MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 1162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003103	TTTTA	2	10	2494	2503	20 %	80 %	0 %	0 %	15891927
2	NC_003103	ATTTA	2	10	2847	2856	40 %	60 %	0 %	0 %	15891927
3	NC_003103	GGTCA	2	10	4094	4103	20 %	20 %	40 %	20 %	15891928
4	NC_003103	TCAAT	2	10	5073	5082	40 %	40 %	0 %	20 %	15891928
5	NC_003103	GTAGT	2	10	5129	5138	20 %	40 %	40 %	0 %	15891928
6	NC_003103	TAATA	2	10	5989	5998	60 %	40 %	0 %	0 %	15891928
7	NC_003103	ACTTT	2	10	6778	6787	20 %	60 %	0 %	20 %	15891931
8	NC_003103	AATAC	2	10	7319	7328	60 %	20 %	0 %	20 %	15891931
9	NC_003103	ATCCA	2	10	7816	7825	40 %	20 %	0 %	40 %	15891932
10	NC_003103	AATTA	2	10	9393	9402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003103	CGCTC	2	10	9745	9754	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_003103	GGCTC	2	10	10282	10291	0 %	20 %	40 %	40 %	15891934
13	NC_003103	AGCAG	2	10	10707	10716	40 %	0 %	40 %	20 %	15891934
14	NC_003103	TTAAT	2	10	10850	10859	40 %	60 %	0 %	0 %	15891934
15	NC_003103	TAACT	2	10	12117	12126	40 %	40 %	0 %	20 %	15891936
16	NC_003103	ATTTA	2	10	13771	13780	40 %	60 %	0 %	0 %	15891938
17	NC_003103	TTTTA	2	10	14539	14548	20 %	80 %	0 %	0 %	15891938
18	NC_003103	TTTAA	2	10	17273	17282	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003103	TCAAG	2	10	18307	18316	40 %	20 %	20 %	20 %	15891942
20	NC_003103	ATAAA	2	10	18361	18370	80 %	20 %	0 %	0 %	15891942
21	NC_003103	AGAAA	2	10	18623	18632	80 %	0 %	20 %	0 %	15891942
22	NC_003103	TAATA	2	10	19808	19817	60 %	40 %	0 %	0 %	15891942
23	NC_003103	CAAAG	2	10	19900	19909	60 %	0 %	20 %	20 %	15891942
24	NC_003103	AGCAG	2	10	20226	20235	40 %	0 %	40 %	20 %	15891942
25	NC_003103	TACCT	2	10	21716	21725	20 %	40 %	0 %	40 %	15891942
26	NC_003103	TATAA	2	10	23204	23213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003103	ATATT	2	10	24782	24791	40 %	60 %	0 %	0 %	15891944
28	NC_003103	ATATT	2	10	24820	24829	40 %	60 %	0 %	0 %	15891944
29	NC_003103	AAATA	2	10	25271	25280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003103	ATGTT	2	10	25983	25992	20 %	60 %	20 %	0 %	15891946
31	NC_003103	TTTGT	2	10	26936	26945	0 %	80 %	20 %	0 %	15891948
32	NC_003103	TCATT	2	10	28713	28722	20 %	60 %	0 %	20 %	15891952
33	NC_003103	TGCTA	2	10	29632	29641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_003103	AAGTG	2	10	32172	32181	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003103	ATTTT	2	10	32184	32193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003103	TTAAT	2	10	33887	33896	40 %	60 %	0 %	0 %	15891956
37	NC_003103	TTAGT	2	10	36476	36485	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003103	CTTTT	2	10	38518	38527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_003103	TTATT	2	10	38924	38933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003103	TTTTA	2	10	39028	39037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003103	TAAGT	2	10	42290	42299	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003103	GAGAG	2	10	42835	42844	40 %	0 %	60 %	0 %	15891969
43	NC_003103	CAAAC	2	10	42887	42896	60 %	0 %	0 %	40 %	15891969
44	NC_003103	ACGTA	2	10	43051	43060	40 %	20 %	20 %	20 %	15891969
45	NC_003103	TAACT	2	10	43318	43327	40 %	40 %	0 %	20 %	15891969
46	NC_003103	AGAAA	2	10	43922	43931	80 %	0 %	20 %	0 %	15891971
47	NC_003103	GTTTC	2	10	44362	44371	0 %	60 %	20 %	20 %	15891971
48	NC_003103	ATTTT	2	10	44911	44920	20 %	80 %	0 %	0 %	15891971
49	NC_003103	AAGAG	2	10	46360	46369	60 %	0 %	40 %	0 %	15891974
50	NC_003103	AGTAC	2	10	46814	46823	40 %	20 %	20 %	20 %	15891976
51	NC_003103	TTTAA	2	10	47030	47039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003103	TTTCT	2	10	48110	48119	0 %	80 %	0 %	20 %	15891978
53	NC_003103	CATTA	2	10	49162	49171	40 %	40 %	0 %	20 %	15891980
54	NC_003103	TTGAT	2	10	51065	51074	20 %	60 %	20 %	0 %	15891982
55	NC_003103	TAAAG	2	10	52092	52101	60 %	20 %	20 %	0 %	15891982
56	NC_003103	ATTAT	2	10	52165	52174	40 %	60 %	0 %	0 %	15891982
57	NC_003103	ATTAT	2	10	55720	55729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003103	TCGGT	2	10	57551	57560	0 %	40 %	40 %	20 %	15891989
59	NC_003103	GCTTT	2	10	58974	58983	0 %	60 %	20 %	20 %	15891990
60	NC_003103	TAAAA	2	10	62976	62985	80 %	20 %	0 %	0 %	15891992
61	NC_003103	ACTTT	2	10	66031	66040	20 %	60 %	0 %	20 %	15891996
62	NC_003103	GCTTA	2	10	66220	66229	20 %	40 %	20 %	20 %	15891996
63	NC_003103	CATTT	2	10	66923	66932	20 %	60 %	0 %	20 %	15891996
64	NC_003103	TTAAA	2	10	66948	66957	60 %	40 %	0 %	0 %	15891996
65	NC_003103	TAAAT	2	10	67026	67035	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003103	ACATA	2	10	69754	69763	60 %	20 %	0 %	20 %	15891999
67	NC_003103	GATTA	2	10	71397	71406	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003103	TTTCT	2	10	73109	73118	0 %	80 %	0 %	20 %	15892003
69	NC_003103	ATTTA	2	10	73523	73532	40 %	60 %	0 %	0 %	15892004
70	NC_003103	AAAAG	2	10	74299	74308	80 %	0 %	20 %	0 %	15892004
71	NC_003103	GGGTT	2	10	74509	74518	0 %	40 %	60 %	0 %	15892004
72	NC_003103	TTTAT	2	10	74885	74894	20 %	80 %	0 %	0 %	15892004
73	NC_003103	GCTTA	2	10	76184	76193	20 %	40 %	20 %	20 %	15892005
74	NC_003103	ACAAT	2	10	76548	76557	60 %	20 %	0 %	20 %	15892006
75	NC_003103	ACCGT	2	10	76801	76810	20 %	20 %	20 %	40 %	15892006
76	NC_003103	GTTAT	2	10	77173	77182	20 %	60 %	20 %	0 %	15892007
77	NC_003103	GTAGA	2	10	77479	77488	40 %	20 %	40 %	0 %	15892007
78	NC_003103	CAATG	2	10	79831	79840	40 %	20 %	20 %	20 %	15892009
79	NC_003103	ATAAA	2	10	80294	80303	80 %	20 %	0 %	0 %	15892010
80	NC_003103	ATTAT	2	10	80729	80738	40 %	60 %	0 %	0 %	15892010
81	NC_003103	ATTAA	2	10	81000	81009	60 %	40 %	0 %	0 %	15892010
82	NC_003103	ATACA	2	10	81204	81213	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_003103	GAAAA	2	10	81552	81561	80 %	0 %	20 %	0 %	15892011
84	NC_003103	TAAAT	2	10	84766	84775	60 %	40 %	0 %	0 %	15892014
85	NC_003103	CGCAT	3	15	89012	89026	20 %	20 %	20 %	40 %	15892018
86	NC_003103	TGAAA	2	10	92242	92251	60 %	20 %	20 %	0 %	15892020
87	NC_003103	TTGAT	2	10	93925	93934	20 %	60 %	20 %	0 %	15892021
88	NC_003103	TATAA	2	10	94560	94569	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003103	TTGTA	2	10	94700	94709	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003103	ATTTA	2	10	95639	95648	40 %	60 %	0 %	0 %	15892023
91	NC_003103	AATTA	2	10	96008	96017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003103	TCAAA	2	10	97296	97305	60 %	20 %	0 %	20 %	15892025
93	NC_003103	TTAAT	2	10	98070	98079	40 %	60 %	0 %	0 %	15892026
94	NC_003103	AAACT	2	10	100643	100652	60 %	20 %	0 %	20 %	15892028
95	NC_003103	TTAGT	2	10	100994	101003	20 %	60 %	20 %	0 %	15892029
96	NC_003103	CCAAA	2	10	103433	103442	60 %	0 %	0 %	40 %	15892031
97	NC_003103	CGGAT	2	10	103979	103988	20 %	20 %	40 %	20 %	15892032
98	NC_003103	TAATA	2	10	104736	104745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003103	ATTTT	2	10	104983	104992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003103	TTGAT	2	10	105433	105442	20 %	60 %	20 %	0 %	15892033
101	NC_003103	ATTAT	2	10	105614	105623	40 %	60 %	0 %	0 %	15892033
102	NC_003103	AGTTC	2	10	106748	106757	20 %	40 %	20 %	20 %	15892033
103	NC_003103	AGTTC	2	10	106907	106916	20 %	40 %	20 %	20 %	15892033
104	NC_003103	TTTGA	2	10	109326	109335	20 %	60 %	20 %	0 %	15892033
105	NC_003103	GCAAA	2	10	111300	111309	60 %	0 %	20 %	20 %	15892034
106	NC_003103	TTAGT	2	10	116019	116028	20 %	60 %	20 %	0 %	15892041
107	NC_003103	ATAAA	2	10	117236	117245	80 %	20 %	0 %	0 %	15892041
108	NC_003103	AAGTA	2	10	117842	117851	60 %	20 %	20 %	0 %	15892042
109	NC_003103	ATTCG	2	10	119621	119630	20 %	40 %	20 %	20 %	15892044
110	NC_003103	TAAAA	2	10	119964	119973	80 %	20 %	0 %	0 %	15892045
111	NC_003103	AAAAC	2	10	120660	120669	80 %	0 %	0 %	20 %	15892045
112	NC_003103	TTTAA	2	10	120736	120745	40 %	60 %	0 %	0 %	15892045
113	NC_003103	GTTAC	2	10	121825	121834	20 %	40 %	20 %	20 %	15892047
114	NC_003103	TGAAA	2	10	122186	122195	60 %	20 %	20 %	0 %	15892047
115	NC_003103	GCAAG	2	10	122840	122849	40 %	0 %	40 %	20 %	15892048
116	NC_003103	TTAAA	2	10	124783	124792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003103	CTTGT	2	10	125273	125282	0 %	60 %	20 %	20 %	15892052
118	NC_003103	ATGAT	2	10	126337	126346	40 %	40 %	20 %	0 %	15892053
119	NC_003103	CTTGT	2	10	126675	126684	0 %	60 %	20 %	20 %	15892054
120	NC_003103	TATTT	2	10	127097	127106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003103	AACCT	2	10	129219	129228	40 %	20 %	0 %	40 %	15892059
122	NC_003103	TGGTT	2	10	130013	130022	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003103	AAATC	2	10	130361	130370	60 %	20 %	0 %	20 %	15892061
124	NC_003103	TTAAC	2	10	131498	131507	40 %	40 %	0 %	20 %	15892062
125	NC_003103	TATAA	2	10	131590	131599	60 %	40 %	0 %	0 %	15892062
126	NC_003103	TTATA	2	10	131964	131973	40 %	60 %	0 %	0 %	15892063
127	NC_003103	TTTTA	2	10	133491	133500	20 %	80 %	0 %	0 %	15892064
128	NC_003103	GCTTT	2	10	135067	135076	0 %	60 %	20 %	20 %	15892065
129	NC_003103	TATGT	2	10	135717	135726	20 %	60 %	20 %	0 %	15892065
130	NC_003103	GTTTT	2	10	137883	137892	0 %	80 %	20 %	0 %	15892066
131	NC_003103	CTTGG	2	10	138700	138709	0 %	40 %	40 %	20 %	15892066
132	NC_003103	ACAAG	2	10	142414	142423	60 %	0 %	20 %	20 %	15892067
133	NC_003103	AGTTT	2	10	142752	142761	20 %	60 %	20 %	0 %	15892068
134	NC_003103	TTAGT	2	10	143275	143284	20 %	60 %	20 %	0 %	15892068
135	NC_003103	ATATA	2	10	144181	144190	60 %	40 %	0 %	0 %	15892068
136	NC_003103	TGCAG	2	10	144269	144278	20 %	20 %	40 %	20 %	15892068
137	NC_003103	ATGGT	2	10	145849	145858	20 %	40 %	40 %	0 %	15892069
138	NC_003103	AGGAG	2	10	146104	146113	40 %	0 %	60 %	0 %	15892069
139	NC_003103	TATTT	2	10	146780	146789	20 %	80 %	0 %	0 %	15892069
140	NC_003103	AAAGA	2	10	152152	152161	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003103	TAATT	2	10	152201	152210	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003103	AATTT	2	10	153988	153997	40 %	60 %	0 %	0 %	15892077
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144	NC_003103	AAATT	2	10	161302	161311	60 %	40 %	0 %	0 %	15892085
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184	NC_003103	TAAAA	2	10	207885	207894	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_003103	ATTAT	2	10	208905	208914	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_003103	TAAAA	2	10	306869	306878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_003103	TAAAC	2	10	306991	307000	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_003103	GCTTG	2	10	308714	308723	0 %	40 %	40 %	20 %	15892230
273	NC_003103	AAAGA	2	10	310963	310972	80 %	0 %	20 %	0 %	15892232
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