MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 26258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003098	AAC	2	6	164	169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902045
2	NC_003098	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902045
3	NC_003098	GTA	2	6	184	189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902045
4	NC_003098	GAA	2	6	271	276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902045
5	NC_003098	GGA	2	6	463	468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902045
6	NC_003098	TTA	2	6	490	495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902045
7	NC_003098	TTA	2	6	566	571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902045
8	NC_003098	GAT	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902045
9	NC_003098	GAA	2	6	694	699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902045
10	NC_003098	GAG	2	6	787	792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902045
11	NC_003098	TGC	2	6	1029	1034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902045
12	NC_003098	ATA	2	6	1217	1222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902045
13	NC_003098	AAT	2	6	1358	1363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902045
14	NC_003098	TAT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003098	TAT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003098	TAA	2	6	1538	1543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902046
17	NC_003098	CTT	2	6	1729	1734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902046
18	NC_003098	CTT	2	6	1746	1751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902046
19	NC_003098	CTT	2	6	1756	1761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902046
20	NC_003098	GTA	2	6	1773	1778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902046
21	NC_003098	ATT	2	6	1953	1958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902046
22	NC_003098	TGC	2	6	1973	1978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902046
23	NC_003098	TGA	2	6	2108	2113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902046
24	NC_003098	GAT	2	6	2169	2174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902046
25	NC_003098	ACT	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902046
26	NC_003098	GTT	2	6	2412	2417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902046
27	NC_003098	GAA	2	6	2457	2462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902046
28	NC_003098	CAG	2	6	2602	2607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902046
29	NC_003098	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003098	TTG	2	6	2741	2746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902047
31	NC_003098	TGT	2	6	2859	2864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902047
32	NC_003098	ATG	2	6	2866	2871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902047
33	NC_003098	ATT	2	6	2905	2910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902047
34	NC_003098	CAG	2	6	3010	3015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902048
35	NC_003098	GCA	2	6	3084	3089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902048
36	NC_003098	TGG	2	6	3127	3132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902048
37	NC_003098	TGA	3	9	3320	3328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902048
38	NC_003098	TTC	2	6	3505	3510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902048
39	NC_003098	AGA	2	6	3530	3535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902048
40	NC_003098	GAC	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902048
41	NC_003098	AGT	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902048
42	NC_003098	GAA	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902048
43	NC_003098	GAT	2	6	3765	3770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902048
44	NC_003098	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902048
45	NC_003098	CTC	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902048
46	NC_003098	AGC	2	6	3932	3937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902048
47	NC_003098	TAT	2	6	3941	3946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902048
48	NC_003098	AAG	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902048
49	NC_003098	GAA	2	6	4053	4058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902048
50	NC_003098	TAA	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003098	GAA	2	6	4278	4283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902049
52	NC_003098	TTA	2	6	4414	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902049
53	NC_003098	GAT	2	6	4462	4467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902049
54	NC_003098	CAG	2	6	4511	4516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902049
55	NC_003098	TAT	2	6	4539	4544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902049
56	NC_003098	GTT	2	6	4615	4620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902049
57	NC_003098	CAT	2	6	4621	4626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902049
58	NC_003098	GAT	2	6	4648	4653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902049
59	NC_003098	ACT	2	6	4700	4705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902049
60	NC_003098	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902050
61	NC_003098	CTA	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902050
62	NC_003098	AGA	2	6	4896	4901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902050
63	NC_003098	GAT	2	6	5002	5007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
64	NC_003098	TGG	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902050
65	NC_003098	GCA	2	6	5119	5124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902050
66	NC_003098	GAA	2	6	5188	5193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902050
67	NC_003098	GAG	2	6	5282	5287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902050
68	NC_003098	TGA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
69	NC_003098	AGA	2	6	5529	5534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902050
70	NC_003098	TGA	2	6	5655	5660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
71	NC_003098	TGA	2	6	5672	5677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
72	NC_003098	AGA	2	6	5721	5726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902050
73	NC_003098	AGA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902050
74	NC_003098	ATT	2	6	5953	5958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902050
75	NC_003098	GGA	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902050
76	NC_003098	CGT	2	6	6163	6168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902050
77	NC_003098	ACA	2	6	6177	6182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902050
78	NC_003098	TGT	2	6	6237	6242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902050
79	NC_003098	CAT	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902050
80	NC_003098	TGA	2	6	6486	6491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
81	NC_003098	TGA	4	12	6546	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
82	NC_003098	TGA	2	6	6570	6575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
83	NC_003098	GAT	2	6	6598	6603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
84	NC_003098	GTA	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
85	NC_003098	CGA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902050
86	NC_003098	TGT	2	6	6942	6947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902050
87	NC_003098	TGA	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
88	NC_003098	TGA	2	6	6975	6980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
89	NC_003098	GAA	2	6	7026	7031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902050
90	NC_003098	CCG	2	6	7126	7131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15902050
91	NC_003098	ACA	2	6	7238	7243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902050
92	NC_003098	ACT	3	9	7390	7398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902050
93	NC_003098	ATT	2	6	7399	7404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902050
94	NC_003098	TTA	2	6	7723	7728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902050
95	NC_003098	GTA	2	6	7951	7956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902050
96	NC_003098	ATA	2	6	8030	8035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902050
97	NC_003098	ATT	2	6	8087	8092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902050
98	NC_003098	CTG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902050
99	NC_003098	TTA	2	6	8224	8229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902050
100	NC_003098	TCT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_003098	AAT	2	6	8300	8305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003098	TAA	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003098	CGT	2	6	8365	8370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902051
104	NC_003098	TGC	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902051
105	NC_003098	GCA	2	6	8536	8541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902051
106	NC_003098	AGA	2	6	8574	8579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902051
107	NC_003098	AAT	2	6	8606	8611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902052
108	NC_003098	CGT	2	6	8636	8641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902052
109	NC_003098	TGA	2	6	8649	8654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902052
110	NC_003098	TAT	2	6	8709	8714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902052
111	NC_003098	TGA	2	6	8812	8817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902052
112	NC_003098	TGC	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902052
113	NC_003098	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902052
114	NC_003098	TTA	2	6	8964	8969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003098	GAA	2	6	9012	9017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902053
116	NC_003098	ATT	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902053
117	NC_003098	AAG	2	6	9049	9054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902053
118	NC_003098	ATT	2	6	9085	9090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902053
119	NC_003098	TTG	2	6	9091	9096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902053
120	NC_003098	GTC	2	6	9145	9150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902053
121	NC_003098	TTA	2	6	9168	9173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902053
122	NC_003098	TAG	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902053
123	NC_003098	ATC	2	6	9362	9367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902053
124	NC_003098	CAA	2	6	9419	9424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902053
125	NC_003098	AAG	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902053
126	NC_003098	ATC	2	6	9492	9497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902053
127	NC_003098	GAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902053
128	NC_003098	ACT	2	6	9691	9696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902053
129	NC_003098	AAG	2	6	9701	9706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902053
130	NC_003098	TAT	2	6	9766	9771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902053
131	NC_003098	ATA	2	6	9896	9901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902053
132	NC_003098	GAT	2	6	10036	10041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902053
133	NC_003098	TCT	2	6	10066	10071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902053
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264	NC_003098	GAA	2	6	20710	20715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_003098	TTA	3	9	20857	20865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902060
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268	NC_003098	GAA	2	6	21122	21127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_003098	TGA	2	6	21216	21221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_003098	ATT	2	6	21223	21228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_003098	GTG	2	6	21357	21362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
272	NC_003098	TTA	2	6	21406	21411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_003098	TTG	2	6	21471	21476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_003098	TGA	2	6	21794	21799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_003098	TGA	2	6	21811	21816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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