MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 5877

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003098	GAAA	2	8	3	10	75 %	0 %	25 %	0 %	15902045
2	NC_003098	AAGA	2	8	44	51	75 %	0 %	25 %	0 %	15902045
3	NC_003098	GGAA	2	8	1238	1245	50 %	0 %	50 %	0 %	15902045
4	NC_003098	TCAT	2	8	1271	1278	25 %	50 %	0 %	25 %	15902045
5	NC_003098	TGAT	2	8	1301	1308	25 %	50 %	25 %	0 %	15902045
6	NC_003098	AATC	2	8	1337	1344	50 %	25 %	0 %	25 %	15902045
7	NC_003098	ATAA	2	8	1503	1510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003098	ATTT	2	8	1546	1553	25 %	75 %	0 %	0 %	15902046
9	NC_003098	AGCA	2	8	1910	1917	50 %	0 %	25 %	25 %	15902046
10	NC_003098	ACTT	2	8	2514	2521	25 %	50 %	0 %	25 %	15902046
11	NC_003098	GATT	2	8	2522	2529	25 %	50 %	25 %	0 %	15902046
12	NC_003098	TTAG	2	8	2923	2930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003098	AACT	2	8	3157	3164	50 %	25 %	0 %	25 %	15902048
14	NC_003098	AATT	2	8	3403	3410	50 %	50 %	0 %	0 %	15902048
15	NC_003098	CAAA	2	8	3680	3687	75 %	0 %	0 %	25 %	15902048
16	NC_003098	CTTG	2	8	3848	3855	0 %	50 %	25 %	25 %	15902048
17	NC_003098	ACTT	2	8	3864	3871	25 %	50 %	0 %	25 %	15902048
18	NC_003098	AAAT	2	8	4180	4187	75 %	25 %	0 %	0 %	15902049
19	NC_003098	TTGA	2	8	4261	4268	25 %	50 %	25 %	0 %	15902049
20	NC_003098	ATGA	2	8	4384	4391	50 %	25 %	25 %	0 %	15902049
21	NC_003098	GATT	2	8	5129	5136	25 %	50 %	25 %	0 %	15902050
22	NC_003098	GAAA	2	8	5394	5401	75 %	0 %	25 %	0 %	15902050
23	NC_003098	TTTA	2	8	7437	7444	25 %	75 %	0 %	0 %	15902050
24	NC_003098	GTCG	2	8	7498	7505	0 %	25 %	50 %	25 %	15902050
25	NC_003098	ATCA	2	8	7551	7558	50 %	25 %	0 %	25 %	15902050
26	NC_003098	GAAA	2	8	8020	8027	75 %	0 %	25 %	0 %	15902050
27	NC_003098	AAGA	2	8	8176	8183	75 %	0 %	25 %	0 %	15902050
28	NC_003098	GAAA	2	8	9159	9166	75 %	0 %	25 %	0 %	15902053
29	NC_003098	TATT	2	8	9195	9202	25 %	75 %	0 %	0 %	15902053
30	NC_003098	TAAA	2	8	9326	9333	75 %	25 %	0 %	0 %	15902053
31	NC_003098	ATCA	2	8	9401	9408	50 %	25 %	0 %	25 %	15902053
32	NC_003098	GAAG	2	8	9544	9551	50 %	0 %	50 %	0 %	15902053
33	NC_003098	TTCT	2	8	9663	9670	0 %	75 %	0 %	25 %	15902053
34	NC_003098	ATCA	2	8	9712	9719	50 %	25 %	0 %	25 %	15902053
35	NC_003098	CAGC	2	8	9737	9744	25 %	0 %	25 %	50 %	15902053
36	NC_003098	TTCT	2	8	10259	10266	0 %	75 %	0 %	25 %	15902053
37	NC_003098	CTAT	2	8	10751	10758	25 %	50 %	0 %	25 %	15902054
38	NC_003098	CTTA	2	8	10906	10913	25 %	50 %	0 %	25 %	15902054
39	NC_003098	ATTT	2	8	11305	11312	25 %	75 %	0 %	0 %	15902054
40	NC_003098	AATT	2	8	11338	11345	50 %	50 %	0 %	0 %	15902054
41	NC_003098	TTTA	2	8	11444	11451	25 %	75 %	0 %	0 %	15902054
42	NC_003098	AAAG	2	8	11961	11968	75 %	0 %	25 %	0 %	15902055
43	NC_003098	AGAA	2	8	12157	12164	75 %	0 %	25 %	0 %	15902055
44	NC_003098	TTAA	2	8	12195	12202	50 %	50 %	0 %	0 %	15902056
45	NC_003098	ACCA	2	8	12352	12359	50 %	0 %	0 %	50 %	15902056
46	NC_003098	TGCT	2	8	12877	12884	0 %	50 %	25 %	25 %	15902056
47	NC_003098	GATG	2	8	13121	13128	25 %	25 %	50 %	0 %	15902056
48	NC_003098	TTGG	2	8	13230	13237	0 %	50 %	50 %	0 %	15902056
49	NC_003098	TGAA	2	8	13372	13379	50 %	25 %	25 %	0 %	15902056
50	NC_003098	AAGA	2	8	13470	13477	75 %	0 %	25 %	0 %	15902056
51	NC_003098	TCTA	2	8	13646	13653	25 %	50 %	0 %	25 %	15902056
52	NC_003098	TGGC	2	8	13675	13682	0 %	25 %	50 %	25 %	15902056
53	NC_003098	AACA	2	8	13879	13886	75 %	0 %	0 %	25 %	15902056
54	NC_003098	GTTC	2	8	13908	13915	0 %	50 %	25 %	25 %	15902056
55	NC_003098	ATGA	2	8	14115	14122	50 %	25 %	25 %	0 %	15902056
56	NC_003098	AAAC	2	8	14604	14611	75 %	0 %	0 %	25 %	15902057
57	NC_003098	GCTT	2	8	15230	15237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_003098	CCTG	2	8	15278	15285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_003098	GTGA	2	8	15558	15565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003098	AGCG	2	8	15729	15736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_003098	AGCC	2	8	16610	16617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_003098	GTAA	2	8	17032	17039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003098	GCGA	2	8	17188	17195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_003098	ATTC	2	8	18054	18061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_003098	CTAA	2	8	18408	18415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_003098	GTCT	2	8	18433	18440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003098	TAGG	2	8	19064	19071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003098	CTTT	2	8	21158	21165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_003098	ATGT	2	8	22593	22600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003098	GATA	2	8	23234	23241	50 %	25 %	25 %	0 %	15902065
71	NC_003098	CAAG	2	8	23398	23405	50 %	0 %	25 %	25 %	15902065
72	NC_003098	GGTT	2	8	23553	23560	0 %	50 %	50 %	0 %	15902065
73	NC_003098	CTTT	2	8	23610	23617	0 %	75 %	0 %	25 %	15902065
74	NC_003098	CTAT	2	8	23737	23744	25 %	50 %	0 %	25 %	15902065
75	NC_003098	TTGG	2	8	23841	23848	0 %	50 %	50 %	0 %	15902065
76	NC_003098	AACA	2	8	23887	23894	75 %	0 %	0 %	25 %	15902065
77	NC_003098	GAGG	2	8	24157	24164	25 %	0 %	75 %	0 %	15902066
78	NC_003098	AGCG	2	8	24276	24283	25 %	0 %	50 %	25 %	15902066
79	NC_003098	ATGC	2	8	24287	24294	25 %	25 %	25 %	25 %	15902066
80	NC_003098	TGAG	2	8	24324	24331	25 %	25 %	50 %	0 %	15902066
81	NC_003098	AATA	2	8	24724	24731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003098	TTAA	2	8	25004	25011	50 %	50 %	0 %	0 %	15902067
83	NC_003098	ATGT	2	8	25610	25617	25 %	50 %	25 %	0 %	15902068
84	NC_003098	GATT	2	8	25694	25701	25 %	50 %	25 %	0 %	15902068
85	NC_003098	CCAG	2	8	26235	26242	25 %	0 %	25 %	50 %	15902069
86	NC_003098	TCCA	2	8	26260	26267	25 %	25 %	0 %	50 %	15902069
87	NC_003098	TTCG	2	8	27389	27396	0 %	50 %	25 %	25 %	15902070
88	NC_003098	AGAA	2	8	27693	27700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003098	ACGG	2	8	27781	27788	25 %	0 %	50 %	25 %	15902071
90	NC_003098	GGGA	2	8	27930	27937	25 %	0 %	75 %	0 %	15902071
91	NC_003098	TTGA	2	8	28545	28552	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003098	TGGT	2	8	29118	29125	0 %	50 %	50 %	0 %	15902072
93	NC_003098	TTGA	2	8	29297	29304	25 %	50 %	25 %	0 %	15902072
94	NC_003098	TGAT	2	8	29310	29317	25 %	50 %	25 %	0 %	15902072
95	NC_003098	TTCT	2	8	29400	29407	0 %	75 %	0 %	25 %	15902072
96	NC_003098	ATCT	2	8	29468	29475	25 %	50 %	0 %	25 %	15902072
97	NC_003098	TGAT	2	8	29490	29497	25 %	50 %	25 %	0 %	15902072
98	NC_003098	CGTA	2	8	29542	29549	25 %	25 %	25 %	25 %	15902072
99	NC_003098	AATA	2	8	29647	29654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003098	TTCT	2	8	30021	30028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003098	GCTG	2	8	30184	30191	0 %	25 %	50 %	25 %	15902074
102	NC_003098	CTTC	2	8	30258	30265	0 %	50 %	0 %	50 %	15902074
103	NC_003098	TGAT	2	8	30776	30783	25 %	50 %	25 %	0 %	15902075
104	NC_003098	AATT	2	8	31114	31121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003098	CTAT	2	8	31218	31225	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_003098	TTGA	2	8	31327	31334	25 %	50 %	25 %	0 %	15902076
107	NC_003098	TTGG	2	8	32305	32312	0 %	50 %	50 %	0 %	15902076
108	NC_003098	ACTT	2	8	32560	32567	25 %	50 %	0 %	25 %	15902076
109	NC_003098	AAGA	2	8	32788	32795	75 %	0 %	25 %	0 %	15902076
110	NC_003098	CTTG	2	8	32799	32806	0 %	50 %	25 %	25 %	15902076
111	NC_003098	GCTG	2	8	32862	32869	0 %	25 %	50 %	25 %	15902076
112	NC_003098	AAAC	2	8	33853	33860	75 %	0 %	0 %	25 %	15902076
113	NC_003098	TAAA	2	8	33933	33940	75 %	25 %	0 %	0 %	15902076
114	NC_003098	TTGA	2	8	34444	34451	25 %	50 %	25 %	0 %	15902077
115	NC_003098	CCAA	2	8	35298	35305	50 %	0 %	0 %	50 %	15902078
116	NC_003098	CAAG	2	8	35443	35450	50 %	0 %	25 %	25 %	15902078
117	NC_003098	AGGC	2	8	35619	35626	25 %	0 %	50 %	25 %	15902078
118	NC_003098	AGCG	2	8	35968	35975	25 %	0 %	50 %	25 %	15902079
119	NC_003098	CAGC	2	8	36916	36923	25 %	0 %	25 %	50 %	15902079
120	NC_003098	TTTC	2	8	37470	37477	0 %	75 %	0 %	25 %	15902080
121	NC_003098	TCAA	2	8	37560	37567	50 %	25 %	0 %	25 %	15902080
122	NC_003098	CAAG	2	8	37621	37628	50 %	0 %	25 %	25 %	15902080
123	NC_003098	TCAA	2	8	37808	37815	50 %	25 %	0 %	25 %	15902081
124	NC_003098	GATT	2	8	37926	37933	25 %	50 %	25 %	0 %	15902081
125	NC_003098	TTCT	2	8	38217	38224	0 %	75 %	0 %	25 %	15902081
126	NC_003098	GCTT	2	8	38264	38271	0 %	50 %	25 %	25 %	15902081
127	NC_003098	GAAT	2	8	39265	39272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003098	TGCT	2	8	39560	39567	0 %	50 %	25 %	25 %	15902084
129	NC_003098	ATTT	2	8	40090	40097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003098	CTTT	2	8	40252	40259	0 %	75 %	0 %	25 %	15902085
131	NC_003098	GGGA	2	8	41650	41657	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003098	GAAG	2	8	41673	41680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003098	TGAC	2	8	41787	41794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_003098	ATGG	2	8	42037	42044	25 %	25 %	50 %	0 %	15902087
135	NC_003098	AAGG	2	8	42169	42176	50 %	0 %	50 %	0 %	15902087
136	NC_003098	CTTG	2	8	42588	42595	0 %	50 %	25 %	25 %	15902087
137	NC_003098	ATGG	2	8	43144	43151	25 %	25 %	50 %	0 %	15902087
138	NC_003098	CAGA	2	8	43735	43742	50 %	0 %	25 %	25 %	15902087
139	NC_003098	TTGC	2	8	44011	44018	0 %	50 %	25 %	25 %	15902087
140	NC_003098	CAGT	2	8	44376	44383	25 %	25 %	25 %	25 %	15902088
141	NC_003098	GCAG	2	8	44512	44519	25 %	0 %	50 %	25 %	15902088
142	NC_003098	GAAG	2	8	46036	46043	50 %	0 %	50 %	0 %	15902089
143	NC_003098	ATTG	2	8	46099	46106	25 %	50 %	25 %	0 %	15902089
144	NC_003098	CTTT	2	8	46740	46747	0 %	75 %	0 %	25 %	15902090
145	NC_003098	CTTT	2	8	47004	47011	0 %	75 %	0 %	25 %	15902090
146	NC_003098	GGTC	2	8	47285	47292	0 %	25 %	50 %	25 %	15902090
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