MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 41053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	GCT	2	6	2	7	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003106	TAT	2	6	94	99	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003106	TAT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003106	CTC	2	6	259	264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_003106	ATA	2	6	358	363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003106	TTA	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920164
7	NC_003106	AGA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920164
8	NC_003106	TAA	2	6	913	918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920164
9	NC_003106	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920164
10	NC_003106	GAA	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920164
11	NC_003106	TTC	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920164
12	NC_003106	TAA	2	6	1317	1322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920164
13	NC_003106	TTA	2	6	1388	1393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920164
14	NC_003106	AGT	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920164
15	NC_003106	AAT	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920164
16	NC_003106	CTG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920164
17	NC_003106	AGT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920164
18	NC_003106	TTG	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003106	GAA	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003106	AAG	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003106	TTA	2	6	1855	1860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003106	CTT	2	6	1907	1912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920165
23	NC_003106	CTT	2	6	1928	1933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920165
24	NC_003106	ATA	2	6	2088	2093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920165
25	NC_003106	TTC	2	6	2145	2150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920165
26	NC_003106	CCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920165
27	NC_003106	TCT	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003106	ATT	2	6	2271	2276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920166
29	NC_003106	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920166
30	NC_003106	TCT	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920166
31	NC_003106	TCT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920166
32	NC_003106	CTC	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920166
33	NC_003106	TCC	3	9	2384	2392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920166
34	NC_003106	TAA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920166
35	NC_003106	GAT	2	6	2578	2583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003106	TTA	2	6	2632	2637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003106	TCA	2	6	2671	2676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_003106	TGG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920168
39	NC_003106	AAG	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920168
40	NC_003106	TAA	2	6	2889	2894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920168
41	NC_003106	TTA	2	6	2938	2943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003106	TTA	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003106	AGG	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920169
44	NC_003106	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920169
45	NC_003106	AGT	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920169
46	NC_003106	CTC	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920169
47	NC_003106	TTC	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920169
48	NC_003106	TGT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920169
49	NC_003106	AGT	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003106	TCT	2	6	3628	3633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_003106	TTA	2	6	3716	3721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003106	GAA	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
53	NC_003106	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
54	NC_003106	ATT	3	9	3956	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920171
55	NC_003106	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920171
56	NC_003106	ATC	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920171
57	NC_003106	TGG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920171
58	NC_003106	TGA	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
59	NC_003106	CAA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920171
60	NC_003106	AGA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
61	NC_003106	TAA	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920171
62	NC_003106	GAA	2	6	4599	4604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
63	NC_003106	TTG	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920171
64	NC_003106	AGA	2	6	4693	4698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
65	NC_003106	TGA	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
66	NC_003106	ATG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
67	NC_003106	TTG	2	6	4896	4901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920171
68	NC_003106	GGT	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920171
69	NC_003106	GAG	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920171
70	NC_003106	AAG	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
71	NC_003106	TTA	2	6	5082	5087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920171
72	NC_003106	GAG	2	6	5199	5204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920171
73	NC_003106	ATG	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
74	NC_003106	ATG	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
75	NC_003106	AGA	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
76	NC_003106	ATT	2	6	5559	5564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003106	ATC	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_003106	AAT	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003106	GAA	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003106	TCC	2	6	6094	6099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
81	NC_003106	ATC	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
82	NC_003106	CTT	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
83	NC_003106	TAC	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
84	NC_003106	TTA	2	6	6502	6507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
85	NC_003106	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
86	NC_003106	TTC	2	6	6622	6627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
87	NC_003106	TTA	2	6	6778	6783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
88	NC_003106	TCT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
89	NC_003106	TGT	2	6	7039	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920172
90	NC_003106	TAG	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
91	NC_003106	ATT	2	6	7083	7088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
92	NC_003106	ATT	2	6	7113	7118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
93	NC_003106	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
94	NC_003106	AGA	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
95	NC_003106	ACT	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
96	NC_003106	TTA	2	6	7400	7405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
97	NC_003106	AGT	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
98	NC_003106	AGT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
99	NC_003106	GAG	2	6	7500	7505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920172
100	NC_003106	TCC	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
101	NC_003106	ACT	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
102	NC_003106	CTC	2	6	7702	7707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
103	NC_003106	TTG	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920172
104	NC_003106	ATG	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
105	NC_003106	CTA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
106	NC_003106	AAG	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
107	NC_003106	ATC	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
108	NC_003106	TAC	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
109	NC_003106	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
110	NC_003106	TAA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920172
111	NC_003106	CTA	3	9	8240	8248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
112	NC_003106	CTT	2	6	8259	8264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
113	NC_003106	AAG	2	6	8266	8271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
114	NC_003106	TTC	2	6	8302	8307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
115	NC_003106	CAT	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
116	NC_003106	ATA	2	6	8463	8468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920172
117	NC_003106	CCT	2	6	8587	8592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
118	NC_003106	TAC	2	6	8607	8612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
119	NC_003106	GTA	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
120	NC_003106	GAA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
121	NC_003106	TAA	2	6	8820	8825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003106	TCA	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_003106	TCT	2	6	8946	8951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003106	AAT	2	6	9018	9023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003106	CTA	2	6	9138	9143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_003106	TTA	2	6	9150	9155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003106	CTC	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_003106	TAT	2	6	9236	9241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003106	ACA	2	6	9577	9582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_003106	ATA	2	6	9729	9734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003106	TAT	2	6	9778	9783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003106	GAT	2	6	9837	9842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920174
133	NC_003106	ATC	2	6	9886	9891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920174
134	NC_003106	TCA	3	9	9904	9912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920174
135	NC_003106	CAT	2	6	9975	9980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920174
136	NC_003106	ATT	2	6	10035	10040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920174
137	NC_003106	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920174
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141	NC_003106	CAA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920175
142	NC_003106	TTC	2	6	10266	10271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920175
143	NC_003106	TTC	2	6	10309	10314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920175
144	NC_003106	TCC	2	6	10325	10330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920175
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149	NC_003106	CCT	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920175
150	NC_003106	TTA	2	6	10728	10733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003106	TGG	2	6	10759	10764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003106	GTT	2	6	10772	10777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003106	TCA	2	6	10822	10827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920176
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163	NC_003106	TAT	2	6	11516	11521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_003106	ATC	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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264	NC_003106	TAA	2	6	18855	18860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920184
265	NC_003106	AAG	2	6	18973	18978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920184
266	NC_003106	GTA	2	6	19034	19039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920184
267	NC_003106	TGT	2	6	19092	19097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920184
268	NC_003106	AAC	2	6	19172	19177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920184
269	NC_003106	TAA	2	6	19211	19216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920184
270	NC_003106	TGA	2	6	19377	19382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920184
271	NC_003106	GAA	2	6	19418	19423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920184
272	NC_003106	AGC	2	6	19542	19547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920185
273	NC_003106	ACT	2	6	19569	19574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920185
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280	NC_003106	AAT	2	6	20384	20389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_003106	CTC	2	6	20635	20640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_003106	TTA	2	6	20703	20708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_003106	CTG	2	6	21681	21686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920187
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291	NC_003106	TGA	2	6	21915	21920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920188
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386	NC_003106	TCA	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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393	NC_003106	TCA	2	6	29077	29082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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395	NC_003106	TCA	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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