MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium jeikeium K411 plasmid pKW4

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003080	GTT	2	6	208	213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320555
2	NC_003080	CGG	2	6	330	335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
3	NC_003080	GTA	2	6	338	343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
4	NC_003080	GCA	2	6	381	386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320555
5	NC_003080	CTT	2	6	388	393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320555
6	NC_003080	CAC	2	6	471	476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
7	NC_003080	CGT	2	6	528	533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
8	NC_003080	GTT	2	6	559	564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320555
9	NC_003080	CGG	2	6	594	599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
10	NC_003080	GCT	2	6	642	647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
11	NC_003080	CAC	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
12	NC_003080	ACC	2	6	800	805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
13	NC_003080	CGG	2	6	807	812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
14	NC_003080	GAT	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
15	NC_003080	CGA	2	6	927	932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320555
16	NC_003080	ATC	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320555
17	NC_003080	TCG	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320555
18	NC_003080	TAG	2	6	1383	1388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320555
19	NC_003080	CCA	2	6	1448	1453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320555
20	NC_003080	GGC	2	6	1465	1470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320555
21	NC_003080	ACT	2	6	1595	1600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320555
22	NC_003080	AAG	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320555
23	NC_003080	CAA	2	6	2997	3002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
24	NC_003080	ACT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
25	NC_003080	CAA	2	6	3075	3080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
26	NC_003080	CTA	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
27	NC_003080	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
28	NC_003080	CAG	2	6	3291	3296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320556
29	NC_003080	AAG	2	6	3317	3322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
30	NC_003080	CCG	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320556
31	NC_003080	CCA	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320556
32	NC_003080	ACC	2	6	3505	3510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320556
33	NC_003080	AGA	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
34	NC_003080	AGA	2	6	3596	3601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
35	NC_003080	CAT	2	6	3717	3722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
36	NC_003080	CAG	2	6	3782	3787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320556
37	NC_003080	TGA	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
38	NC_003080	TTC	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320556
39	NC_003080	AGA	2	6	3901	3906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320556
40	NC_003080	AGT	2	6	4014	4019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
41	NC_003080	TAC	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320556
42	NC_003080	CAA	2	6	4111	4116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320556
43	NC_003080	AGT	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320556
44	NC_003080	TTC	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320556
45	NC_003080	GTA	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320557
46	NC_003080	GAC	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320557
47	NC_003080	ATC	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320557
48	NC_003080	TCT	3	9	4413	4421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320557
49	NC_003080	AGA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320557
50	NC_003080	AAT	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15320557
51	NC_003080	GCA	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320557
52	NC_003080	TCC	2	6	4669	4674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320558
53	NC_003080	GTC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320558
54	NC_003080	GCT	2	6	4735	4740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320558
55	NC_003080	ACG	2	6	4860	4865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320558
56	NC_003080	CCA	2	6	4984	4989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320558
57	NC_003080	TCT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320558
58	NC_003080	GTA	2	6	5180	5185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320558
59	NC_003080	TCT	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320558
60	NC_003080	TCC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320558
61	NC_003080	CAG	2	6	5430	5435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320558
62	NC_003080	ACT	2	6	5527	5532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320558
63	NC_003080	CCT	2	6	5552	5557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320559
64	NC_003080	ATA	2	6	5604	5609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15320559
65	NC_003080	GAT	2	6	5813	5818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320559
66	NC_003080	ATC	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320559
67	NC_003080	GAA	2	6	5868	5873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320559
68	NC_003080	AGA	2	6	6127	6132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320559
69	NC_003080	AGT	2	6	6195	6200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320559
70	NC_003080	ATT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15320559
71	NC_003080	AGG	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320560
72	NC_003080	TCA	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320560
73	NC_003080	GGA	2	6	6514	6519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320560
74	NC_003080	GAT	3	9	6554	6562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320560
75	NC_003080	TGT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320560
76	NC_003080	GTA	2	6	6592	6597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320561
77	NC_003080	TTC	2	6	6682	6687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
78	NC_003080	TCT	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
79	NC_003080	ACG	2	6	6791	6796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320561
80	NC_003080	TTC	2	6	6800	6805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320561
81	NC_003080	ATC	2	6	7472	7477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320562
82	NC_003080	GGC	2	6	7558	7563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320562
83	NC_003080	CGC	2	6	7629	7634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320562
84	NC_003080	GGA	2	6	7683	7688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320562
85	NC_003080	GGT	2	6	7744	7749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15320562
86	NC_003080	TCG	2	6	7767	7772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320562
87	NC_003080	ACG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320562
88	NC_003080	TCG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320562
89	NC_003080	CTC	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320562
90	NC_003080	AGT	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320562
91	NC_003080	CTG	2	6	8460	8465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320563
92	NC_003080	GCC	2	6	8475	8480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320563
93	NC_003080	GAT	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320563
94	NC_003080	ACT	2	6	8627	8632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320563
95	NC_003080	TGT	2	6	8633	8638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320563
96	NC_003080	CAA	2	6	8761	8766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	62420831
97	NC_003080	CGA	2	6	8782	8787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	62420831
98	NC_003080	TTG	2	6	8835	8840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	62420831
99	NC_003080	CAC	2	6	8847	8852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	62420831
100	NC_003080	CGT	2	6	9579	9584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320564
101	NC_003080	TCA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320564
102	NC_003080	CTT	2	6	9636	9641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320564
103	NC_003080	AGT	2	6	9690	9695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320564
104	NC_003080	AGG	2	6	10099	10104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320565
105	NC_003080	CGG	2	6	10285	10290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320565
106	NC_003080	CTT	2	6	10348	10353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320565
107	NC_003080	CGT	2	6	10359	10364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320565
108	NC_003080	CGC	2	6	10388	10393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320565
109	NC_003080	CTG	2	6	10462	10467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320565
110	NC_003080	GTC	2	6	10968	10973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320566
111	NC_003080	TGG	2	6	10984	10989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15320566
112	NC_003080	ACG	2	6	11007	11012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320566
113	NC_003080	GGA	2	6	11114	11119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320566
114	NC_003080	TGC	2	6	11122	11127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320566
115	NC_003080	CAT	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320566
116	NC_003080	TGA	2	6	11210	11215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320566
117	NC_003080	GAA	2	6	11378	11383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320566
118	NC_003080	GCG	2	6	11386	11391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320566
119	NC_003080	GAC	2	6	12096	12101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320567
120	NC_003080	CGA	2	6	12170	12175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320567
121	NC_003080	GCA	2	6	12199	12204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320567
122	NC_003080	AAG	2	6	12205	12210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15320567
123	NC_003080	TCA	3	9	12211	12219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320567
124	NC_003080	CAT	2	6	12272	12277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320567
125	NC_003080	ACT	2	6	12279	12284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15320567
126	NC_003080	TTC	2	6	12372	12377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320567
127	NC_003080	GTT	2	6	12390	12395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15320567
128	NC_003080	AGC	2	6	12442	12447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320567
129	NC_003080	TCC	2	6	12465	12470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15320567
130	NC_003080	GTC	2	6	12474	12479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15320567
131	NC_003080	ACC	2	6	12526	12531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320567
132	NC_003080	TTC	2	6	12606	12611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15320567
133	NC_003080	AAC	2	6	12952	12957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320567
134	NC_003080	AGG	2	6	13352	13357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320568
135	NC_003080	GCA	4	12	13389	13400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320568
136	NC_003080	AGC	2	6	13589	13594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320568
137	NC_003080	CCG	2	6	13618	13623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320568
138	NC_003080	TAG	2	6	13627	13632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15320568
139	NC_003080	CCG	2	6	13705	13710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15320568
140	NC_003080	GCG	2	6	13830	13835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15320568
141	NC_003080	ACG	2	6	13867	13872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15320568
142	NC_003080	TAA	2	6	13959	13964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15320569
143	NC_003080	CAA	2	6	14002	14007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15320569
144	NC_003080	CAC	2	6	14029	14034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15320569
145	NC_003080	GGA	2	6	14083	14088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15320569

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.