MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 2581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	GGTGA	2	10	4425	4434	20 %	20 %	60 %	0 %	15920171
2	NC_003106	ATAAC	2	10	4612	4621	60 %	20 %	0 %	20 %	15920171
3	NC_003106	TGTCG	2	10	5450	5459	0 %	40 %	40 %	20 %	15920171
4	NC_003106	ATATC	2	10	5569	5578	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_003106	CAGTT	2	10	5849	5858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_003106	TCCCT	2	10	7577	7586	0 %	40 %	0 %	60 %	15920172
7	NC_003106	CTTCT	2	10	9398	9407	0 %	60 %	0 %	40 %	15920173
8	NC_003106	TCTTT	2	10	10423	10432	0 %	80 %	0 %	20 %	15920175
9	NC_003106	TAAAA	2	10	11879	11888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003106	GAATA	2	10	12293	12302	60 %	20 %	20 %	0 %	15920177
11	NC_003106	ACTTT	2	10	15630	15639	20 %	60 %	0 %	20 %	15920182
12	NC_003106	ACTTC	2	10	15704	15713	20 %	40 %	0 %	40 %	15920182
13	NC_003106	GAAGA	2	10	16687	16696	60 %	0 %	40 %	0 %	15920182
14	NC_003106	TAGAT	2	10	17052	17061	40 %	40 %	20 %	0 %	15920182
15	NC_003106	AACTT	2	10	17892	17901	40 %	40 %	0 %	20 %	15920183
16	NC_003106	GTTAA	2	10	18384	18393	40 %	40 %	20 %	0 %	15920183
17	NC_003106	GAAAG	2	10	19699	19708	60 %	0 %	40 %	0 %	15920185
18	NC_003106	AAAGA	2	10	20132	20141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003106	TTATG	2	10	20198	20207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003106	AAAGG	2	10	21055	21064	60 %	0 %	40 %	0 %	15920186
21	NC_003106	AGGAA	2	10	21795	21804	60 %	0 %	40 %	0 %	15920188
22	NC_003106	GTTTA	2	10	22415	22424	20 %	60 %	20 %	0 %	15920190
23	NC_003106	TTCTA	2	10	23368	23377	20 %	60 %	0 %	20 %	15920190
24	NC_003106	TATAT	2	10	23907	23916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003106	TTAAA	2	10	23974	23983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003106	CCGTA	2	10	25237	25246	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_003106	AACTC	2	10	26931	26940	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_003106	AATTC	2	10	27142	27151	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_003106	CCTTT	2	10	28664	28673	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_003106	GGTGA	2	10	29037	29046	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003106	GTTTT	2	10	30611	30620	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003106	TTTTC	2	10	30708	30717	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_003106	AATTC	2	10	32557	32566	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003106	AAAAC	2	10	32691	32700	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003106	TTATC	2	10	33454	33463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_003106	CTTTT	2	10	35031	35040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_003106	TATCT	2	10	35621	35630	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_003106	ATTTA	2	10	36266	36275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003106	GTAAT	2	10	37407	37416	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003106	GAAAG	2	10	38346	38355	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003106	CAACA	2	10	38497	38506	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_003106	TTATC	2	10	39961	39970	20 %	60 %	0 %	20 %	15920198
43	NC_003106	AAGCG	2	10	40085	40094	40 %	0 %	40 %	20 %	15920198
44	NC_003106	TGTTA	2	10	41854	41863	20 %	60 %	20 %	0 %	15920200
45	NC_003106	TATGT	2	10	42412	42421	20 %	60 %	20 %	0 %	15920201
46	NC_003106	TAAAA	2	10	44277	44286	80 %	20 %	0 %	0 %	15920203
47	NC_003106	TTATA	2	10	47173	47182	40 %	60 %	0 %	0 %	15920206
48	NC_003106	ACTTA	2	10	47391	47400	40 %	40 %	0 %	20 %	15920206
49	NC_003106	AGTAA	2	10	48625	48634	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003106	CTAAA	2	10	49353	49362	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003106	CTAAG	2	10	52477	52486	40 %	20 %	20 %	20 %	15920211
52	NC_003106	TGATA	2	10	53683	53692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003106	TACGT	2	10	55241	55250	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003106	AAGAA	2	10	56030	56039	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003106	ATCCT	2	10	56493	56502	20 %	40 %	0 %	40 %	15920215
56	NC_003106	TCCTC	2	10	57114	57123	0 %	40 %	0 %	60 %	15920217
57	NC_003106	ATTTC	2	10	59879	59888	20 %	60 %	0 %	20 %	15920221
58	NC_003106	TATAT	2	10	60558	60567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003106	ATAGT	2	10	61984	61993	40 %	40 %	20 %	0 %	15920223
60	NC_003106	GGGTA	2	10	62166	62175	20 %	20 %	60 %	0 %	15920223
61	NC_003106	TCCTT	2	10	62483	62492	0 %	60 %	0 %	40 %	15920223
62	NC_003106	TTTCT	2	10	65311	65320	0 %	80 %	0 %	20 %	15920225
63	NC_003106	ACCTA	2	10	66633	66642	40 %	20 %	0 %	40 %	15920227
64	NC_003106	GTTCT	2	10	67941	67950	0 %	60 %	20 %	20 %	15920228
65	NC_003106	CTTTC	2	10	68576	68585	0 %	60 %	0 %	40 %	15920229
66	NC_003106	ACCTC	2	10	69139	69148	20 %	20 %	0 %	60 %	15920229
67	NC_003106	TCTAC	2	10	69860	69869	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003106	TAAGG	2	10	72556	72565	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003106	AAGAT	2	10	72909	72918	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003106	GTCCG	2	10	73216	73225	0 %	20 %	40 %	40 %	15920233
71	NC_003106	GGGAT	2	10	73883	73892	20 %	20 %	60 %	0 %	15920233
72	NC_003106	ATAAA	2	10	74479	74488	80 %	20 %	0 %	0 %	15920234
73	NC_003106	GGTAT	2	10	75035	75044	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003106	TCTTT	2	10	77238	77247	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_003106	ATAAA	2	10	80658	80667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003106	TTAAC	2	10	80718	80727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_003106	AAGGT	2	10	81252	81261	40 %	20 %	40 %	0 %	15920240
78	NC_003106	TACCT	2	10	84435	84444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_003106	ATAAA	2	10	86970	86979	80 %	20 %	0 %	0 %	15920244
80	NC_003106	AATTA	2	10	89445	89454	60 %	40 %	0 %	0 %	15920246
81	NC_003106	GGAAG	2	10	92975	92984	40 %	0 %	60 %	0 %	15920248
82	NC_003106	TGATA	2	10	93009	93018	40 %	40 %	20 %	0 %	15920248
83	NC_003106	AAGGG	2	10	93718	93727	40 %	0 %	60 %	0 %	15920249
84	NC_003106	AACGA	2	10	94171	94180	60 %	0 %	20 %	20 %	15920250
85	NC_003106	GTAAA	2	10	96119	96128	60 %	20 %	20 %	0 %	15920252
86	NC_003106	TTTTA	2	10	97045	97054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003106	ATATA	2	10	97618	97627	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003106	GAAAA	2	10	97885	97894	80 %	0 %	20 %	0 %	15920254
89	NC_003106	AAAGT	2	10	98080	98089	60 %	20 %	20 %	0 %	15920254
90	NC_003106	AGTTA	2	10	98438	98447	40 %	40 %	20 %	0 %	15920254
91	NC_003106	AGATA	2	10	98562	98571	60 %	20 %	20 %	0 %	15920254
92	NC_003106	TCAAT	2	10	99843	99852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_003106	GCATG	2	10	102581	102590	20 %	20 %	40 %	20 %	15920258
94	NC_003106	TTACT	2	10	103221	103230	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_003106	ATTGT	2	10	103842	103851	20 %	60 %	20 %	0 %	15920260
96	NC_003106	AATTA	2	10	103899	103908	60 %	40 %	0 %	0 %	15920260
97	NC_003106	AATTA	2	10	105138	105147	60 %	40 %	0 %	0 %	15920260
98	NC_003106	GGAAT	2	10	107667	107676	40 %	20 %	40 %	0 %	15920263
99	NC_003106	ACTTT	2	10	110804	110813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_003106	CAATT	2	10	110970	110979	40 %	40 %	0 %	20 %	15920267
101	NC_003106	GATGT	2	10	112770	112779	20 %	40 %	40 %	0 %	15920268
102	NC_003106	TGGGA	2	10	112791	112800	20 %	20 %	60 %	0 %	15920268
103	NC_003106	TTACA	2	10	113188	113197	40 %	40 %	0 %	20 %	15920268
104	NC_003106	AAAAT	2	10	113520	113529	80 %	20 %	0 %	0 %	15920269
105	NC_003106	AAGTA	2	10	113713	113722	60 %	20 %	20 %	0 %	15920269
106	NC_003106	TTTTC	2	10	114028	114037	0 %	80 %	0 %	20 %	15920269
107	NC_003106	ATTTT	2	10	117069	117078	20 %	80 %	0 %	0 %	15920271
108	NC_003106	AAGTG	2	10	118275	118284	40 %	20 %	40 %	0 %	15920271
109	NC_003106	TGATA	2	10	119147	119156	40 %	40 %	20 %	0 %	15920272
110	NC_003106	TGCAA	2	10	119441	119450	40 %	20 %	20 %	20 %	15920272
111	NC_003106	GAAAA	3	15	120839	120853	80 %	0 %	20 %	0 %	15920275
112	NC_003106	CATAA	2	10	122403	122412	60 %	20 %	0 %	20 %	15920276
113	NC_003106	AAATA	2	10	122751	122760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003106	TAAGA	2	10	122867	122876	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003106	TAACG	2	10	123034	123043	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_003106	CAAGA	2	10	123263	123272	60 %	0 %	20 %	20 %	15920277
117	NC_003106	TCCTT	2	10	124212	124221	0 %	60 %	0 %	40 %	15920278
118	NC_003106	AAGAT	2	10	124824	124833	60 %	20 %	20 %	0 %	15920279
119	NC_003106	ACTAT	2	10	130031	130040	40 %	40 %	0 %	20 %	15920284
120	NC_003106	TTTAG	2	10	130840	130849	20 %	60 %	20 %	0 %	15920286
121	NC_003106	CCATG	2	10	131885	131894	20 %	20 %	20 %	40 %	15920287
122	NC_003106	TAATG	2	10	134062	134071	40 %	40 %	20 %	0 %	15920290
123	NC_003106	GATAA	2	10	135412	135421	60 %	20 %	20 %	0 %	15920293
124	NC_003106	TAAGT	2	10	136802	136811	40 %	40 %	20 %	0 %	15920294
125	NC_003106	ATTAT	2	10	137209	137218	40 %	60 %	0 %	0 %	15920294
126	NC_003106	GTAGA	2	10	137946	137955	40 %	20 %	40 %	0 %	15920295
127	NC_003106	TCTAG	2	10	139127	139136	20 %	40 %	20 %	20 %	15920296
128	NC_003106	ATTTC	2	10	140781	140790	20 %	60 %	0 %	20 %	15920298
129	NC_003106	AAGTA	2	10	141842	141851	60 %	20 %	20 %	0 %	15920300
130	NC_003106	ATCTA	2	10	141866	141875	40 %	40 %	0 %	20 %	15920300
131	NC_003106	TTATT	2	10	141952	141961	20 %	80 %	0 %	0 %	15920300
132	NC_003106	TTTAT	2	10	142185	142194	20 %	80 %	0 %	0 %	15920300
133	NC_003106	GAAAA	2	10	144174	144183	80 %	0 %	20 %	0 %	15920301
134	NC_003106	ATGTT	2	10	144881	144890	20 %	60 %	20 %	0 %	15920301
135	NC_003106	ATTTA	2	10	145440	145449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003106	TTACG	2	10	145608	145617	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_003106	ATATA	2	10	150592	150601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003106	ATTTA	2	10	150655	150664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003106	TTACT	2	10	151286	151295	20 %	60 %	0 %	20 %	15920307
140	NC_003106	CTTTT	2	10	151537	151546	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_003106	CATAA	2	10	152252	152261	60 %	20 %	0 %	20 %	15920309
142	NC_003106	AAATA	2	10	152654	152663	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003106	AAAAT	2	10	152776	152785	80 %	20 %	0 %	0 %	15920310
144	NC_003106	CCATG	2	10	153734	153743	20 %	20 %	20 %	40 %	15920312
145	NC_003106	AAAAG	2	10	157475	157484	80 %	0 %	20 %	0 %	15920315
146	NC_003106	TGATT	2	10	159153	159162	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003106	ATTTT	2	10	159263	159272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003106	ATTAA	2	10	159279	159288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003106	AGCTG	2	10	160897	160906	20 %	20 %	40 %	20 %	15920318
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151	NC_003106	ATTTT	2	10	162685	162694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003106	CTAGG	2	10	163192	163201	20 %	20 %	40 %	20 %	15920320
153	NC_003106	TAATT	2	10	164365	164374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_003106	ATATA	2	10	165599	165608	60 %	40 %	0 %	0 %	15920323
155	NC_003106	AAAAT	2	10	165959	165968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_003106	TAAGG	2	10	167229	167238	40 %	20 %	40 %	0 %	15920324
157	NC_003106	CTTTT	2	10	167461	167470	0 %	80 %	0 %	20 %	15920324
158	NC_003106	TAAAC	2	10	168375	168384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_003106	TTGTA	2	10	169045	169054	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_003106	TCTTT	2	10	170310	170319	0 %	80 %	0 %	20 %	15920326
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164	NC_003106	TATTG	2	10	173412	173421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_003106	TACGT	2	10	173935	173944	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_003106	TCTTT	2	10	176823	176832	0 %	80 %	0 %	20 %	15920330
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168	NC_003106	TTTAC	2	10	177646	177655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_003106	ATAAA	2	10	178978	178987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003106	CCAAG	2	10	179217	179226	40 %	0 %	20 %	40 %	15920332
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174	NC_003106	AACTA	2	10	186655	186664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
175	NC_003106	CACGA	2	10	187255	187264	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_003106	CTGAC	2	10	187292	187301	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
177	NC_003106	TTACC	2	10	189691	189700	20 %	40 %	0 %	40 %	15920340
178	NC_003106	TTACT	2	10	190634	190643	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_003106	CAAGA	2	10	192094	192103	60 %	0 %	20 %	20 %	15920343
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181	NC_003106	TATTT	2	10	194241	194250	20 %	80 %	0 %	0 %	15920346
182	NC_003106	CAGAA	2	10	195323	195332	60 %	0 %	20 %	20 %	15920347
183	NC_003106	TTTTC	2	10	195600	195609	0 %	80 %	0 %	20 %	161751105
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185	NC_003106	AAGTT	2	10	197159	197168	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_003106	TGATA	2	10	199166	199175	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_003106	TTTTA	2	10	199252	199261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_003106	TATTT	2	10	211875	211884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_003106	ACCAT	2	10	218439	218448	40 %	20 %	0 %	40 %	161751104
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205	NC_003106	TAAAA	2	10	220962	220971	80 %	20 %	0 %	0 %	15920376
206	NC_003106	AATTA	2	10	221746	221755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_003106	AATTA	2	10	223439	223448	60 %	40 %	0 %	0 %	15920380
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210	NC_003106	CCATA	2	10	224531	224540	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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223	NC_003106	TAAAT	2	10	234890	234899	60 %	40 %	0 %	0 %	15920394
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232	NC_003106	CTGAT	2	10	244748	244757	20 %	40 %	20 %	20 %	15920403
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251	NC_003106	ATATT	2	10	261782	261791	40 %	60 %	0 %	0 %	15920425
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253	NC_003106	GTAAA	2	10	265188	265197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_003106	ACTAT	2	10	265236	265245	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_003106	TTATT	2	10	272051	272060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_003106	CTTCA	2	10	274784	274793	20 %	40 %	0 %	40 %	15920445
263	NC_003106	TAGAA	2	10	275832	275841	60 %	20 %	20 %	0 %	15920446
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267	NC_003106	TATGT	2	10	281120	281129	20 %	60 %	20 %	0 %	15920454
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270	NC_003106	TCTAC	2	10	284892	284901	20 %	40 %	0 %	40 %	15920458
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273	NC_003106	CATTA	2	10	286095	286104	40 %	40 %	0 %	20 %	15920459
274	NC_003106	CTTTT	2	10	287188	287197	0 %	80 %	0 %	20 %	15920461
275	NC_003106	TACAA	2	10	287662	287671	60 %	20 %	0 %	20 %	161751102
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