84479	40 %	0 %	40 %	20 %	15676011
42	NC_003112	GCGCG	2	10	85529	85538	0 %	0 %	60 %	40 %	15676011
43	NC_003112	CAACG	2	10	86451	86460	40 %	0 %	20 %	40 %	15676011
44	NC_003112	CTACC	2	10	88231	88240	20 %	20 %	0 %	60 %	15677985
45	NC_003112	TACGC	2	10	89596	89605	20 %	20 %	20 %	40 %	15676012
46	NC_003112	CCCGT	2	10	92682	92691	0 %	20 %	20 %	60 %	15676015
47	NC_003112	CCGTA	2	10	92919	92928	20 %	20 %	20 %	40 %	15676015
48	NC_003112	ACATC	2	10	93820	93829	40 %	20 %	0 %	40 %	15676016
49	NC_003112	ACCGC	2	10	101823	101832	20 %	0 %	20 %	60 %	15676021
50	NC_003112	AAACC	2	10	102265	102274	60 %	0 %	0 %	40 %	15676021
51	NC_003112	CGTGC	2	10	110711	110720	0 %	20 %	40 %	40 %	15676030
52	NC_003112	GCCGC	2	10	111881	111890	0 %	0 %	40 %	60 %	15676031
53	NC_003112	AATTG	2	10	112665	112674	40 %	40 %	20 %	0 %	15676032
54	NC_003112	AAAAT	2	10	112926	112935	80 %	20 %	0 %	0 %	15676032
55	NC_003112	CGGCG	2	10	114769	114778	0 %	0 %	60 %	40 %	15676034
56	NC_003112	CAGGT	2	10	116235	116244	20 %	20 %	40 %	20 %	15676036
57	NC_003112	CGCCT	2	10	116921	116930	0 %	20 %	20 %	60 %	15676037
58	NC_003112	GGTAT	2	10	117161	117170	20 %	40 %	40 %	0 %	15676037
59	NC_003112	GGCGC	2	10	117412	117421	0 %	0 %	60 %	40 %	15676037
60	NC_003112	TGGCG	2	10	118957	118966	0 %	20 %	60 %	20 %	15676039
61	NC_003112	CAAAG	2	10	119167	119176	60 %	0 %	20 %	20 %	15676039
62	NC_003112	GCGCC	2	10	120374	120383	0 %	0 %	40 %	60 %	15676040
63	NC_003112	GGCGC	2	10	120603	120612	0 %	0 %	60 %	40 %	15676040
64	NC_003112	TGAGT	2	10	122217	122226	20 %	40 %	40 %	0 %	15676042
65	NC_003112	CGGCG	2	10	122721	122730	0 %	0 %	60 %	40 %	15676042
66	NC_003112	GGCAA	2	10	122794	122803	40 %	0 %	40 %	20 %	15676042
67	NC_003112	GTTTT	2	10	125234	125243	0 %	80 %	20 %	0 %	15676044
68	NC_003112	CGTGT	2	10	127004	127013	0 %	40 %	40 %	20 %	15676046
69	NC_003112	GAAAA	2	10	127418	127427	80 %	0 %	20 %	0 %	15676046
70	NC_003112	CAAAT	2	10	128453	128462	60 %	20 %	0 %	20 %	15676046
71	NC_003112	TAATA	2	10	130272	130281	60 %	40 %	0 %	0 %	15676048
72	NC_003112	GAAGG	2	10	133910	133919	40 %	0 %	60 %	0 %	15676053
73	NC_003112	TTGGG	2	10	140511	140520	0 %	40 %	60 %	0 %	15676060
74	NC_003112	CATAC	2	10	142987	142996	40 %	20 %	0 %	40 %	15676061
75	NC_003112	GTGAT	2	10	143866	143875	20 %	40 %	40 %	0 %	15676061
76	NC_003112	CCTGC	2	10	149217	149226	0 %	20 %	20 %	60 %	15676066
77	NC_003112	GAAAA	2	10	153467	153476	80 %	0 %	20 %	0 %	15676072
78	NC_003112	TGATT	2	10	154554	154563	20 %	60 %	20 %	0 %	15676074
79	NC_003112	AATGC	2	10	155248	155257	40 %	20 %	20 %	20 %	15676075
80	NC_003112	GTAAA	2	10	156199	156208	60 %	20 %	20 %	0 %	15676078
81	NC_003112	TCAAA	2	10	157271	157280	60 %	20 %	0 %	20 %	15676080
82	NC_003112	TTTGG	2	10	158082	158091	0 %	60 %	40 %	0 %	15676082
83	NC_003112	GAAAT	2	10	161928	161937	60 %	20 %	20 %	0 %	15676089
84	NC_003112	AAAAT	2	10	162190	162199	80 %	20 %	0 %	0 %	15676091
85	NC_003112	GGGTT	2	10	163677	163686	0 %	40 %	60 %	0 %	15676094
86	NC_003112	GTCAT	2	10	164199	164208	20 %	40 %	20 %	20 %	15676095
87	NC_003112	GCAAA	2	10	166571	166580	60 %	0 %	20 %	20 %	15676098
88	NC_003112	CGGTT	2	10	166601	166610	0 %	40 %	40 %	20 %	15676098
89	NC_003112	TGGTT	2	10	171088	171097	0 %	60 %	40 %	0 %	15676101
90	NC_003112	CGGCG	2	10	171641	171650	0 %	0 %	60 %	40 %	15676102
91	NC_003112	CCAAA	2	10	172030	172039	60 %	0 %	0 %	40 %	15676102
92	NC_003112	TGAAA	2	10	172942	172951	60 %	20 %	20 %	0 %	15676103
93	NC_003112	GCCGC	2	10	174033	174042	0 %	0 %	40 %	60 %	15676104
94	NC_003112	CGGCG	2	10	175497	175506	0 %	0 %	60 %	40 %	15676105
95	NC_003112	TCTGC	2	10	175584	175593	0 %	40 %	20 %	40 %	15676105
96	NC_003112	AACCC	2	10	179515	179524	40 %	0 %	0 %	60 %	15676109
97	NC_003112	CTCGG	2	10	180698	180707	0 %	20 %	40 %	40 %	15676109
98	NC_003112	GCCGT	2	10	183200	183209	0 %	20 %	40 %	40 %	15676111
99	NC_003112	ACCAA	2	10	184042	184051	60 %	0 %	0 %	40 %	15676112
100	NC_003112	TGCCG	2	10	186616	186625	0 %	20 %	40 %	40 %	15676115
101	NC_003112	GTTGC	2	10	186931	186940	0 %	40 %	40 %	20 %	15676115
102	NC_003112	TGGCG	2	10	187512	187521	0 %	20 %	60 %	20 %	15676116
103	NC_003112	GTTTG	2	10	187536	187545	0 %	60 %	40 %	0 %	15676116
104	NC_003112	CCTGC	2	10	195241	195250	0 %	20 %	20 %	60 %	15676122
105	NC_003112	CGGGG	2	10	198594	198603	0 %	0 %	80 %	20 %	15676123
106	NC_003112	TGCGT	2	10	200176	200185	0 %	40 %	40 %	20 %	15676123
107	NC_003112	GCGCC	2	10	201080	201089	0 %	0 %	40 %	60 %	15676125
108	NC_003112	AAATT	2	10	203900	203909	60 %	40 %	0 %	0 %	15676128
109	NC_003112	GCCGT	2	10	206864	206873	0 %	20 %	40 %	40 %	15676133
110	NC_003112	GCCGT	2	10	206993	207002	0 %	20 %	40 %	40 %	15676133
111	NC_003112	GGCAG	2	10	209099	209108	20 %	0 %	60 %	20 %	15676135
112	NC_003112	GTCAA	2	10	210675	210684	40 %	20 %	20 %	20 %	15676136
113	NC_003112	CCTTT	2	10	211279	211288	0 %	60 %	0 %	40 %	15676136
114	NC_003112	AAATG	2	10	211495	211504	60 %	20 %	20 %	0 %	15676136
115	NC_003112	CAGGG	2	10	215328	215337	20 %	0 %	60 %	20 %	15676138
116	NC_003112	TTTGG	2	10	215568	215577	0 %	60 %	40 %	0 %	15676138
117	NC_003112	CGCTT	2	10	217616	217625	0 %	40 %	20 %	40 %	15676139
118	NC_003112	ATCAA	2	10	217863	217872	60 %	20 %	0 %	20 %	15676140
119	NC_003112	GTCAA	2	10	222102	222111	40 %	20 %	20 %	20 %	15676142
120	NC_003112	ATAAA	2	10	225183	225192	80 %	20 %	0 %	0 %	15676144
121	NC_003112	CTGCC	2	10	225295	225304	0 %	20 %	20 %	60 %	15676144
122	NC_003112	CGTGC	2	10	226839	226848	0 %	20 %	40 %	40 %	15676145
123	NC_003112	TTGGG	2	10	229622	229631	0 %	40 %	60 %	0 %	15676148
124	NC_003112	GATTT	2	10	231013	231022	20 %	60 %	20 %	0 %	15676150
125	NC_003112	GGTGC	2	10	234383	234392	0 %	20 %	60 %	20 %	15676151
126	NC_003112	TCGTT	2	10	235303	235312	0 %	60 %	20 %	20 %	15676152
127	NC_003112	ACAAT	2	10	236067	236076	60 %	20 %	0 %	20 %	15676153
128	NC_003112	TGCCA	2	10	236294	236303	20 %	20 %	20 %	40 %	15676153
129	NC_003112	GCGAA	2	10	238678	238687	40 %	0 %	40 %	20 %	15676155
130	NC_003112	CGGCA	2	10	238748	238757	20 %	0 %	40 %	40 %	15676155
131	NC_003112	CGCAT	2	10	239522	239531	20 %	20 %	20 %	40 %	15676157
132	NC_003112	CGCCA	2	10	241460	241469	20 %	0 %	20 %	60 %	15676157
133	NC_003112	ATTGA	2	10	242265	242274	40 %	40 %	20 %	0 %	15676159
134	NC_003112	CTCTT	2	10	243003	243012	0 %	60 %	0 %	40 %	15676160
135	NC_003112	ATTTT	2	10	243064	243073	20 %	80 %	0 %	0 %	15676161
136	NC_003112	GGTCC	2	10	245121	245130	0 %	20 %	40 %	40 %	15676164
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