MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 7880

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	GTTT	2	8	9	16	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003106	AAGA	2	8	285	292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003106	TTTC	2	8	729	736	0 %	75 %	0 %	25 %	15920164
4	NC_003106	AAGG	2	8	1123	1130	50 %	0 %	50 %	0 %	15920164
5	NC_003106	ATAA	2	8	1725	1732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003106	AGTT	2	8	2312	2319	25 %	50 %	25 %	0 %	15920166
7	NC_003106	TATC	2	8	2459	2466	25 %	50 %	0 %	25 %	15920166
8	NC_003106	TAAG	3	12	2649	2660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003106	AGGA	2	8	2747	2754	50 %	0 %	50 %	0 %	15920168
10	NC_003106	TTCT	2	8	2770	2777	0 %	75 %	0 %	25 %	15920168
11	NC_003106	CAAA	2	8	2802	2809	75 %	0 %	0 %	25 %	15920168
12	NC_003106	CTTC	2	8	2998	3005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003106	AAAG	2	8	3207	3214	75 %	0 %	25 %	0 %	15920169
14	NC_003106	AGAA	2	8	4055	4062	75 %	0 %	25 %	0 %	15920171
15	NC_003106	CAGA	2	8	4219	4226	50 %	0 %	25 %	25 %	15920171
16	NC_003106	TTAG	2	8	4314	4321	25 %	50 %	25 %	0 %	15920171
17	NC_003106	GAAA	2	8	4585	4592	75 %	0 %	25 %	0 %	15920171
18	NC_003106	TTCA	2	8	4664	4671	25 %	50 %	0 %	25 %	15920171
19	NC_003106	TAAC	2	8	4924	4931	50 %	25 %	0 %	25 %	15920171
20	NC_003106	GGGA	2	8	5063	5070	25 %	0 %	75 %	0 %	15920171
21	NC_003106	AATT	2	8	5116	5123	50 %	50 %	0 %	0 %	15920171
22	NC_003106	ATAA	2	8	5651	5658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003106	TTAG	2	8	6043	6050	25 %	50 %	25 %	0 %	15920172
24	NC_003106	TTAA	2	8	6706	6713	50 %	50 %	0 %	0 %	15920172
25	NC_003106	TCTT	2	8	6896	6903	0 %	75 %	0 %	25 %	15920172
26	NC_003106	TTTA	2	8	8634	8641	25 %	75 %	0 %	0 %	15920172
27	NC_003106	ATTA	2	8	8968	8975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003106	AATG	2	8	9028	9035	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003106	TACT	2	8	9063	9070	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003106	TTCT	2	8	9362	9369	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_003106	AGTA	2	8	9930	9937	50 %	25 %	25 %	0 %	15920174
32	NC_003106	CAAT	2	8	10455	10462	50 %	25 %	0 %	25 %	15920175
33	NC_003106	TCCT	2	8	10488	10495	0 %	50 %	0 %	50 %	15920175
34	NC_003106	TTAA	2	8	10673	10680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003106	TTTC	2	8	11231	11238	0 %	75 %	0 %	25 %	15920176
36	NC_003106	TCTT	2	8	11596	11603	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003106	AAAT	2	8	11966	11973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003106	TTTC	2	8	12073	12080	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_003106	AGTA	2	8	12251	12258	50 %	25 %	25 %	0 %	15920177
40	NC_003106	ATAG	2	8	12513	12520	50 %	25 %	25 %	0 %	15920177
41	NC_003106	GAAA	2	8	12560	12567	75 %	0 %	25 %	0 %	15920177
42	NC_003106	ATAA	2	8	12579	12586	75 %	25 %	0 %	0 %	15920177
43	NC_003106	AATA	2	8	13122	13129	75 %	25 %	0 %	0 %	15920178
44	NC_003106	GAAA	2	8	13256	13263	75 %	0 %	25 %	0 %	15920178
45	NC_003106	TATT	2	8	13282	13289	25 %	75 %	0 %	0 %	15920178
46	NC_003106	GTAG	2	8	14347	14354	25 %	25 %	50 %	0 %	15920180
47	NC_003106	TGCT	2	8	14559	14566	0 %	50 %	25 %	25 %	15920181
48	NC_003106	GGAA	2	8	14889	14896	50 %	0 %	50 %	0 %	15920181
49	NC_003106	AAAG	2	8	15165	15172	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003106	GAAG	2	8	15454	15461	50 %	0 %	50 %	0 %	15920182
51	NC_003106	AAAG	3	12	15463	15474	75 %	0 %	25 %	0 %	15920182
52	NC_003106	GACT	2	8	16004	16011	25 %	25 %	25 %	25 %	15920182
53	NC_003106	TGAA	2	8	16751	16758	50 %	25 %	25 %	0 %	15920182
54	NC_003106	TAAG	2	8	16826	16833	50 %	25 %	25 %	0 %	15920182
55	NC_003106	TACT	2	8	16846	16853	25 %	50 %	0 %	25 %	15920182
56	NC_003106	TTCT	2	8	17162	17169	0 %	75 %	0 %	25 %	15920182
57	NC_003106	TAGT	2	8	17294	17301	25 %	50 %	25 %	0 %	15920182
58	NC_003106	TAGT	2	8	17591	17598	25 %	50 %	25 %	0 %	15920182
59	NC_003106	AAGA	2	8	17620	17627	75 %	0 %	25 %	0 %	15920182
60	NC_003106	AAAC	2	8	17675	17682	75 %	0 %	0 %	25 %	15920182
61	NC_003106	AGGA	2	8	17788	17795	50 %	0 %	50 %	0 %	15920182
62	NC_003106	AAAT	2	8	18196	18203	75 %	25 %	0 %	0 %	15920183
63	NC_003106	ATTT	2	8	18897	18904	25 %	75 %	0 %	0 %	15920184
64	NC_003106	GGTT	2	8	19240	19247	0 %	50 %	50 %	0 %	15920184
65	NC_003106	TGAA	2	8	19292	19299	50 %	25 %	25 %	0 %	15920184
66	NC_003106	ACTA	2	8	20063	20070	50 %	25 %	0 %	25 %	15920185
67	NC_003106	CTTA	2	8	20339	20346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_003106	AGTA	2	8	20770	20777	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003106	TTTC	2	8	20995	21002	0 %	75 %	0 %	25 %	15920186
70	NC_003106	GAAA	2	8	21339	21346	75 %	0 %	25 %	0 %	15920186
71	NC_003106	CAAA	2	8	23821	23828	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_003106	TGTC	2	8	24107	24114	0 %	50 %	25 %	25 %	15920191
73	NC_003106	TTAA	2	8	24740	24747	50 %	50 %	0 %	0 %	15920191
74	NC_003106	GCTT	2	8	24899	24906	0 %	50 %	25 %	25 %	15920191
75	NC_003106	TTTC	2	8	26101	26108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_003106	ATCT	2	8	26690	26697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_003106	TTTC	2	8	26887	26894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003106	CAGA	2	8	28092	28099	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_003106	TCCT	2	8	28228	28235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_003106	TAAA	2	8	28467	28474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003106	TTTC	2	8	28480	28487	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_003106	CTTC	2	8	28517	28524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_003106	CAGT	2	8	29473	29480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_003106	ATCT	2	8	29712	29719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_003106	AGAA	2	8	29862	29869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003106	TTTC	2	8	30328	30335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_003106	TGAT	2	8	33106	33113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003106	TCAT	2	8	33756	33763	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_003106	CAGA	2	8	33895	33902	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_003106	TTTC	2	8	34676	34683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_003106	TTAA	2	8	35483	35490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003106	AGTG	2	8	35813	35820	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003106	CTAA	2	8	37020	37027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_003106	AATG	2	8	38242	38249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003106	AATG	2	8	38378	38385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003106	TTTG	2	8	38639	38646	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003106	TAAA	2	8	39339	39346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003106	GAAA	2	8	39635	39642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003106	GAAG	2	8	39831	39838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003106	AATT	2	8	39859	39866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003106	ATAG	2	8	39897	39904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003106	ATAG	2	8	39942	39949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003106	CTAA	2	8	41167	41174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_003106	TTAT	2	8	41456	41463	25 %	75 %	0 %	0 %	15920200
105	NC_003106	TATT	2	8	41577	41584	25 %	75 %	0 %	0 %	15920200
106	NC_003106	TTTC	2	8	42568	42575	0 %	75 %	0 %	25 %	15920202
107	NC_003106	GATA	2	8	43049	43056	50 %	25 %	25 %	0 %	15920202
108	NC_003106	AAGA	2	8	43194	43201	75 %	0 %	25 %	0 %	15920202
109	NC_003106	AGAT	2	8	43414	43421	50 %	25 %	25 %	0 %	15920202
110	NC_003106	AGTT	2	8	43774	43781	25 %	50 %	25 %	0 %	15920203
111	NC_003106	CTAA	2	8	44105	44112	50 %	25 %	0 %	25 %	15920203
112	NC_003106	AAGA	2	8	44189	44196	75 %	0 %	25 %	0 %	15920203
113	NC_003106	CTAG	2	8	44305	44312	25 %	25 %	25 %	25 %	15920204
114	NC_003106	AAGG	2	8	46724	46731	50 %	0 %	50 %	0 %	15920205
115	NC_003106	AAAC	2	8	47437	47444	75 %	0 %	0 %	25 %	15920206
116	NC_003106	GGAA	2	8	47776	47783	50 %	0 %	50 %	0 %	15920207
117	NC_003106	TGAT	2	8	47870	47877	25 %	50 %	25 %	0 %	15920207
118	NC_003106	TTTA	2	8	48493	48500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003106	CTTA	2	8	48541	48548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_003106	GAGG	2	8	48746	48753	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003106	TAAT	2	8	48976	48983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003106	GAAA	2	8	49630	49637	75 %	0 %	25 %	0 %	15920208
123	NC_003106	CTTA	2	8	50143	50150	25 %	50 %	0 %	25 %	15920208
124	NC_003106	TAAA	2	8	50319	50326	75 %	25 %	0 %	0 %	15920208
125	NC_003106	TAAC	2	8	50469	50476	50 %	25 %	0 %	25 %	15920208
126	NC_003106	TTAT	2	8	51401	51408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003106	AACA	2	8	51682	51689	75 %	0 %	0 %	25 %	15920209
128	NC_003106	AATC	2	8	51852	51859	50 %	25 %	0 %	25 %	15920209
129	NC_003106	TTAG	2	8	52123	52130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003106	TTCC	2	8	52198	52205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_003106	AATT	2	8	52735	52742	50 %	50 %	0 %	0 %	15920211
132	NC_003106	AACT	2	8	53057	53064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_003106	TAGT	2	8	53238	53245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003106	TACA	2	8	53396	53403	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_003106	GAAG	2	8	53695	53702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003106	TTAT	2	8	54232	54239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003106	TAGT	2	8	54640	54647	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003106	TTAC	2	8	55208	55215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_003106	AAAT	2	8	55350	55357	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003106	ATAG	2	8	55832	55839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003106	CTAA	2	8	55983	55990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_003106	AATA	2	8	56040	56047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003106	TTTA	2	8	57295	57302	25 %	75 %	0 %	0 %	15920217
144	NC_003106	AGGT	2	8	57429	57436	25 %	25 %	50 %	0 %	15920217
145	NC_003106	TCCT	2	8	57466	57473	0 %	50 %	0 %	50 %	15920217
146	NC_003106	AGTT	2	8	57804	57811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003106	CACC	2	8	58004	58011	25 %	0 %	0 %	75 %	15920218
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149	NC_003106	CCTT	2	8	59095	59102	0 %	50 %	0 %	50 %	15920219
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