MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 19647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003103	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
2	NC_003103	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
3	NC_003103	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
4	NC_003103	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891924
5	NC_003103	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891924
6	NC_003103	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891924
7	NC_003103	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891924
8	NC_003103	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891924
9	NC_003103	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891924
10	NC_003103	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891924
11	NC_003103	ATT	2	6	832	837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003103	TGT	2	6	883	888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003103	TTG	2	6	938	943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003103	TGC	2	6	1015	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003103	ATA	2	6	1153	1158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891925
16	NC_003103	TGA	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891925
17	NC_003103	GTA	2	6	1250	1255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891925
18	NC_003103	CAA	2	6	1312	1317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891925
19	NC_003103	TAA	2	6	1341	1346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891925
20	NC_003103	TCT	2	6	1461	1466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891926
21	NC_003103	ATA	3	9	1725	1733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891926
22	NC_003103	GTA	2	6	1791	1796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891926
23	NC_003103	TGA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891926
24	NC_003103	GAA	2	6	1948	1953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891926
25	NC_003103	AAT	2	6	1978	1983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891926
26	NC_003103	AAG	2	6	1995	2000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891926
27	NC_003103	TTA	2	6	2033	2038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891926
28	NC_003103	CAA	3	9	2096	2104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891926
29	NC_003103	CGG	2	6	2317	2322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891927
30	NC_003103	AGC	2	6	2348	2353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891927
31	NC_003103	ATA	2	6	2393	2398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891927
32	NC_003103	ATA	2	6	2531	2536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891927
33	NC_003103	TAA	2	6	2562	2567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891927
34	NC_003103	ATG	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891927
35	NC_003103	TAT	2	6	2812	2817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891927
36	NC_003103	TTA	2	6	2826	2831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891927
37	NC_003103	CTC	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891928
38	NC_003103	ATT	2	6	3034	3039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
39	NC_003103	ATT	2	6	3047	3052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
40	NC_003103	ATT	2	6	3160	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
41	NC_003103	AGA	2	6	3333	3338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
42	NC_003103	AGA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
43	NC_003103	AGC	2	6	3363	3368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
44	NC_003103	TGC	2	6	3375	3380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
45	NC_003103	ATT	2	6	3566	3571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
46	NC_003103	GAG	2	6	3643	3648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15891928
47	NC_003103	TAT	2	6	3804	3809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
48	NC_003103	GCA	2	6	3832	3837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
49	NC_003103	AGA	2	6	3930	3935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
50	NC_003103	CTA	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891928
51	NC_003103	TAT	2	6	4081	4086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
52	NC_003103	TTA	2	6	4087	4092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
53	NC_003103	TGT	2	6	4107	4112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891928
54	NC_003103	ATA	2	6	4301	4306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
55	NC_003103	GGC	2	6	4552	4557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891928
56	NC_003103	GCA	2	6	4576	4581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
57	NC_003103	GGA	2	6	4653	4658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15891928
58	NC_003103	GAA	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
59	NC_003103	AAG	2	6	4706	4711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
60	NC_003103	AAT	2	6	4717	4722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
61	NC_003103	GAA	2	6	4723	4728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
62	NC_003103	TAA	2	6	4743	4748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
63	NC_003103	CTA	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891928
64	NC_003103	GAG	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15891928
65	NC_003103	CGT	2	6	4933	4938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
66	NC_003103	AAG	2	6	5159	5164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
67	NC_003103	ACG	2	6	5168	5173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891928
68	NC_003103	ATA	2	6	5195	5200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
69	NC_003103	ATT	2	6	5246	5251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
70	NC_003103	TAA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
71	NC_003103	GAT	2	6	5287	5292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891928
72	NC_003103	TGC	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
73	NC_003103	ATT	2	6	5369	5374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
74	NC_003103	TGC	2	6	5382	5387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891928
75	NC_003103	CTA	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891928
76	NC_003103	AGT	2	6	5514	5519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891928
77	NC_003103	CGC	2	6	5540	5545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891928
78	NC_003103	TTA	2	6	5605	5610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891928
79	NC_003103	ATA	2	6	5627	5632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
80	NC_003103	TAA	2	6	5696	5701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
81	NC_003103	ATA	2	6	5719	5724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
82	NC_003103	GAA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891928
83	NC_003103	ATA	2	6	5773	5778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891928
84	NC_003103	ATG	2	6	5806	5811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891928
85	NC_003103	GTT	2	6	6018	6023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003103	CTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891929
87	NC_003103	TCA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891929
88	NC_003103	ATA	2	6	6087	6092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891929
89	NC_003103	TAA	2	6	6131	6136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891929
90	NC_003103	GAT	2	6	6196	6201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891929
91	NC_003103	AAC	3	9	6221	6229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891929
92	NC_003103	CAA	2	6	6272	6277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891929
93	NC_003103	TAT	2	6	6297	6302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891930
94	NC_003103	TTC	2	6	6323	6328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891930
95	NC_003103	TAA	2	6	6377	6382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891930
96	NC_003103	CTT	2	6	6397	6402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891930
97	NC_003103	GTT	2	6	6424	6429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891930
98	NC_003103	TCC	2	6	6553	6558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891930
99	NC_003103	ATT	2	6	6683	6688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891931
100	NC_003103	TTC	2	6	6749	6754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891931
101	NC_003103	ATC	2	6	6900	6905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891931
102	NC_003103	CCG	2	6	6948	6953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891931
103	NC_003103	ATT	2	6	6954	6959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891931
104	NC_003103	TAC	2	6	7010	7015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891931
105	NC_003103	ATT	2	6	7016	7021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891931
106	NC_003103	ATT	3	9	7067	7075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891931
107	NC_003103	TCA	2	6	7087	7092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891931
108	NC_003103	TAT	2	6	7141	7146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891931
109	NC_003103	TAC	2	6	7265	7270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891931
110	NC_003103	GTA	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891931
111	NC_003103	CTT	2	6	7598	7603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891932
112	NC_003103	TAG	2	6	7610	7615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891932
113	NC_003103	AGC	2	6	7641	7646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891932
114	NC_003103	CTA	2	6	7787	7792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891932
115	NC_003103	TCT	2	6	7862	7867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_003103	AAT	2	6	7905	7910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003103	GAC	2	6	7999	8004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_003103	CAA	3	9	8018	8026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_003103	ATA	3	9	8089	8097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891933
120	NC_003103	ATA	2	6	8116	8121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891933
121	NC_003103	GCC	2	6	8136	8141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891933
122	NC_003103	ATA	2	6	8299	8304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891933
123	NC_003103	TAG	2	6	8402	8407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891933
124	NC_003103	ATT	2	6	8427	8432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891933
125	NC_003103	ACG	2	6	8533	8538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891933
126	NC_003103	TCG	2	6	8539	8544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891933
127	NC_003103	TGT	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891933
128	NC_003103	CTC	2	6	8606	8611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891933
129	NC_003103	TAT	2	6	8642	8647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891933
130	NC_003103	TAA	2	6	8654	8659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891933
131	NC_003103	CAA	2	6	8723	8728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891933
132	NC_003103	ATT	2	6	8740	8745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891933
133	NC_003103	TAA	2	6	8823	8828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891933
134	NC_003103	AGC	3	9	8877	8885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891933
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263	NC_003103	ACC	2	6	17984	17989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891942
264	NC_003103	CAA	2	6	18048	18053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
265	NC_003103	TCC	2	6	18092	18097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891942
266	NC_003103	GAT	2	6	18185	18190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
267	NC_003103	TAA	2	6	18566	18571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
268	NC_003103	AGT	2	6	18603	18608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
269	NC_003103	AAG	2	6	18637	18642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
270	NC_003103	GCT	2	6	18717	18722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891942
271	NC_003103	TTA	2	6	18822	18827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
272	NC_003103	TGT	2	6	18833	18838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891942
273	NC_003103	AAC	2	6	18931	18936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
274	NC_003103	CAG	2	6	18975	18980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891942
275	NC_003103	TAT	2	6	19345	19350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
276	NC_003103	ATC	2	6	19379	19384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891942
277	NC_003103	GAA	2	6	19392	19397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
278	NC_003103	ACA	2	6	19447	19452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
279	NC_003103	TTC	2	6	19475	19480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891942
280	NC_003103	AAC	2	6	19552	19557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
281	NC_003103	TAA	2	6	19588	19593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
282	NC_003103	AAT	2	6	19641	19646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
283	NC_003103	ACA	2	6	19670	19675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
284	NC_003103	GAT	2	6	19719	19724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
285	NC_003103	AGA	2	6	19872	19877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
286	NC_003103	AAC	2	6	20054	20059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
287	NC_003103	AGA	2	6	20073	20078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
288	NC_003103	CAG	2	6	20148	20153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891942
289	NC_003103	TAA	2	6	20246	20251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
290	NC_003103	CAA	2	6	20397	20402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891942
291	NC_003103	AAG	2	6	20407	20412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
292	NC_003103	TAA	2	6	20428	20433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
293	NC_003103	CTC	2	6	20521	20526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891942
294	NC_003103	ATA	2	6	20590	20595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
295	NC_003103	CTA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891942
296	NC_003103	ATT	2	6	20750	20755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
297	NC_003103	AGA	2	6	20798	20803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
298	NC_003103	TGA	2	6	21038	21043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
299	NC_003103	TAA	2	6	21182	21187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
300	NC_003103	ATG	3	9	21337	21345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
301	NC_003103	AGT	2	6	21351	21356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
302	NC_003103	TGT	2	6	21362	21367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891942
303	NC_003103	TAA	2	6	21398	21403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891942
304	NC_003103	AGA	2	6	21455	21460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
305	NC_003103	AGA	2	6	21473	21478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
306	NC_003103	AAG	2	6	21523	21528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
307	NC_003103	ATG	2	6	21616	21621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
308	NC_003103	TTC	2	6	21629	21634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891942
309	NC_003103	GAA	2	6	21645	21650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
310	NC_003103	GAA	2	6	21735	21740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
311	NC_003103	AAG	2	6	21742	21747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
312	NC_003103	TAG	2	6	21857	21862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891942
313	NC_003103	GAA	2	6	21870	21875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
314	NC_003103	GAA	3	9	21900	21908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891942
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333	NC_003103	TAT	2	6	22898	22903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891942
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338	NC_003103	AAT	2	6	23221	23226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
339	NC_003103	CAC	2	6	23242	23247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
340	NC_003103	TAC	2	6	23459	23464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
341	NC_003103	AAT	2	6	23601	23606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891943
342	NC_003103	AAC	2	6	23797	23802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
343	NC_003103	TAA	2	6	23848	23853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_003103	TTA	2	6	23866	23871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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348	NC_003103	AGT	2	6	24139	24144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
349	NC_003103	TAA	2	6	24203	24208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
350	NC_003103	TAA	2	6	24224	24229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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364	NC_003103	TAC	2	6	25029	25034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
365	NC_003103	ATT	2	6	25036	25041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_003103	GAA	2	6	25144	25149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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376	NC_003103	TAT	2	6	25763	25768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_003103	TCT	2	6	26529	26534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891947
383	NC_003103	ATT	2	6	26685	26690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891947
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388	NC_003103	AGC	2	6	26803	26808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891948
389	NC_003103	TAT	2	6	27036	27041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891948
390	NC_003103	TTC	2	6	27049	27054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891948
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392	NC_003103	TAA	2	6	27477	27482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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