MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	ATGTTA	2	12	54	65	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003106	TCTTTT	2	12	243	254	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_003106	ATTTAT	2	12	8835	8846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003106	TTCCTA	2	12	25755	25766	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_003106	TAAATA	2	12	27174	27185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003106	GTTTTT	2	12	30661	30672	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003106	GGAAAG	2	12	32423	32434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003106	AAAAAC	2	12	32639	32650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_003106	CTTTAT	2	12	32918	32929	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_003106	TTTATT	2	12	34204	34215	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003106	GAGGAA	2	12	39474	39485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003106	AAAATT	2	12	86322	86333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003106	ACAAAA	2	12	96992	97003	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_003106	TAAATA	2	12	103448	103459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003106	GAAAAT	2	12	114840	114851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003106	AGTTAA	2	12	122140	122151	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003106	ATTATA	2	12	125714	125725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003106	TCAAAA	2	12	150385	150396	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_003106	TAAATA	2	12	164485	164496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003106	TATTAA	2	12	168567	168578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003106	TAACCA	2	12	168602	168613	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_003106	TAAAAA	2	12	168747	168758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003106	TACTTC	2	12	176224	176235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_003106	TTTTTA	2	12	182645	182656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003106	TGCTTA	2	12	182761	182772	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_003106	TCTGCT	2	12	187114	187125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_003106	AATTGA	2	12	231403	231414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003106	TTTATA	2	12	247718	247729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003106	GCTTTG	2	12	270120	270131	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_003106	ATAAAT	2	12	283898	283909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003106	AGGGGT	2	12	326086	326097	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003106	AGATGA	2	12	326141	326152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003106	GGTTTT	2	12	336031	336042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003106	GAGGAA	2	12	336077	336088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003106	TATAGC	2	12	356242	356253	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_003106	AAATAT	2	12	407825	407836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003106	AATTGG	2	12	421263	421274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003106	AAACTA	2	12	461628	461639	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_003106	ATAAAC	2	12	462542	462553	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_003106	CTTTAT	2	12	468236	468247	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_003106	GCAATT	2	12	484389	484400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_003106	ATTAAT	2	12	489918	489929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003106	CTAATG	2	12	489983	489994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_003106	TAAACT	2	12	502018	502029	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_003106	AATTTC	2	12	555591	555602	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_003106	AAAAAG	2	12	582093	582104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003106	CTATTT	2	12	591196	591207	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_003106	TTTTTC	2	12	598159	598170	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_003106	TTTTCT	2	12	618820	618831	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_003106	CCTTTC	2	12	643275	643286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_003106	AACAAT	2	12	650653	650664	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_003106	AAAATT	2	12	664722	664733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003106	ATAAAA	2	12	713262	713273	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003106	AAATTC	2	12	722615	722626	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_003106	ATTAGA	2	12	723539	723550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003106	TTTAAT	2	12	726495	726506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003106	ATGATA	2	12	733496	733507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003106	ATTCTA	2	12	765740	765751	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_003106	TTATAT	2	12	766808	766819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003106	ACTATA	2	12	767111	767122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_003106	TTTAAA	2	12	783286	783297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003106	AAAATT	2	12	802115	802126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003106	ATTTGT	2	12	813337	813348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003106	GAGTAA	2	12	839031	839042	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003106	TCTATC	2	12	846198	846209	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_003106	TTCTAA	2	12	887791	887802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_003106	TATATT	2	12	907033	907044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003106	TTATAC	2	12	907545	907556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_003106	ATTCTT	2	12	908610	908621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_003106	TAATAG	2	12	953112	953123	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003106	TACTCT	2	12	970115	970126	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003106	ATTTAA	2	12	999538	999549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003106	ATAATT	2	12	1031101	1031112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003106	CTCTTT	2	12	1032231	1032242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_003106	AAATAT	2	12	1034572	1034583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003106	ACTAAA	2	12	1036982	1036993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_003106	AGGGTG	2	12	1075053	1075064	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003106	TTTAAT	2	12	1088424	1088435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003106	AGTATA	2	12	1104577	1104588	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003106	AAAAAT	2	12	1105401	1105412	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003106	TAGGAG	2	12	1108127	1108138	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003106	TTTTAA	2	12	1116339	1116350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003106	CTTTGC	2	12	1119484	1119495	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_003106	ATTTAA	2	12	1140300	1140311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003106	AGCTTT	2	12	1144216	1144227	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_003106	TAGGAG	2	12	1178945	1178956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003106	TTTTTA	2	12	1192225	1192236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003106	AATATC	2	12	1193804	1193815	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_003106	TAAATA	2	12	1222936	1222947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003106	ATTTTT	3	18	1260401	1260418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003106	AACATA	2	12	1273629	1273640	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_003106	CAAGGA	2	12	1290706	1290717	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_003106	TAACAC	2	12	1305096	1305107	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_003106	GTGTTT	2	12	1344486	1344497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003106	GTTATT	2	12	1345419	1345430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003106	TATCTT	2	12	1366216	1366227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_003106	TTATAT	2	12	1366237	1366248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003106	TCTTAT	2	12	1384452	1384463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_003106	AGTTAT	2	12	1392593	1392604	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003106	TAAAAG	2	12	1433714	1433725	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003106	TTTTCC	2	12	1444400	1444411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_003106	TAAAAA	2	12	1521491	1521502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003106	TGATTA	2	12	1524842	1524853	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003106	AATTAT	2	12	1533687	1533698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003106	AAGTAA	2	12	1547327	1547338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003106	AAAATT	2	12	1547556	1547567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003106	AATTAT	2	12	1548392	1548403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003106	ATCTAT	2	12	1553094	1553105	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_003106	ATAAGG	2	12	1573767	1573778	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003106	ATTTGG	2	12	1582209	1582220	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003106	AATAAA	2	12	1587846	1587857	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003106	ATACTA	2	12	1596267	1596278	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_003106	AATATT	2	12	1601363	1601374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003106	TTTAAT	2	12	1617070	1617081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003106	TAAATA	2	12	1624846	1624857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003106	ATCAAA	2	12	1682921	1682932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_003106	TAATTA	2	12	1703549	1703560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003106	AAAAAT	2	12	1713826	1713837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003106	ATAAAA	2	12	1718691	1718702	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003106	GCTACC	2	12	1722037	1722048	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003106	TGATCT	2	12	1722598	1722609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_003106	TTGAAA	2	12	1736494	1736505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003106	TAAAAA	2	12	1743221	1743232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003106	TTTTAA	2	12	1748999	1749010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003106	AAATTA	2	12	1767083	1767094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003106	TATCGA	2	12	1790802	1790813	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_003106	TATATT	2	12	1802983	1802994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003106	ATATTT	2	12	1869552	1869563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003106	TTTTCT	2	12	1874920	1874931	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_003106	AAAATG	2	12	1879405	1879416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.