MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 1017

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	ACTCTA	2	12	6857	6868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
2	NC_003106	GCTGAT	2	12	8651	8662	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15920172
3	NC_003106	AGACCT	2	12	14629	14640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15920181
4	NC_003106	GATTTA	2	12	16564	16575	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15920182
5	NC_003106	TATTGA	2	12	21156	21167	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15920186
6	NC_003106	TCACCG	2	12	22160	22171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15920189
7	NC_003106	AAGGAG	2	12	31269	31280	50 %	0 %	50 %	0 %	15920194
8	NC_003106	TTAAAT	2	12	45052	45063	50 %	50 %	0 %	0 %	15920204
9	NC_003106	GCAGAA	2	12	45252	45263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15920204
10	NC_003106	TTAATT	2	12	51591	51602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920209
11	NC_003106	TCAACT	2	12	51987	51998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920210
12	NC_003106	AGGATA	2	12	52769	52780	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15920212
13	NC_003106	GATTAG	2	12	58871	58882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920218
14	NC_003106	TACATC	2	12	63120	63131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920224
15	NC_003106	AAATAA	2	12	67960	67971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15920228
16	NC_003106	AACATC	2	12	70850	70861	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15920230
17	NC_003106	TAAATA	2	12	71260	71271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920231
18	NC_003106	TTCTCT	2	12	79747	79758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920238
19	NC_003106	TCCTTC	2	12	79982	79993	0 %	50 %	0 %	50 %	15920238
20	NC_003106	TCTTGA	2	12	81982	81993	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15920241
21	NC_003106	TCCTAC	2	12	86681	86692	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15920244
22	NC_003106	CCAATT	2	12	87312	87323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920244
23	NC_003106	TATCTA	2	12	91700	91711	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15920248
24	NC_003106	TGGGAT	2	12	92336	92347	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15920248
25	NC_003106	AGAAAA	2	12	95446	95457	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15920251
26	NC_003106	TACGAA	2	12	97266	97277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15920253
27	NC_003106	GGTGTC	2	12	97695	97706	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15920254
28	NC_003106	GGGTTG	2	12	99370	99381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920255
29	NC_003106	AAGCTA	2	12	104297	104308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15920260
30	NC_003106	GATCTT	2	12	108325	108336	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15920263
31	NC_003106	AGTTGC	2	12	118874	118885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15920272
32	NC_003106	TTCTTT	2	12	122361	122372	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15920276
33	NC_003106	TAAATG	2	12	126222	126233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920281
34	NC_003106	TATTGC	2	12	127775	127786	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15920282
35	NC_003106	AGCATT	2	12	128045	128056	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15920282
36	NC_003106	TATAGT	2	12	129037	129048	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15920283
37	NC_003106	TTTAAT	2	12	129209	129220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920283
38	NC_003106	CCTAAT	2	12	136383	136394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920293
39	NC_003106	TCATTT	2	12	142773	142784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15920300
40	NC_003106	AGAATA	2	12	143712	143723	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920300
41	NC_003106	ATTGAA	2	12	147378	147389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920303
42	NC_003106	TGCACC	2	12	148006	148017	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15920304
43	NC_003106	TAGAGC	2	12	148726	148737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15920304
44	NC_003106	ACTTTT	2	12	149423	149434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15920305
45	NC_003106	CATTAG	2	12	150759	150770	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15920307
46	NC_003106	ACCAAT	2	12	154237	154248	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15920312
47	NC_003106	GTGCTT	2	12	155716	155727	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15920314
48	NC_003106	ATTTAT	2	12	158508	158519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920316
49	NC_003106	GGAAAT	2	12	161489	161500	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15920318
50	NC_003106	ACCACT	2	12	162410	162421	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15920319
51	NC_003106	GTATGA	2	12	162961	162972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920320
52	NC_003106	GCTTTG	2	12	163729	163740	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15920321
53	NC_003106	CATAAA	2	12	165513	165524	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15920323
54	NC_003106	ACCTAC	2	12	171532	171543	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15920327
55	NC_003106	TATCTC	2	12	179491	179502	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920332
56	NC_003106	CATCTT	2	12	181202	181213	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920333
57	NC_003106	TAGGAA	2	12	181927	181938	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15920334
58	NC_003106	TTAGCA	2	12	184025	184036	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15920335
59	NC_003106	ATCTAA	2	12	191032	191043	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15920341
60	NC_003106	GATTTA	2	12	195617	195628	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	161751105
61	NC_003106	TTTCCT	2	12	199448	199459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920353
62	NC_003106	TCATCT	2	12	200043	200054	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920353
63	NC_003106	TGAAAT	2	12	202365	202376	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920357
64	NC_003106	TCATCT	2	12	203692	203703	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920358
65	NC_003106	AATAAG	2	12	207893	207904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920362
66	NC_003106	AGATTA	2	12	214186	214197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920368
67	NC_003106	AGCCAT	2	12	214615	214626	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15920369
68	NC_003106	TTCTGT	2	12	215295	215306	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15920369
69	NC_003106	CTTTTA	2	12	215603	215614	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15920370
70	NC_003106	TCAGCT	2	12	218137	218148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	161751104
71	NC_003106	TAAACG	2	12	222497	222508	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15920379
72	NC_003106	AGCTCG	2	12	223890	223901	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15920381
73	NC_003106	TTCTAC	2	12	225863	225874	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920382
74	NC_003106	AAAGCA	2	12	228031	228042	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15920386
75	NC_003106	TAAAAG	2	12	228735	228746	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920386
76	NC_003106	TTTAGT	2	12	229177	229188	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15920388
77	NC_003106	TTCGCT	2	12	229530	229541	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15920388
78	NC_003106	TCTATC	2	12	229726	229737	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920388
79	NC_003106	AGAAAT	2	12	232315	232326	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920392
80	NC_003106	GTGAGA	2	12	232878	232889	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15920392
81	NC_003106	AGGGCT	2	12	233165	233176	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15920392
82	NC_003106	AAAGGA	2	12	233405	233416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920392
83	NC_003106	ATAGAG	2	12	236473	236484	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15920395
84	NC_003106	ATTGCT	2	12	239664	239675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15920398
85	NC_003106	AAAAGA	2	12	242411	242422	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15920402
86	NC_003106	AGAATT	2	12	242528	242539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920402
87	NC_003106	TGGAGC	2	12	243759	243770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15920403
88	NC_003106	TACTTC	2	12	244933	244944	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920404
89	NC_003106	TCTAGT	2	12	245721	245732	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15920404
90	NC_003106	ATTAAA	2	12	252940	252951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920412
91	NC_003106	GTAGAG	2	12	254361	254372	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15920415
92	NC_003106	TAAAAT	2	12	254950	254961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920415
93	NC_003106	AGTTAC	2	12	255151	255162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15920415
94	NC_003106	TAAAAT	2	12	257581	257592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920419
95	NC_003106	TCTATG	2	12	257820	257831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	161751103
96	NC_003106	TCTAAT	2	12	260590	260601	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15920423
97	NC_003106	AGCTTG	2	12	261813	261824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15920425
98	NC_003106	TTGCGA	2	12	269625	269636	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15920439
99	NC_003106	TAGGCA	2	12	275930	275941	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15920446
100	NC_003106	ATGAAA	2	12	276339	276350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920447
101	NC_003106	CTTAAA	2	12	278411	278422	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15920450
102	NC_003106	ATTTTT	2	12	282615	282626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15920456
103	NC_003106	TACTCT	2	12	284044	284055	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920457
104	NC_003106	CTACAC	2	12	284911	284922	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15920458
105	NC_003106	CTCTTT	2	12	285451	285462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920458
106	NC_003106	TACCTT	2	12	290594	290605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15920465
107	NC_003106	TACTAA	2	12	292728	292739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15920466
108	NC_003106	CTGGCT	2	12	292949	292960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920466
109	NC_003106	TCCTAA	2	12	296639	296650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920468
110	NC_003106	GAAAAA	2	12	299444	299455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15920472
111	NC_003106	GATTAA	2	12	301908	301919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920475
112	NC_003106	GTACAA	2	12	304816	304827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15920478
113	NC_003106	AGAAAA	2	12	308514	308525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15920481
114	NC_003106	AAAAAT	2	12	308545	308556	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15920481
115	NC_003106	TAGAAA	2	12	311920	311931	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920484
116	NC_003106	TGTTAT	2	12	313952	313963	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15920486
117	NC_003106	ATGAGA	2	12	314265	314276	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15920486
118	NC_003106	TTTCTT	2	12	316125	316136	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15920488
119	NC_003106	TCATTT	2	12	318510	318521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15920491
120	NC_003106	AATAAA	2	12	318947	318958	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15920491
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122	NC_003106	AAAATC	2	12	322143	322154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15920496
123	NC_003106	TTATTT	2	12	324391	324402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15920499
124	NC_003106	GAATAA	2	12	327618	327629	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15920507
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237	NC_003106	TTAGAA	2	12	585507	585518	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15920818
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353	NC_003106	TAAACC	2	12	943146	943157	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15921209
354	NC_003106	TTAGAT	2	12	951784	951795	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15921216
355	NC_003106	CAATAG	2	12	953639	953650	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15921217
356	NC_003106	TGAAGA	2	12	953922	953933	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15921217
357	NC_003106	CAGTAA	2	12	954358	954369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15921218
358	NC_003106	GCTTCA	2	12	956296	956307	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15921220
359	NC_003106	CTATAA	2	12	956343	956354	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15921220
360	NC_003106	AATGAA	2	12	959895	959906	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15921225
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369	NC_003106	TTAGTT	2	12	987462	987473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15921252
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373	NC_003106	CCTTAT	2	12	993861	993872	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15921257
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382	NC_003106	ATTTCT	2	12	1028648	1028659	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15921291
383	NC_003106	TACGAA	2	12	1030210	1030221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15921292
384	NC_003106	TTCTAT	2	12	1030624	1030635	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15921293
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454	NC_003106	TAGTTT	2	12	1223875	1223886	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15921486
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456	NC_003106	TAGTTC	2	12	1225057	1225068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15921487
457	NC_003106	GCTGTA	2	12	1225895	1225906	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161751094
458	NC_003106	ACAAAA	2	12	1226525	1226536	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	161751094
459	NC_003106	TCATAT	2	12	1234199	1234210	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15921496
460	NC_003106	GATATC	2	12	1235653	1235664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15921498
461	NC_003106	TCTTTT	2	12	1238956	1238967	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15921499
462	NC_003106	ATACCA	2	12	1240627	1240638	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15921502
463	NC_003106	TTTTAA	2	12	1242849	1242860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15921503
464	NC_003106	AAGATA	2	12	1244033	1244044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15921504
465	NC_003106	GAACTT	2	12	1244571	1244582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15921505
466	NC_003106	CATTAT	2	12	1246826	1246837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15921507
467	NC_003106	ATTAAC	2	12	1248151	1248162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15921509
468	NC_003106	TAGATG	2	12	1249243	1249254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15921510
469	NC_003106	TTTATA	2	12	1250538	1250549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15921511
470	NC_003106	AAAAGA	2	12	1251059	1251070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15921512
471	NC_003106	GGAAAT	2	12	1252883	1252894	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15921515
472	NC_003106	GAATGA	2	12	1257045	1257056	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15921521
473	NC_003106	CTCTCA	2	12	1257927	1257938	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15921522
474	NC_003106	ACAGCT	2	12	1263515	1263526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15921525
475	NC_003106	AAAGCT	2	12	1264578	1264589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15921527
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478	NC_003106	TCTTTT	2	12	1269960	1269971	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15921534
479	NC_003106	ACTTGT	2	12	1273385	1273396	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15921538
480	NC_003106	TTTTTC	2	12	1278212	1278223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15921545
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488	NC_003106	TCTTCC	2	12	1315699	1315710	0 %	50 %	0 %	50 %	15921579
489	NC_003106	TTGCGA	2	12	1318197	1318208	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15921583
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494	NC_003106	TACGAA	2	12	1324143	1324154	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15921591
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500	NC_003106	TACTAA	2	12	1352883	1352894	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15921626

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