MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 6200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	GCT	2	6	2	7	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_003106	TAT	2	6	94	99	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003106	TAT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003106	CTC	2	6	259	264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_003106	ATA	2	6	358	363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003106	TTG	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003106	GAA	2	6	1749	1754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003106	AAG	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003106	TTA	2	6	1855	1860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003106	TCT	2	6	2218	2223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_003106	GAT	2	6	2578	2583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003106	TTA	2	6	2632	2637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003106	TCA	2	6	2671	2676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_003106	TTA	2	6	2938	2943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003106	TTA	2	6	2988	2993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003106	AGT	2	6	3599	3604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003106	TCT	2	6	3628	3633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_003106	TTA	2	6	3716	3721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003106	ATT	2	6	5559	5564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003106	ATC	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_003106	AAT	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003106	GAA	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003106	TAA	2	6	8820	8825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003106	TCA	2	6	8884	8889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_003106	TCT	2	6	8946	8951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_003106	AAT	2	6	9018	9023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003106	CTA	2	6	9138	9143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_003106	TTA	2	6	9150	9155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003106	CTC	2	6	9219	9224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_003106	TAT	2	6	9236	9241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003106	ACA	2	6	9577	9582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_003106	ATA	2	6	9729	9734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003106	TAT	2	6	9778	9783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003106	TTA	2	6	10728	10733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003106	TGG	2	6	10759	10764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003106	GTT	2	6	10772	10777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003106	TAG	2	6	11508	11513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003106	TAT	2	6	11516	11521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003106	TAT	2	6	11529	11534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003106	ATC	2	6	11633	11638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_003106	ATC	2	6	11719	11724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_003106	AAT	2	6	11758	11763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003106	GTT	2	6	11903	11908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003106	ATT	2	6	11914	11919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003106	GTT	2	6	11949	11954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003106	TAA	2	6	12110	12115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003106	GTA	2	6	12167	12172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003106	AAT	2	6	12195	12200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003106	AGG	2	6	15091	15096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003106	AGT	2	6	15110	15115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003106	GTG	2	6	15192	15197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003106	CTT	2	6	20192	20197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_003106	AAT	2	6	20384	20389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003106	CTC	2	6	20635	20640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_003106	TTA	2	6	20703	20708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003106	CTA	2	6	21393	21398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_003106	TAC	2	6	23894	23899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_003106	CCT	2	6	23933	23938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_003106	CAG	2	6	24015	24020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_003106	ATT	2	6	25288	25293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003106	GGA	2	6	25371	25376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003106	GGA	2	6	25435	25440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003106	TAC	2	6	25545	25550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_003106	AAT	2	6	25707	25712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003106	TAA	2	6	25713	25718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003106	TAG	2	6	25722	25727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003106	CAT	2	6	25807	25812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_003106	ACT	2	6	25867	25872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003106	ACA	3	9	25877	25885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_003106	TCA	2	6	26094	26099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_003106	TAA	2	6	26281	26286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003106	TCA	2	6	26340	26345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_003106	TCA	2	6	26419	26424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_003106	TTC	2	6	26428	26433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_003106	TTC	2	6	26479	26484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_003106	TTC	2	6	26493	26498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_003106	TCA	2	6	26528	26533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_003106	AGG	2	6	26561	26566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003106	TCA	2	6	26590	26595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_003106	CTA	2	6	26739	26744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_003106	TCA	2	6	26842	26847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_003106	ACT	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_003106	TCA	2	6	26910	26915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_003106	TCA	2	6	26973	26978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_003106	AAT	2	6	27066	27071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003106	CTT	2	6	27117	27122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_003106	TCC	2	6	27133	27138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_003106	TCA	2	6	27227	27232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_003106	TTC	2	6	27314	27319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_003106	TCA	2	6	27740	27745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_003106	AAG	2	6	27901	27906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003106	TGT	2	6	27947	27952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003106	TAA	2	6	27955	27960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003106	TCA	2	6	27999	28004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_003106	CTT	2	6	28105	28110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_003106	TTC	2	6	28138	28143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_003106	TAC	2	6	28161	28166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_003106	CCT	2	6	28219	28224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_003106	TCA	2	6	28254	28259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_003106	AGA	2	6	28447	28452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003106	TCA	2	6	28563	28568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_003106	GAA	2	6	28584	28589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003106	TCT	2	6	28627	28632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_003106	CTT	2	6	28644	28649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003106	TCA	2	6	28690	28695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_003106	TCA	2	6	28754	28759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_003106	TCA	2	6	28818	28823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_003106	CTA	2	6	28826	28831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_003106	TCA	3	9	28883	28891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_003106	GTG	2	6	28906	28911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003106	TCA	2	6	28949	28954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003106	AGA	2	6	28969	28974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003106	TCA	2	6	29012	29017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_003106	TCA	2	6	29077	29082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_003106	TAG	2	6	29096	29101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003106	TCA	2	6	29142	29147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_003106	ATC	2	6	29420	29425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_003106	GTT	2	6	29526	29531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003106	ATA	2	6	29594	29599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003106	TCA	2	6	29842	29847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_003106	TCC	2	6	29909	29914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_003106	ATG	2	6	29988	29993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003106	TCA	2	6	30095	30100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_003106	ATG	2	6	30127	30132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003106	TCA	2	6	30157	30162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_003106	ATA	2	6	30170	30175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003106	TAA	2	6	30193	30198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003106	CAA	2	6	30301	30306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_003106	CTT	2	6	30311	30316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_003106	TCA	2	6	30415	30420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_003106	TCA	2	6	30541	30546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_003106	GAA	2	6	30547	30552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003106	ATA	2	6	30557	30562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003106	CAC	2	6	30569	30574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_003106	TAT	2	6	30623	30628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003106	CTT	2	6	30683	30688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_003106	GTT	2	6	30762	30767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003106	ATC	2	6	30792	30797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_003106	ATA	2	6	31011	31016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003106	CGA	2	6	31017	31022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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421	NC_003106	ATC	2	6	103350	103355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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