MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymB

Total Repeats: 1239

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003078	GAAGA	2	10	544	553	60 %	0 %	40 %	0 %	16263749
2	NC_003078	CCTGC	2	10	1707	1716	0 %	20 %	20 %	60 %	16263750
3	NC_003078	TCGCC	2	10	4267	4276	0 %	20 %	20 %	60 %	16263752
4	NC_003078	CGGCG	2	10	5299	5308	0 %	0 %	60 %	40 %	16263752
5	NC_003078	GCCGC	2	10	9611	9620	0 %	0 %	40 %	60 %	16263757
6	NC_003078	ACCGG	2	10	10705	10714	20 %	0 %	40 %	40 %	16263758
7	NC_003078	CGTTT	2	10	10860	10869	0 %	60 %	20 %	20 %	16263758
8	NC_003078	AGCGA	2	10	13516	13525	40 %	0 %	40 %	20 %	16263760
9	NC_003078	GCGCG	2	10	14214	14223	0 %	0 %	60 %	40 %	16263760
10	NC_003078	TGACA	2	10	14371	14380	40 %	20 %	20 %	20 %	16263761
11	NC_003078	CCGGA	2	10	15943	15952	20 %	0 %	40 %	40 %	16263762
12	NC_003078	TTTTC	2	10	16298	16307	0 %	80 %	0 %	20 %	16263762
13	NC_003078	GGCCG	2	10	16906	16915	0 %	0 %	60 %	40 %	16263763
14	NC_003078	GGCGA	2	10	18496	18505	20 %	0 %	60 %	20 %	16263763
15	NC_003078	GGTCG	2	10	23556	23565	0 %	20 %	60 %	20 %	16263768
16	NC_003078	GATCG	2	10	25806	25815	20 %	20 %	40 %	20 %	16263769
17	NC_003078	GTGGA	2	10	26196	26205	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003078	AGGGC	2	10	27734	27743	20 %	0 %	60 %	20 %	16263771
19	NC_003078	CGGCG	2	10	27981	27990	0 %	0 %	60 %	40 %	16263771
20	NC_003078	GCCGA	2	10	29131	29140	20 %	0 %	40 %	40 %	16263771
21	NC_003078	CGACC	2	10	30135	30144	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_003078	CGTCA	2	10	33581	33590	20 %	20 %	20 %	40 %	16263774
23	NC_003078	CCCTC	2	10	35934	35943	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_003078	CGGCG	2	10	36623	36632	0 %	0 %	60 %	40 %	16263776
25	NC_003078	CCGGC	2	10	36703	36712	0 %	0 %	40 %	60 %	16263776
26	NC_003078	ACGCC	2	10	37033	37042	20 %	0 %	20 %	60 %	16263776
27	NC_003078	CGGCG	2	10	38230	38239	0 %	0 %	60 %	40 %	16263778
28	NC_003078	TCGGC	2	10	38580	38589	0 %	20 %	40 %	40 %	16263778
29	NC_003078	GCTGC	2	10	39088	39097	0 %	20 %	40 %	40 %	16263778
30	NC_003078	GCAAC	2	10	40369	40378	40 %	0 %	20 %	40 %	16263779
31	NC_003078	TCGAG	2	10	41035	41044	20 %	20 %	40 %	20 %	16263780
32	NC_003078	GCTCG	2	10	41503	41512	0 %	20 %	40 %	40 %	16263781
33	NC_003078	GCGCG	2	10	44071	44080	0 %	0 %	60 %	40 %	16263784
34	NC_003078	GGCGC	2	10	47835	47844	0 %	0 %	60 %	40 %	16263788
35	NC_003078	GCTTG	2	10	48197	48206	0 %	40 %	40 %	20 %	16263788
36	NC_003078	TCTAG	2	10	49140	49149	20 %	40 %	20 %	20 %	16263790
37	NC_003078	GGCGC	2	10	49655	49664	0 %	0 %	60 %	40 %	16263790
38	NC_003078	CGGCA	2	10	51064	51073	20 %	0 %	40 %	40 %	16263791
39	NC_003078	CGAGC	2	10	52664	52673	20 %	0 %	40 %	40 %	16263793
40	NC_003078	CACGC	2	10	52771	52780	20 %	0 %	20 %	60 %	16263793
41	NC_003078	AATGC	2	10	56816	56825	40 %	20 %	20 %	20 %	16263796
42	NC_003078	GGCGA	2	10	61721	61730	20 %	0 %	60 %	20 %	16263800
43	NC_003078	GCGGT	2	10	61760	61769	0 %	20 %	60 %	20 %	16263800
44	NC_003078	GTGCC	2	10	63513	63522	0 %	20 %	40 %	40 %	16263802
45	NC_003078	AGCCG	2	10	67441	67450	20 %	0 %	40 %	40 %	16263804
46	NC_003078	GGGAC	2	10	67741	67750	20 %	0 %	60 %	20 %	16263805
47	NC_003078	GGTGG	2	10	68784	68793	0 %	20 %	80 %	0 %	16263806
48	NC_003078	ATCAG	2	10	69265	69274	40 %	20 %	20 %	20 %	16263806
49	NC_003078	CGGCT	2	10	70585	70594	0 %	20 %	40 %	40 %	16263808
50	NC_003078	CGGCA	2	10	77801	77810	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_003078	CCGCG	2	10	79606	79615	0 %	0 %	40 %	60 %	16263819
52	NC_003078	GCGTC	2	10	81433	81442	0 %	20 %	40 %	40 %	16263820
53	NC_003078	TCCCG	2	10	81546	81555	0 %	20 %	20 %	60 %	16263820
54	NC_003078	AAAGG	2	10	82333	82342	60 %	0 %	40 %	0 %	16263821
55	NC_003078	ATTGA	2	10	88013	88022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003078	ACGGC	2	10	90479	90488	20 %	0 %	40 %	40 %	16263827
57	NC_003078	ACGAC	2	10	91304	91313	40 %	0 %	20 %	40 %	16263827
58	NC_003078	CTTTT	2	10	91507	91516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_003078	CGTTC	2	10	91794	91803	0 %	40 %	20 %	40 %	195970069
60	NC_003078	TCGAT	2	10	92192	92201	20 %	40 %	20 %	20 %	195970069
61	NC_003078	GCGCC	2	10	96291	96300	0 %	0 %	40 %	60 %	16263835
62	NC_003078	TGGCG	2	10	96516	96525	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_003078	ACGGC	2	10	96957	96966	20 %	0 %	40 %	40 %	16263836
64	NC_003078	AAGGC	2	10	97495	97504	40 %	0 %	40 %	20 %	16263836
65	NC_003078	TGGCT	2	10	99211	99220	0 %	40 %	40 %	20 %	16263839
66	NC_003078	GCGCC	2	10	99728	99737	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
67	NC_003078	CGTTG	2	10	100018	100027	0 %	40 %	40 %	20 %	16263840
68	NC_003078	GAGGG	2	10	100214	100223	20 %	0 %	80 %	0 %	16263840
69	NC_003078	TTCCT	2	10	100733	100742	0 %	60 %	0 %	40 %	16263841
70	NC_003078	TTCTG	2	10	100941	100950	0 %	60 %	20 %	20 %	16263841
71	NC_003078	CAGCG	2	10	101215	101224	20 %	0 %	40 %	40 %	16263841
72	NC_003078	CTCGC	2	10	102383	102392	0 %	20 %	20 %	60 %	16263842
73	NC_003078	CGAAG	2	10	102588	102597	40 %	0 %	40 %	20 %	16263842
74	NC_003078	CCTCG	2	10	104442	104451	0 %	20 %	20 %	60 %	16263843
75	NC_003078	TCGGC	2	10	105664	105673	0 %	20 %	40 %	40 %	16263845
76	NC_003078	TGCCT	2	10	106101	106110	0 %	40 %	20 %	40 %	16263845
77	NC_003078	GCGGA	2	10	107096	107105	20 %	0 %	60 %	20 %	16263846
78	NC_003078	GGCGC	2	10	108474	108483	0 %	0 %	60 %	40 %	16263847
79	NC_003078	CGTTC	2	10	110494	110503	0 %	40 %	20 %	40 %	16263849
80	NC_003078	CCCGA	2	10	110570	110579	20 %	0 %	20 %	60 %	16263849
81	NC_003078	GCTGC	2	10	111265	111274	0 %	20 %	40 %	40 %	16263850
82	NC_003078	ACCGC	2	10	113044	113053	20 %	0 %	20 %	60 %	16263850
83	NC_003078	GGCGC	2	10	113094	113103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_003078	AACGG	2	10	114106	114115	40 %	0 %	40 %	20 %	16263851
85	NC_003078	ACGGT	2	10	114745	114754	20 %	20 %	40 %	20 %	16263851
86	NC_003078	CCGCT	2	10	115208	115217	0 %	20 %	20 %	60 %	16263852
87	NC_003078	GCGCC	2	10	115676	115685	0 %	0 %	40 %	60 %	16263852
88	NC_003078	CAGGA	2	10	116805	116814	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_003078	GCGCG	2	10	117043	117052	0 %	0 %	60 %	40 %	16263854
90	NC_003078	GCTTC	2	10	117144	117153	0 %	40 %	20 %	40 %	16263854
91	NC_003078	AGCGG	2	10	117183	117192	20 %	0 %	60 %	20 %	16263854
92	NC_003078	CGGCG	2	10	119002	119011	0 %	0 %	60 %	40 %	16263856
93	NC_003078	GCGAT	2	10	119780	119789	20 %	20 %	40 %	20 %	16263856
94	NC_003078	GGAAA	2	10	120270	120279	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003078	CGATT	2	10	120500	120509	20 %	40 %	20 %	20 %	16263857
96	NC_003078	CGGGA	2	10	120775	120784	20 %	0 %	60 %	20 %	16263857
97	NC_003078	GGGGC	2	10	124672	124681	0 %	0 %	80 %	20 %	16263860
98	NC_003078	GCCCG	2	10	124691	124700	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_003078	TGCGG	2	10	129146	129155	0 %	20 %	60 %	20 %	16263864
100	NC_003078	GTCGA	2	10	129306	129315	20 %	20 %	40 %	20 %	16263864
101	NC_003078	ATCGG	2	10	130455	130464	20 %	20 %	40 %	20 %	16263864
102	NC_003078	GAAGG	2	10	131189	131198	40 %	0 %	60 %	0 %	16263865
103	NC_003078	CCTTC	2	10	132418	132427	0 %	40 %	0 %	60 %	16263866
104	NC_003078	GCCGC	2	10	132468	132477	0 %	0 %	40 %	60 %	16263866
105	NC_003078	CAGGG	2	10	132720	132729	20 %	0 %	60 %	20 %	16263867
106	NC_003078	GCGGA	2	10	134748	134757	20 %	0 %	60 %	20 %	16263871
107	NC_003078	GCGCT	2	10	135451	135460	0 %	20 %	40 %	40 %	16263872
108	NC_003078	ACGAG	2	10	135693	135702	40 %	0 %	40 %	20 %	16263872
109	NC_003078	CCGAT	2	10	136555	136564	20 %	20 %	20 %	40 %	16263872
110	NC_003078	GCGCC	2	10	138712	138721	0 %	0 %	40 %	60 %	16263874
111	NC_003078	TCCTC	2	10	140003	140012	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_003078	TCCAT	2	10	141346	141355	20 %	40 %	0 %	40 %	16263876
113	NC_003078	CAGTG	2	10	141488	141497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_003078	ATTTC	2	10	141626	141635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_003078	AATCT	2	10	141783	141792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_003078	AACGC	2	10	142199	142208	40 %	0 %	20 %	40 %	16263877
117	NC_003078	AACGA	2	10	146278	146287	60 %	0 %	20 %	20 %	16263880
118	NC_003078	CGCTC	2	10	146831	146840	0 %	20 %	20 %	60 %	16263881
119	NC_003078	GCCTC	2	10	147313	147322	0 %	20 %	20 %	60 %	16263881
120	NC_003078	CCGGA	2	10	147436	147445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_003078	ACCGC	2	10	147486	147495	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_003078	CCTCA	2	10	149015	149024	20 %	20 %	0 %	60 %	16263883
123	NC_003078	GGGTC	2	10	151287	151296	0 %	20 %	60 %	20 %	16263885
124	NC_003078	GGCAT	2	10	154175	154184	20 %	20 %	40 %	20 %	16263888
125	NC_003078	GGGTC	2	10	155369	155378	0 %	20 %	60 %	20 %	16263889
126	NC_003078	GGATC	2	10	158120	158129	20 %	20 %	40 %	20 %	16263891
127	NC_003078	TCGGA	2	10	158601	158610	20 %	20 %	40 %	20 %	16263892
128	NC_003078	CGCGG	2	10	159217	159226	0 %	0 %	60 %	40 %	16263892
129	NC_003078	GTCGT	2	10	159464	159473	0 %	40 %	40 %	20 %	16263892
130	NC_003078	CGTGC	2	10	163006	163015	0 %	20 %	40 %	40 %	16263895
131	NC_003078	CTCGT	2	10	164026	164035	0 %	40 %	20 %	40 %	16263896
132	NC_003078	CGCGC	2	10	164175	164184	0 %	0 %	40 %	60 %	16263896
133	NC_003078	GGCCG	2	10	164652	164661	0 %	0 %	60 %	40 %	16263897
134	NC_003078	AATTT	2	10	165495	165504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003078	GCGAG	2	10	165840	165849	20 %	0 %	60 %	20 %	16263898
136	NC_003078	TTGCC	2	10	166387	166396	0 %	40 %	20 %	40 %	16263898
137	NC_003078	GCCGC	2	10	170964	170973	0 %	0 %	40 %	60 %	16263902
138	NC_003078	TCGGC	2	10	172874	172883	0 %	20 %	40 %	40 %	16263903
139	NC_003078	GCCTA	2	10	175216	175225	20 %	20 %	20 %	40 %	16263904
140	NC_003078	TTTGC	2	10	175303	175312	0 %	60 %	20 %	20 %	16263905
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142	NC_003078	GCCGG	2	10	181203	181212	0 %	0 %	60 %	40 %	16263911
143	NC_003078	GCCGG	2	10	183737	183746	0 %	0 %	60 %	40 %	16263912
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146	NC_003078	CCTAA	2	10	195578	195587	40 %	20 %	0 %	40 %	16263926
147	NC_003078	CCGGA	2	10	195924	195933	20 %	0 %	40 %	40 %	16263926
148	NC_003078	GTCAT	2	10	196215	196224	20 %	40 %	20 %	20 %	16263926
149	NC_003078	GCCGC	2	10	197835	197844	0 %	0 %	40 %	60 %	16263928
150	NC_003078	TCGTC	2	10	200129	200138	0 %	40 %	20 %	40 %	16263931
151	NC_003078	CGCTG	2	10	201732	201741	0 %	20 %	40 %	40 %	16263933
152	NC_003078	GCCCT	2	10	202135	202144	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_003078	AGGGC	2	10	203402	203411	20 %	0 %	60 %	20 %	195970066
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156	NC_003078	GGCTC	2	10	205401	205410	0 %	20 %	40 %	40 %	16263938
157	NC_003078	CTTCT	2	10	205736	205745	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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161	NC_003078	AAGTG	2	10	209952	209961	40 %	20 %	40 %	0 %	16263941
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163	NC_003078	GCCGC	2	10	211492	211501	0 %	0 %	40 %	60 %	16263943
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165	NC_003078	GATCG	2	10	216205	216214	20 %	20 %	40 %	20 %	16263949
166	NC_003078	GATGA	2	10	216328	216337	40 %	20 %	40 %	0 %	16263949
167	NC_003078	CCATG	2	10	216607	216616	20 %	20 %	20 %	40 %	16263949
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169	NC_003078	GCGCA	2	10	218643	218652	20 %	0 %	40 %	40 %	16263952
170	NC_003078	TGATC	2	10	222219	222228	20 %	40 %	20 %	20 %	16263955
171	NC_003078	GGCTT	2	10	225220	225229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_003078	ATGAC	2	10	225373	225382	40 %	20 %	20 %	20 %	16263958
173	NC_003078	GCGAT	2	10	226890	226899	20 %	20 %	40 %	20 %	16263959
174	NC_003078	CGGTC	2	10	226943	226952	0 %	20 %	40 %	40 %	16263959
175	NC_003078	GCCCC	2	10	227297	227306	0 %	0 %	20 %	80 %	16263959
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177	NC_003078	CGGCG	2	10	231773	231782	0 %	0 %	60 %	40 %	16263964
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179	NC_003078	CGTTC	2	10	238658	238667	0 %	40 %	20 %	40 %	16263972
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181	NC_003078	CGCTT	2	10	240815	240824	0 %	40 %	20 %	40 %	16263974
182	NC_003078	CAGGC	2	10	241649	241658	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
183	NC_003078	TCCCG	2	10	243917	243926	0 %	20 %	20 %	60 %	16263977
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185	NC_003078	GCGCC	2	10	244743	244752	0 %	0 %	40 %	60 %	16263978
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197	NC_003078	CGGAT	2	10	257424	257433	20 %	20 %	40 %	20 %	16263989
198	NC_003078	GGCCA	2	10	258170	258179	20 %	0 %	40 %	40 %	16263990
199	NC_003078	AAGGC	2	10	258665	258674	40 %	0 %	40 %	20 %	16263990
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201	NC_003078	AGCGC	2	10	260201	260210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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203	NC_003078	CCGGA	2	10	261943	261952	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
204	NC_003078	GCTGG	2	10	262385	262394	0 %	20 %	60 %	20 %	16263995
205	NC_003078	CGGCG	2	10	262880	262889	0 %	0 %	60 %	40 %	16263995
206	NC_003078	AAATA	2	10	263970	263979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_003078	GAAAG	2	10	266800	266809	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
210	NC_003078	CTTCG	2	10	266876	266885	0 %	40 %	20 %	40 %	16264000
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219	NC_003078	ATGTT	2	10	278866	278875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
220	NC_003078	CCCGG	2	10	279048	279057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
221	NC_003078	GATCG	2	10	279068	279077	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
222	NC_003078	CGCGG	2	10	280108	280117	0 %	0 %	60 %	40 %	16264013
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229	NC_003078	GGGCG	2	10	291743	291752	0 %	0 %	80 %	20 %	16264024
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240	NC_003078	CGTCG	2	10	307255	307264	0 %	20 %	40 %	40 %	16264038
241	NC_003078	CGCAG	2	10	307525	307534	20 %	0 %	40 %	40 %	16264038
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243	NC_003078	GCCGC	2	10	309602	309611	0 %	0 %	40 %	60 %	16264039
244	NC_003078	GCAAA	2	10	310334	310343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
245	NC_003078	GATCG	2	10	313265	313274	20 %	20 %	40 %	20 %	16264046
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249	NC_003078	CGAGC	2	10	320231	320240	20 %	0 %	40 %	40 %	16264051
250	NC_003078	GGCGG	2	10	322221	322230	0 %	0 %	80 %	20 %	16264053
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254	NC_003078	TGGCG	2	10	323867	323876	0 %	20 %	60 %	20 %	16264054
255	NC_003078	GCCGA	2	10	324904	324913	20 %	0 %	40 %	40 %	16264055
256	NC_003078	GGGAC	2	10	326758	326767	20 %	0 %	60 %	20 %	16264058
257	NC_003078	AACGG	2	10	329298	329307	40 %	0 %	40 %	20 %	16264059
258	NC_003078	CGGCA	2	10	330550	330559	20 %	0 %	40 %	40 %	16264061
259	NC_003078	TTTCC	2	10	332005	332014	0 %	60 %	0 %	40 %	16264062
260	NC_003078	GAGTG	2	10	332093	332102	20 %	20 %	60 %	0 %	16264062
261	NC_003078	CCCGG	2	10	332420	332429	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
262	NC_003078	TGTGC	2	10	333564	333573	0 %	40 %	40 %	20 %	16264064
263	NC_003078	ATCGA	2	10	335977	335986	40 %	20 %	20 %	20 %	16264066
264	NC_003078	CCTTT	2	10	336700	336709	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
265	NC_003078	TCACG	2	10	337565	337574	20 %	20 %	20 %	40 %	195970061
266	NC_003078	GTCCG	2	10	338475	338484	0 %	20 %	40 %	40 %	195970061
267	NC_003078	ACCGA	2	10	338665	338674	40 %	0 %	20 %	40 %	195970061
268	NC_003078	TGGCG	2	10	339363	339372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
269	NC_003078	GGAGT	2	10	340562	340571	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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403	NC_003078	ACGGC	2	10	502684	502693	20 %	0 %	40 %	40 %	16264216
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405	NC_003078	GGAGT	2	10	509314	509323	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
406	NC_003078	TGATC	2	10	510232	510241	20 %	40 %	20 %	20 %	16264222
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