MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 456

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003103	AAAGTA	2	12	1186	1197	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15891925
2	NC_003103	CAAAAC	2	12	5028	5039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891928
3	NC_003103	CAAAAT	2	12	5881	5892	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15891928
4	NC_003103	ACCGTA	2	12	7471	7482	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15891932
5	NC_003103	AGAAAA	2	12	11174	11185	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15891935
6	NC_003103	ATTAAA	2	12	12334	12345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891936
7	NC_003103	TTTAAA	2	12	13931	13942	50 %	50 %	0 %	0 %	15891938
8	NC_003103	CTAATT	2	12	13980	13991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15891938
9	NC_003103	CTATAT	2	12	14595	14606	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15891938
10	NC_003103	ATTTAG	2	12	19513	19524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15891942
11	NC_003103	AGATGT	2	12	20261	20272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
12	NC_003103	GAAGCT	2	12	20541	20552	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15891942
13	NC_003103	AAGGAA	2	12	20838	20849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
14	NC_003103	GCATTA	2	12	21807	21818	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15891942
15	NC_003103	TCCGAT	2	12	21924	21935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15891942
16	NC_003103	ATTTAA	2	12	22322	22333	50 %	50 %	0 %	0 %	15891942
17	NC_003103	CATATA	2	12	30980	30991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15891954
18	NC_003103	AATACA	2	12	34549	34560	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15891957
19	NC_003103	TTTTTG	2	12	35122	35133	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15891959
20	NC_003103	ATATTA	2	12	42570	42581	50 %	50 %	0 %	0 %	15891968
21	NC_003103	AAAGCT	2	12	42757	42768	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15891969
22	NC_003103	TACTAA	2	12	42817	42828	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15891969
23	NC_003103	ATTAAT	2	12	43169	43180	50 %	50 %	0 %	0 %	15891969
24	NC_003103	TTTTTA	2	12	44139	44150	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15891971
25	NC_003103	AGTATT	2	12	48775	48786	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15891979
26	NC_003103	ATTGCT	2	12	53182	53193	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15891983
27	NC_003103	ATTTAT	2	12	53769	53780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891984
28	NC_003103	ATAAGG	2	12	53968	53979	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15891984
29	NC_003103	ATCAGA	2	12	57723	57734	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15891989
30	NC_003103	AAAACA	2	12	61503	61514	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	15891991
31	NC_003103	TAATAT	2	12	66607	66618	50 %	50 %	0 %	0 %	15891996
32	NC_003103	CAGCAA	2	12	67276	67287	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15891997
33	NC_003103	ATAGTG	2	12	67607	67618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891997
34	NC_003103	AAAAAG	2	12	68435	68446	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15891997
35	NC_003103	TATAGT	2	12	72226	72237	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892002
36	NC_003103	TACCCT	2	12	73868	73879	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15892004
37	NC_003103	ATCCTG	2	12	73890	73901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15892004
38	NC_003103	AAAGCT	2	12	74309	74320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15892004
39	NC_003103	GTAATA	2	12	74948	74959	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892004
40	NC_003103	AGTAAA	2	12	83688	83699	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892013
41	NC_003103	AAGGAC	2	12	85337	85348	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15892015
42	NC_003103	CGTGAT	2	12	86306	86317	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15892017
43	NC_003103	TTGATT	2	12	88766	88777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15892018
44	NC_003103	GAAGCA	2	12	89858	89869	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15892019
45	NC_003103	TTTTTA	2	12	95229	95240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15892022
46	NC_003103	CCTATA	2	12	100069	100080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892028
47	NC_003103	ACCTAT	2	12	100302	100313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892028
48	NC_003103	ACCGCT	2	12	101650	101661	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15892029
49	NC_003103	TAGCGG	2	12	108460	108471	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15892033
50	NC_003103	TAGCGG	2	12	116289	116300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15892041
51	NC_003103	TTTATT	2	12	121760	121771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15892047
52	NC_003103	TAAAAT	2	12	125756	125767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892053
53	NC_003103	TTGCTA	2	12	135133	135144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892065
54	NC_003103	AAGATA	2	12	135298	135309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892065
55	NC_003103	CTTTAG	2	12	135460	135471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892065
56	NC_003103	TTTAGT	2	12	136119	136130	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15892065
57	NC_003103	TAATGC	2	12	139839	139850	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15892067
58	NC_003103	AAAGAT	2	12	140662	140673	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892067
59	NC_003103	TTTATC	2	12	153606	153617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15892076
60	NC_003103	GATTTT	2	12	153900	153911	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15892077
61	NC_003103	CTTTTG	2	12	156459	156470	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15892079
62	NC_003103	GTAAAA	2	12	157783	157794	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892080
63	NC_003103	CAATAT	2	12	160711	160722	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892084
64	NC_003103	ATTGAG	2	12	161062	161073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15892085
65	NC_003103	CTTCAT	2	12	161288	161299	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892085
66	NC_003103	TCAATT	2	12	163063	163074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15892087
67	NC_003103	AAAGAA	2	12	163703	163714	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15892087
68	NC_003103	TCAAGC	2	12	163720	163731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15892087
69	NC_003103	GTTGAG	2	12	164287	164298	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15892088
70	NC_003103	AAGTAA	2	12	166083	166094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892089
71	NC_003103	TAGAGC	2	12	168928	168939	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892093
72	NC_003103	GAACAA	2	12	172449	172460	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15892097
73	NC_003103	ATAAAA	2	12	173866	173877	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15892097
74	NC_003103	TTTTTA	2	12	174930	174941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15892098
75	NC_003103	CTGTAG	2	12	177964	177975	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	161723850
76	NC_003103	TTAAAA	2	12	180210	180221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15892104
77	NC_003103	GCTATT	2	12	182057	182068	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892104
78	NC_003103	TCCATG	2	12	189020	189031	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15892106
79	NC_003103	GATGTT	2	12	190045	190056	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15892107
80	NC_003103	AAAAAT	2	12	192522	192533	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15892110
81	NC_003103	AAGCCC	2	12	201578	201589	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15892116
82	NC_003103	CTTTAG	2	12	210150	210161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892125
83	NC_003103	TGCCGA	2	12	210640	210651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15892125
84	NC_003103	ATATTT	2	12	211139	211150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15892125
85	NC_003103	GTTTCA	2	12	214428	214439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15892129
86	NC_003103	AAAAGC	2	12	215610	215621	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15892130
87	NC_003103	TTTCTT	2	12	217068	217079	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892132
88	NC_003103	TTTTCT	2	12	217088	217099	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892132
89	NC_003103	AGTTAA	2	12	220186	220197	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892134
90	NC_003103	TCATAA	2	12	222178	222189	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892135
91	NC_003103	TAATAT	2	12	222283	222294	50 %	50 %	0 %	0 %	15892135
92	NC_003103	TAAATT	2	12	223869	223880	50 %	50 %	0 %	0 %	15892137
93	NC_003103	AAAGCA	2	12	231114	231125	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15892146
94	NC_003103	GTACGA	2	12	235158	235169	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892150
95	NC_003103	CTTCTA	2	12	236155	236166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892150
96	NC_003103	ATCTCA	2	12	239031	239042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892152
97	NC_003103	TTCTTT	2	12	240424	240435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15892153
98	NC_003103	TACTTC	2	12	242750	242761	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15892156
99	NC_003103	GAAAAT	2	12	249816	249827	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892162
100	NC_003103	CAATAT	2	12	252290	252301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892165
101	NC_003103	GCACCG	2	12	259924	259935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15892176
102	NC_003103	CTTTAA	2	12	260251	260262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15892177
103	NC_003103	GCACCG	2	12	261718	261729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	15892179
104	NC_003103	CATTAT	2	12	266978	266989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15892185
105	NC_003103	ATGACG	2	12	269051	269062	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892188
106	NC_003103	TTAAAG	2	12	275928	275939	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892196
107	NC_003103	AGGGTA	2	12	276246	276257	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15892196
108	NC_003103	GCGGTA	2	12	276864	276875	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15892196
109	NC_003103	TAAAAA	2	12	286690	286701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15892205
110	NC_003103	GTCGTT	2	12	287883	287894	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15892206
111	NC_003103	CCTGAA	2	12	290270	290281	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15892209
112	NC_003103	TTTTGC	2	12	295878	295889	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15892215
113	NC_003103	TACTAA	2	12	298864	298875	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892218
114	NC_003103	TATTGA	2	12	299587	299598	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892218
115	NC_003103	GGGATA	2	12	300482	300493	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15892219
116	NC_003103	GGCAAT	2	12	301490	301501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892219
117	NC_003103	ATCTTT	2	12	304832	304843	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15892226
118	NC_003103	TTGTTC	2	12	305262	305273	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15892227
119	NC_003103	ATTAGA	2	12	305634	305645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892227
120	NC_003103	GAAGAT	2	12	308510	308521	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15892230
121	NC_003103	GAAGTA	2	12	311608	311619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15892232
122	NC_003103	AGAGCT	2	12	313555	313566	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15892233
123	NC_003103	TCTGCC	2	12	313916	313927	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15892233
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125	NC_003103	TTAATA	2	12	314905	314916	50 %	50 %	0 %	0 %	15892234
126	NC_003103	CGGTAT	2	12	315902	315913	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15892234
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224	NC_003103	ATAAAG	2	12	611454	611465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15892550
225	NC_003103	CCTGCT	2	12	612434	612445	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15892551
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228	NC_003103	TATTAA	2	12	616004	616015	50 %	50 %	0 %	0 %	15892553
229	NC_003103	TGCTAA	2	12	618014	618025	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15892555
230	NC_003103	GATAAT	2	12	619723	619734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892557
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232	NC_003103	CCTGCT	2	12	622126	622137	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	15892560
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351	NC_003103	AAATTT	2	12	939468	939479	50 %	50 %	0 %	0 %	15892937
352	NC_003103	TTTTGA	2	12	956574	956585	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15892953
353	NC_003103	AATTGA	2	12	956853	956864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892953
354	NC_003103	TATAGT	2	12	957078	957089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892953
355	NC_003103	TGCTCT	2	12	960749	960760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15892957
356	NC_003103	TTAAAG	2	12	963555	963566	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15892960
357	NC_003103	ACCGCT	2	12	963619	963630	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15892960
358	NC_003103	AGTCGG	2	12	964354	964365	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15892961
359	NC_003103	GCCATG	2	12	967964	967975	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15892966
360	NC_003103	ATGATT	2	12	973748	973759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15892971
361	NC_003103	ATATCC	2	12	976104	976115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15892975
362	NC_003103	ATCAAT	2	12	985105	985116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15892984
363	NC_003103	AATGCT	2	12	985501	985512	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15892985
364	NC_003103	TTACCG	2	12	1009028	1009039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15893008
365	NC_003103	AGACCT	2	12	1009340	1009351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15893008
366	NC_003103	TAGCTA	2	12	1010382	1010393	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15893008
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372	NC_003103	CCGGTA	2	12	1034357	1034368	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	15893037
373	NC_003103	TTATAT	2	12	1037355	1037366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15893038
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379	NC_003103	TGCTTT	2	12	1058558	1058569	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15893070
380	NC_003103	ATCTGT	2	12	1062399	1062410	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15893079
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384	NC_003103	TCTTGC	2	12	1077586	1077597	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15893097
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388	NC_003103	TAAAGA	2	12	1084084	1084095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893105
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392	NC_003103	TACCTG	2	12	1091983	1091994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15893117
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425	NC_003103	ATTTAA	2	12	1180566	1180577	50 %	50 %	0 %	0 %	15893196
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428	NC_003103	AAAGTA	2	12	1191480	1191491	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15893207
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443	NC_003103	ATTTAA	2	12	1234336	1234347	50 %	50 %	0 %	0 %	15893253
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452	NC_003103	ATACCG	2	12	1259092	1259103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15893284
453	NC_003103	CAAAAT	2	12	1260980	1260991	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15893288
454	NC_003103	TCAATT	2	12	1261811	1261822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15893289
455	NC_003103	AATATC	2	12	1266902	1266913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15893296
456	NC_003103	TTTTCC	2	12	1267902	1267913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15893297