MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 34853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	TTA	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920164
2	NC_003106	AGA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920164
3	NC_003106	TAA	2	6	913	918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920164
4	NC_003106	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920164
5	NC_003106	GAA	2	6	1117	1122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920164
6	NC_003106	TTC	2	6	1147	1152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920164
7	NC_003106	TAA	2	6	1317	1322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920164
8	NC_003106	TTA	2	6	1388	1393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920164
9	NC_003106	AGT	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920164
10	NC_003106	AAT	2	6	1534	1539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920164
11	NC_003106	CTG	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920164
12	NC_003106	AGT	2	6	1609	1614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920164
13	NC_003106	CTT	2	6	1907	1912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920165
14	NC_003106	CTT	2	6	1928	1933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920165
15	NC_003106	ATA	2	6	2088	2093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920165
16	NC_003106	TTC	2	6	2145	2150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920165
17	NC_003106	CCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920165
18	NC_003106	ATT	2	6	2271	2276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920166
19	NC_003106	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920166
20	NC_003106	TCT	2	6	2348	2353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920166
21	NC_003106	TCT	2	6	2362	2367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920166
22	NC_003106	CTC	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920166
23	NC_003106	TCC	3	9	2384	2392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920166
24	NC_003106	TAA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920166
25	NC_003106	TGG	2	6	2761	2766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920168
26	NC_003106	AAG	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920168
27	NC_003106	TAA	2	6	2889	2894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920168
28	NC_003106	AGG	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920169
29	NC_003106	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920169
30	NC_003106	AGT	2	6	3351	3356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920169
31	NC_003106	CTC	2	6	3365	3370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920169
32	NC_003106	TTC	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920169
33	NC_003106	TGT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920169
34	NC_003106	GAA	2	6	3836	3841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
35	NC_003106	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
36	NC_003106	ATT	3	9	3956	3964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920171
37	NC_003106	TAA	2	6	3968	3973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920171
38	NC_003106	ATC	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920171
39	NC_003106	TGG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920171
40	NC_003106	TGA	2	6	4298	4303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
41	NC_003106	CAA	2	6	4419	4424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920171
42	NC_003106	AGA	2	6	4441	4446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
43	NC_003106	TAA	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920171
44	NC_003106	GAA	2	6	4599	4604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
45	NC_003106	TTG	2	6	4654	4659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920171
46	NC_003106	AGA	2	6	4693	4698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
47	NC_003106	TGA	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
48	NC_003106	ATG	2	6	4741	4746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
49	NC_003106	TTG	2	6	4896	4901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920171
50	NC_003106	GGT	2	6	4938	4943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920171
51	NC_003106	GAG	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920171
52	NC_003106	AAG	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
53	NC_003106	TTA	2	6	5082	5087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920171
54	NC_003106	GAG	2	6	5199	5204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920171
55	NC_003106	ATG	2	6	5311	5316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
56	NC_003106	ATG	2	6	5374	5379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920171
57	NC_003106	AGA	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920171
58	NC_003106	TCC	2	6	6094	6099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
59	NC_003106	ATC	2	6	6111	6116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
60	NC_003106	CTT	2	6	6216	6221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
61	NC_003106	TAC	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
62	NC_003106	TTA	2	6	6502	6507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
63	NC_003106	CTT	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
64	NC_003106	TTC	2	6	6622	6627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
65	NC_003106	TTA	2	6	6778	6783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
66	NC_003106	TCT	2	6	6869	6874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
67	NC_003106	TGT	2	6	7039	7044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920172
68	NC_003106	TAG	2	6	7069	7074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
69	NC_003106	ATT	2	6	7083	7088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
70	NC_003106	ATT	2	6	7113	7118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
71	NC_003106	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
72	NC_003106	AGA	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
73	NC_003106	ACT	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
74	NC_003106	TTA	2	6	7400	7405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
75	NC_003106	AGT	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
76	NC_003106	AGT	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
77	NC_003106	GAG	2	6	7500	7505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920172
78	NC_003106	TCC	2	6	7565	7570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
79	NC_003106	ACT	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
80	NC_003106	CTC	2	6	7702	7707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
81	NC_003106	TTG	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920172
82	NC_003106	ATG	2	6	7752	7757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
83	NC_003106	CTA	2	6	7808	7813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
84	NC_003106	AAG	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
85	NC_003106	ATC	2	6	7980	7985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
86	NC_003106	TAC	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
87	NC_003106	ATT	2	6	8140	8145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920172
88	NC_003106	TAA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920172
89	NC_003106	CTA	3	9	8240	8248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
90	NC_003106	CTT	2	6	8259	8264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
91	NC_003106	AAG	2	6	8266	8271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
92	NC_003106	TTC	2	6	8302	8307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920172
93	NC_003106	CAT	2	6	8375	8380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
94	NC_003106	ATA	2	6	8463	8468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920172
95	NC_003106	CCT	2	6	8587	8592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920172
96	NC_003106	TAC	2	6	8607	8612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920172
97	NC_003106	GTA	2	6	8737	8742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920172
98	NC_003106	GAA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920172
99	NC_003106	GAT	2	6	9837	9842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920174
100	NC_003106	ATC	2	6	9886	9891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920174
101	NC_003106	TCA	3	9	9904	9912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920174
102	NC_003106	CAT	2	6	9975	9980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920174
103	NC_003106	ATT	2	6	10035	10040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920174
104	NC_003106	TGA	2	6	10049	10054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920174
105	NC_003106	TTC	2	6	10140	10145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920175
106	NC_003106	ATT	2	6	10205	10210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920175
107	NC_003106	TCA	2	6	10214	10219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920175
108	NC_003106	CAA	2	6	10225	10230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920175
109	NC_003106	TTC	2	6	10266	10271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920175
110	NC_003106	TTC	2	6	10309	10314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920175
111	NC_003106	TCC	2	6	10325	10330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920175
112	NC_003106	GCA	2	6	10498	10503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920175
113	NC_003106	ACT	2	6	10532	10537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920175
114	NC_003106	CTT	2	6	10561	10566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920175
115	NC_003106	CCT	2	6	10607	10612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920175
116	NC_003106	CCT	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920175
117	NC_003106	TCA	2	6	10822	10827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920176
118	NC_003106	CCG	2	6	10854	10859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15920176
119	NC_003106	TAA	2	6	10962	10967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920176
120	NC_003106	GCA	2	6	11027	11032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920176
121	NC_003106	TTG	2	6	11186	11191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920176
122	NC_003106	TCT	2	6	11199	11204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920176
123	NC_003106	CTT	3	9	11206	11214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920176
124	NC_003106	GTA	2	6	11310	11315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920176
125	NC_003106	ATT	2	6	11329	11334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920176
126	NC_003106	ATA	2	6	12234	12239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920177
127	NC_003106	AAT	2	6	12260	12265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920177
128	NC_003106	TTA	2	6	12277	12282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920177
129	NC_003106	ATT	2	6	12533	12538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920177
130	NC_003106	TAA	2	6	12764	12769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920178
131	NC_003106	ATT	2	6	12880	12885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920178
132	NC_003106	GAT	2	6	12976	12981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920178
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263	NC_003106	ACA	2	6	24476	24481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920191
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382	NC_003106	AAG	2	6	45348	45353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
383	NC_003106	ATG	2	6	45367	45372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
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