MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Neisseria meningitidis MC58 chromosome

Total Repeats: 32595

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003112	ACC	2	6	74	79	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675949
2	NC_003112	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15675949
3	NC_003112	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675949
4	NC_003112	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675949
5	NC_003112	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15675949
6	NC_003112	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675949
7	NC_003112	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675950
8	NC_003112	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675950
9	NC_003112	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
10	NC_003112	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
11	NC_003112	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675951
12	NC_003112	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675951
13	NC_003112	TCG	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
14	NC_003112	GAA	2	6	1464	1469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675951
15	NC_003112	TCG	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
16	NC_003112	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675951
17	NC_003112	ATC	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675951
18	NC_003112	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675951
19	NC_003112	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
20	NC_003112	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
21	NC_003112	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675951
22	NC_003112	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
23	NC_003112	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675951
24	NC_003112	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675951
25	NC_003112	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
26	NC_003112	ACG	2	6	2089	2094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675951
27	NC_003112	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
28	NC_003112	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675951
29	NC_003112	ATG	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
30	NC_003112	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675951
31	NC_003112	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675951
32	NC_003112	CGC	2	6	2462	2467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_003112	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675952
34	NC_003112	TCC	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15675952
35	NC_003112	CCG	2	6	2672	2677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675952
36	NC_003112	CAC	2	6	2709	2714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675952
37	NC_003112	TGT	2	6	2750	2755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675952
38	NC_003112	CCG	2	6	2832	2837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675952
39	NC_003112	CGG	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675952
40	NC_003112	CGG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675952
41	NC_003112	GCC	2	6	3198	3203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675953
42	NC_003112	GAT	2	6	3244	3249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675953
43	NC_003112	GCA	2	6	3262	3267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675953
44	NC_003112	ATC	2	6	3317	3322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675953
45	NC_003112	CAT	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675953
46	NC_003112	TTG	2	6	3363	3368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675953
47	NC_003112	GCG	2	6	3397	3402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675953
48	NC_003112	GCA	2	6	3426	3431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675953
49	NC_003112	TTC	2	6	3440	3445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675953
50	NC_003112	GGC	2	6	3458	3463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675953
51	NC_003112	TGC	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675953
52	NC_003112	TTA	2	6	3540	3545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003112	GCC	2	6	3668	3673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675954
54	NC_003112	ACA	2	6	3723	3728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675954
55	NC_003112	CGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675954
56	NC_003112	GCC	2	6	4286	4291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_003112	CCT	2	6	4305	4310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_003112	CGG	2	6	4346	4351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675955
59	NC_003112	CAA	2	6	4385	4390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675955
60	NC_003112	CCA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675955
61	NC_003112	CCG	2	6	4638	4643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675955
62	NC_003112	CGG	2	6	4727	4732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675955
63	NC_003112	AAC	3	9	4735	4743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675955
64	NC_003112	CGT	2	6	4763	4768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675955
65	NC_003112	CTG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675955
66	NC_003112	CGA	2	6	4793	4798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675955
67	NC_003112	GAC	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675955
68	NC_003112	CAT	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675956
69	NC_003112	AGC	2	6	5013	5018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675956
70	NC_003112	ATG	2	6	5054	5059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675956
71	NC_003112	CGC	2	6	5142	5147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
72	NC_003112	CCG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
73	NC_003112	CTG	2	6	5207	5212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675956
74	NC_003112	ACA	2	6	5232	5237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15675956
75	NC_003112	AGA	2	6	5254	5259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675956
76	NC_003112	GAA	2	6	5267	5272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675956
77	NC_003112	AGA	2	6	5569	5574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675956
78	NC_003112	CGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675956
79	NC_003112	CCG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
80	NC_003112	CCG	3	9	5661	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675956
81	NC_003112	GCT	2	6	5692	5697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675956
82	NC_003112	TTC	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675956
83	NC_003112	CCA	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675956
84	NC_003112	CAA	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_003112	TCA	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675957
86	NC_003112	GCC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675957
87	NC_003112	CGG	2	6	6186	6191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675957
88	NC_003112	AAT	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15675957
89	NC_003112	CGC	2	6	6286	6291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
90	NC_003112	CGC	3	9	6349	6357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
91	NC_003112	CGC	2	6	6404	6409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
92	NC_003112	CGC	3	9	6418	6426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
93	NC_003112	CGG	2	6	6538	6543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675958
94	NC_003112	ATC	2	6	6594	6599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675958
95	NC_003112	CAC	2	6	6629	6634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675958
96	NC_003112	CGG	2	6	6646	6651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675958
97	NC_003112	CAC	2	6	6662	6667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675958
98	NC_003112	CGG	2	6	6679	6684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675958
99	NC_003112	ACG	2	6	6699	6704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675958
100	NC_003112	GCC	2	6	6738	6743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
101	NC_003112	TTC	2	6	6767	6772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675958
102	NC_003112	CCG	3	9	6843	6851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675958
103	NC_003112	TGG	2	6	6901	6906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15675958
104	NC_003112	TGC	2	6	6913	6918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675958
105	NC_003112	AAG	2	6	7096	7101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675958
106	NC_003112	TCT	2	6	7132	7137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675958
107	NC_003112	TTG	2	6	7143	7148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675958
108	NC_003112	GCA	2	6	7162	7167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675958
109	NC_003112	GAC	2	6	7169	7174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675958
110	NC_003112	TCA	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675958
111	NC_003112	GTC	2	6	7391	7396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675958
112	NC_003112	CGC	2	6	7681	7686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675959
113	NC_003112	GAC	2	6	7735	7740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
114	NC_003112	CCA	2	6	7857	7862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675959
115	NC_003112	GAC	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
116	NC_003112	TCG	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675959
117	NC_003112	ACC	2	6	8078	8083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15675959
118	NC_003112	GAC	2	6	8140	8145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
119	NC_003112	CGT	2	6	8287	8292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675959
120	NC_003112	CGC	2	6	8308	8313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675959
121	NC_003112	CAG	2	6	8317	8322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
122	NC_003112	GCC	2	6	8332	8337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675959
123	NC_003112	GCC	2	6	8479	8484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675959
124	NC_003112	AGC	2	6	8657	8662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675959
125	NC_003112	TGG	2	6	8840	8845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003112	GGC	2	6	8881	8886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_003112	TGG	2	6	9197	9202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003112	GCT	2	6	9245	9250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_003112	AAG	2	6	9375	9380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15675960
130	NC_003112	CAG	2	6	9535	9540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675960
131	NC_003112	GGT	2	6	9604	9609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15675960
132	NC_003112	CGG	2	6	9621	9626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675960
133	NC_003112	GCG	2	6	9687	9692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675960
134	NC_003112	CAG	2	6	9778	9783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675960
135	NC_003112	CTG	2	6	9785	9790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675960
136	NC_003112	TCA	2	6	9825	9830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675960
137	NC_003112	CTG	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675960
138	NC_003112	CGA	2	6	9906	9911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675960
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142	NC_003112	TTC	2	6	10220	10225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15675960
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149	NC_003112	CGC	2	6	10736	10741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675961
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153	NC_003112	TCG	2	6	11082	11087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675962
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165	NC_003112	CGC	2	6	11548	11553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15675962
166	NC_003112	GCG	2	6	11591	11596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15675962
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259	NC_003112	GGC	2	6	19996	20001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77358701
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261	NC_003112	GTT	2	6	20113	20118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77358701
262	NC_003112	ACG	2	6	20147	20152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77358701
263	NC_003112	AGG	2	6	20199	20204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	77358701
264	NC_003112	TGT	2	6	20223	20228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77358701
265	NC_003112	ATG	2	6	20527	20532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_003112	ATG	2	6	20574	20579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_003112	CCG	2	6	20624	20629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
268	NC_003112	TCG	2	6	20658	20663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_003112	ATG	2	6	20776	20781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_003112	TCG	2	6	20860	20865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77358702
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275	NC_003112	TTG	2	6	21125	21130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77358702
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280	NC_003112	CCG	2	6	21356	21361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
281	NC_003112	TCG	2	6	21390	21395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_003112	GGT	2	6	21495	21500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77358703
283	NC_003112	TGT	2	6	21562	21567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77358703
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287	NC_003112	TTG	2	6	21778	21783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77358703
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291	NC_003112	ATC	2	6	22176	22181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77358704
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299	NC_003112	ATG	2	6	22584	22589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
300	NC_003112	ATG	2	6	22704	22709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_003112	CCG	2	6	22754	22759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
302	NC_003112	GGC	2	6	22900	22905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	77358705
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334	NC_003112	TTG	2	6	24251	24256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_003112	TGT	2	6	24606	24611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
338	NC_003112	GTT	2	6	24669	24674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15675969
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343	NC_003112	TGA	2	6	24976	24981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675969
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382	NC_003112	CGG	2	6	27843	27848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
383	NC_003112	GAG	2	6	27930	27935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15675971
384	NC_003112	ACG	2	6	27955	27960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675971
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