MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 7619

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	TC	3	6	223	228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_003106	TA	3	6	465	470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003106	TG	3	6	806	811	0 %	50 %	50 %	0 %	15920164
4	NC_003106	TG	3	6	1413	1418	0 %	50 %	50 %	0 %	15920164
5	NC_003106	TA	3	6	1666	1671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003106	TC	3	6	1695	1700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_003106	TA	3	6	1884	1889	50 %	50 %	0 %	0 %	15920165
8	NC_003106	AT	3	6	1991	1996	50 %	50 %	0 %	0 %	15920165
9	NC_003106	CT	3	6	2126	2131	0 %	50 %	0 %	50 %	15920165
10	NC_003106	TC	3	6	2972	2977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_003106	TC	3	6	3026	3031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_003106	TA	3	6	3199	3204	50 %	50 %	0 %	0 %	15920169
13	NC_003106	AT	3	6	3491	3496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003106	AG	3	6	3561	3566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003106	CT	3	6	4871	4876	0 %	50 %	0 %	50 %	15920171
16	NC_003106	GA	3	6	5435	5440	50 %	0 %	50 %	0 %	15920171
17	NC_003106	CT	3	6	6026	6031	0 %	50 %	0 %	50 %	15920172
18	NC_003106	TA	3	6	6186	6191	50 %	50 %	0 %	0 %	15920172
19	NC_003106	TC	3	6	6323	6328	0 %	50 %	0 %	50 %	15920172
20	NC_003106	CT	3	6	6466	6471	0 %	50 %	0 %	50 %	15920172
21	NC_003106	GT	3	6	6851	6856	0 %	50 %	50 %	0 %	15920172
22	NC_003106	TA	3	6	6912	6917	50 %	50 %	0 %	0 %	15920172
23	NC_003106	CT	3	6	7377	7382	0 %	50 %	0 %	50 %	15920172
24	NC_003106	CT	3	6	7540	7545	0 %	50 %	0 %	50 %	15920172
25	NC_003106	AT	3	6	8514	8519	50 %	50 %	0 %	0 %	15920172
26	NC_003106	AT	3	6	8923	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003106	AG	3	6	9292	9297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003106	AT	3	6	9325	9330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003106	CT	3	6	9481	9486	0 %	50 %	0 %	50 %	15920173
30	NC_003106	AG	3	6	9499	9504	50 %	0 %	50 %	0 %	15920173
31	NC_003106	TC	3	6	10313	10318	0 %	50 %	0 %	50 %	15920175
32	NC_003106	TC	3	6	10358	10363	0 %	50 %	0 %	50 %	15920175
33	NC_003106	TA	3	6	10625	10630	50 %	50 %	0 %	0 %	15920175
34	NC_003106	TA	3	6	11192	11197	50 %	50 %	0 %	0 %	15920176
35	NC_003106	TC	3	6	11408	11413	0 %	50 %	0 %	50 %	15920176
36	NC_003106	AG	4	8	11436	11443	50 %	0 %	50 %	0 %	15920176
37	NC_003106	AT	3	6	11500	11505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003106	GA	3	6	11608	11613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003106	AT	3	6	11642	11647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003106	AG	3	6	11752	11757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003106	CA	3	6	12099	12104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003106	TA	3	6	12444	12449	50 %	50 %	0 %	0 %	15920177
43	NC_003106	AT	3	6	12482	12487	50 %	50 %	0 %	0 %	15920177
44	NC_003106	AT	3	6	12957	12962	50 %	50 %	0 %	0 %	15920178
45	NC_003106	TC	3	6	13050	13055	0 %	50 %	0 %	50 %	15920178
46	NC_003106	TA	3	6	13066	13071	50 %	50 %	0 %	0 %	15920178
47	NC_003106	TA	3	6	13214	13219	50 %	50 %	0 %	0 %	15920178
48	NC_003106	GA	4	8	13651	13658	50 %	0 %	50 %	0 %	15920179
49	NC_003106	TA	3	6	15401	15406	50 %	50 %	0 %	0 %	15920182
50	NC_003106	AT	3	6	15572	15577	50 %	50 %	0 %	0 %	15920182
51	NC_003106	TA	3	6	16480	16485	50 %	50 %	0 %	0 %	15920182
52	NC_003106	TA	3	6	16615	16620	50 %	50 %	0 %	0 %	15920182
53	NC_003106	GA	3	6	16666	16671	50 %	0 %	50 %	0 %	15920182
54	NC_003106	CT	3	6	17201	17206	0 %	50 %	0 %	50 %	15920182
55	NC_003106	CT	3	6	18449	18454	0 %	50 %	0 %	50 %	15920183
56	NC_003106	TA	3	6	18462	18467	50 %	50 %	0 %	0 %	15920183
57	NC_003106	TA	3	6	18517	18522	50 %	50 %	0 %	0 %	15920184
58	NC_003106	TA	3	6	18571	18576	50 %	50 %	0 %	0 %	15920184
59	NC_003106	GA	3	6	18809	18814	50 %	0 %	50 %	0 %	15920184
60	NC_003106	TA	3	6	19873	19878	50 %	50 %	0 %	0 %	15920185
61	NC_003106	AG	3	6	20036	20041	50 %	0 %	50 %	0 %	15920185
62	NC_003106	AT	3	6	20268	20273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003106	AT	3	6	20388	20393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003106	AT	3	6	20852	20857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003106	AT	4	8	22370	22377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003106	TA	3	6	22423	22428	50 %	50 %	0 %	0 %	15920190
67	NC_003106	GA	3	6	23080	23085	50 %	0 %	50 %	0 %	15920190
68	NC_003106	GA	3	6	23247	23252	50 %	0 %	50 %	0 %	15920190
69	NC_003106	AG	3	6	23343	23348	50 %	0 %	50 %	0 %	15920190
70	NC_003106	TA	4	8	23444	23451	50 %	50 %	0 %	0 %	15920190
71	NC_003106	TA	3	6	23534	23539	50 %	50 %	0 %	0 %	15920190
72	NC_003106	AT	3	6	23721	23726	50 %	50 %	0 %	0 %	15920190
73	NC_003106	TA	3	6	23815	23820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003106	TA	3	6	23883	23888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003106	CT	3	6	25038	25043	0 %	50 %	0 %	50 %	15920191
76	NC_003106	AT	3	6	26117	26122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003106	AG	3	6	26166	26171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003106	TA	3	6	26180	26185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003106	TA	3	6	27007	27012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003106	AT	4	8	29874	29881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003106	TG	3	6	29929	29934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003106	AG	3	6	31110	31115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003106	TA	3	6	31120	31125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003106	AG	4	8	31226	31233	50 %	0 %	50 %	0 %	15920194
85	NC_003106	AC	3	6	31387	31392	50 %	0 %	0 %	50 %	15920194
86	NC_003106	TA	3	6	31458	31463	50 %	50 %	0 %	0 %	15920194
87	NC_003106	AG	3	6	31587	31592	50 %	0 %	50 %	0 %	15920194
88	NC_003106	TC	3	6	31953	31958	0 %	50 %	0 %	50 %	15920195
89	NC_003106	CT	3	6	33953	33958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_003106	AT	3	6	34077	34082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003106	AC	3	6	34149	34154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_003106	AT	3	6	35156	35161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003106	AT	3	6	35824	35829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003106	TC	3	6	36131	36136	0 %	50 %	0 %	50 %	15920196
95	NC_003106	TA	3	6	36886	36891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003106	AC	3	6	37215	37220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_003106	AT	3	6	38225	38230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003106	TC	3	6	38631	38636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_003106	TA	3	6	38740	38745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003106	TA	3	6	39269	39274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003106	TC	3	6	39724	39729	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_003106	AC	3	6	40135	40140	50 %	0 %	0 %	50 %	15920198
103	NC_003106	TA	3	6	40226	40231	50 %	50 %	0 %	0 %	15920198
104	NC_003106	TC	3	6	40378	40383	0 %	50 %	0 %	50 %	15920199
105	NC_003106	TA	3	6	40485	40490	50 %	50 %	0 %	0 %	15920199
106	NC_003106	CT	3	6	40851	40856	0 %	50 %	0 %	50 %	15920199
107	NC_003106	AC	3	6	41062	41067	50 %	0 %	0 %	50 %	15920199
108	NC_003106	AC	3	6	41300	41305	50 %	0 %	0 %	50 %	15920200
109	NC_003106	CT	3	6	41640	41645	0 %	50 %	0 %	50 %	15920200
110	NC_003106	CT	3	6	42184	42189	0 %	50 %	0 %	50 %	15920201
111	NC_003106	AT	3	6	42199	42204	50 %	50 %	0 %	0 %	15920201
112	NC_003106	AT	3	6	42457	42462	50 %	50 %	0 %	0 %	15920201
113	NC_003106	GA	3	6	43816	43821	50 %	0 %	50 %	0 %	15920203
114	NC_003106	TC	3	6	43935	43940	0 %	50 %	0 %	50 %	15920203
115	NC_003106	GA	3	6	44409	44414	50 %	0 %	50 %	0 %	15920204
116	NC_003106	GA	3	6	44602	44607	50 %	0 %	50 %	0 %	15920204
117	NC_003106	AT	3	6	44718	44723	50 %	50 %	0 %	0 %	15920204
118	NC_003106	GA	3	6	45281	45286	50 %	0 %	50 %	0 %	15920204
119	NC_003106	TC	3	6	45788	45793	0 %	50 %	0 %	50 %	15920205
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121	NC_003106	TA	3	6	46365	46370	50 %	50 %	0 %	0 %	15920205
122	NC_003106	AT	3	6	46444	46449	50 %	50 %	0 %	0 %	15920205
123	NC_003106	TA	3	6	46806	46811	50 %	50 %	0 %	0 %	15920205
124	NC_003106	TA	3	6	47027	47032	50 %	50 %	0 %	0 %	15920206
125	NC_003106	GA	3	6	47058	47063	50 %	0 %	50 %	0 %	15920206
126	NC_003106	AG	4	8	47266	47273	50 %	0 %	50 %	0 %	15920206
127	NC_003106	AT	3	6	47669	47674	50 %	50 %	0 %	0 %	15920207
128	NC_003106	AT	3	6	47943	47948	50 %	50 %	0 %	0 %	15920207
129	NC_003106	TA	3	6	48171	48176	50 %	50 %	0 %	0 %	15920207
130	NC_003106	AG	3	6	48965	48970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003106	CT	3	6	48991	48996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_003106	AG	3	6	50024	50029	50 %	0 %	50 %	0 %	15920208
133	NC_003106	TA	3	6	50998	51003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003106	AT	4	8	51058	51065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003106	TA	3	6	51071	51076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003106	AT	3	6	51093	51098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003106	CT	3	6	51801	51806	0 %	50 %	0 %	50 %	15920209
138	NC_003106	AT	3	6	52077	52082	50 %	50 %	0 %	0 %	15920210
139	NC_003106	AT	3	6	52453	52458	50 %	50 %	0 %	0 %	15920211
140	NC_003106	TA	3	6	52558	52563	50 %	50 %	0 %	0 %	15920211
141	NC_003106	AG	3	6	52625	52630	50 %	0 %	50 %	0 %	15920211
142	NC_003106	GA	4	8	53009	53016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003106	AC	3	6	53465	53470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_003106	TG	3	6	53497	53502	0 %	50 %	50 %	0 %	15920213
145	NC_003106	TA	3	6	53831	53836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003106	AG	3	6	53888	53893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003106	AT	3	6	53935	53940	50 %	50 %	0 %	0 %	15920214
148	NC_003106	AT	3	6	54089	54094	50 %	50 %	0 %	0 %	15920214
149	NC_003106	GA	3	6	54607	54612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003106	GA	3	6	54734	54739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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