MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymB

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003078	GTGGA	2	10	26196	26205	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003078	CGACC	2	10	30135	30144	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_003078	CCCTC	2	10	35934	35943	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4	NC_003078	CGGCA	2	10	77801	77810	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_003078	ATTGA	2	10	88013	88022	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003078	CTTTT	2	10	91507	91516	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_003078	TGGCG	2	10	96516	96525	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_003078	GCGCC	2	10	99728	99737	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_003078	GGCGC	2	10	113094	113103	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_003078	CAGGA	2	10	116805	116814	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_003078	GGAAA	2	10	120270	120279	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003078	GCCCG	2	10	124691	124700	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_003078	TCCTC	2	10	140003	140012	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_003078	CAGTG	2	10	141488	141497	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_003078	ATTTC	2	10	141626	141635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_003078	AATCT	2	10	141783	141792	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_003078	CCGGA	2	10	147436	147445	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_003078	ACCGC	2	10	147486	147495	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_003078	AATTT	2	10	165495	165504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003078	GCCCT	2	10	202135	202144	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_003078	CTTCT	2	10	205736	205745	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_003078	GGCTT	2	10	225220	225229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_003078	CAGGC	2	10	241649	241658	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_003078	AGCGC	2	10	260201	260210	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_003078	CCGGA	2	10	261943	261952	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_003078	AAATA	2	10	263970	263979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003078	GAAAG	2	10	266800	266809	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003078	TTGAT	2	10	277304	277313	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003078	ATGTT	2	10	278866	278875	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003078	CCCGG	2	10	279048	279057	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_003078	GATCG	2	10	279068	279077	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_003078	TTTTC	2	10	290788	290797	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_003078	TTTGT	2	10	294221	294230	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003078	GCAAA	2	10	310334	310343	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_003078	CCCGG	2	10	332420	332429	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_003078	CCTTT	2	10	336700	336709	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_003078	TGGCG	2	10	339363	339372	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_003078	GGAGT	2	10	340562	340571	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003078	TATTT	2	10	343396	343405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003078	GGGGA	2	10	346011	346020	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003078	CTGTC	2	10	357546	357555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_003078	TAACA	2	10	380317	380326	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_003078	CGACC	2	10	402207	402216	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_003078	TTGAC	2	10	429392	429401	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_003078	CTCTA	2	10	429478	429487	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_003078	GGCAG	2	10	435979	435988	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_003078	CTTTC	2	10	438514	438523	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_003078	CGACA	2	10	440906	440915	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_003078	TGGCG	2	10	450689	450698	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_003078	CGTTT	2	10	454298	454307	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_003078	ACGGA	2	10	458841	458850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_003078	GAATC	2	10	470156	470165	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_003078	TCTTA	2	10	483860	483869	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003078	GGAGT	2	10	509314	509323	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003078	CGTCG	2	10	512631	512640	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_003078	GGCTA	2	10	541882	541891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_003078	CTGAT	2	10	543881	543890	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_003078	GACCG	2	10	543931	543940	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_003078	ATGGC	2	10	545984	545993	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_003078	CAGCT	2	10	552110	552119	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_003078	CTTCG	2	10	554761	554770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
62	NC_003078	AGGCT	2	10	563807	563816	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_003078	GCACC	2	10	573407	573416	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
64	NC_003078	CCTTT	2	10	574861	574870	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_003078	GCCGG	2	10	576897	576906	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_003078	GCGCG	2	10	582349	582358	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_003078	CGGCG	2	10	584644	584653	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_003078	CCAGA	2	10	585009	585018	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_003078	TTGAT	2	10	594433	594442	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003078	GGGAC	2	10	599839	599848	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_003078	GGCGG	2	10	610972	610981	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_003078	GCGAT	2	10	652932	652941	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_003078	GGTTA	2	10	653485	653494	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003078	CCGGC	2	10	663043	663052	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_003078	CAAAA	2	10	666916	666925	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_003078	ATGAA	2	10	670604	670613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003078	GGGAC	2	10	678291	678300	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_003078	GAAAG	2	10	679110	679119	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003078	TGTCC	2	10	679386	679395	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_003078	AAGGC	2	10	679640	679649	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_003078	AACCG	2	10	679738	679747	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_003078	AGTTG	2	10	685389	685398	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003078	GTTTC	2	10	687847	687856	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_003078	CATCC	2	10	687868	687877	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_003078	CTCGG	2	10	689346	689355	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_003078	ACGGT	2	10	707718	707727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_003078	TTGTT	2	10	723237	723246	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003078	GGGCG	2	10	733631	733640	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
89	NC_003078	GGCCG	2	10	740544	740553	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
90	NC_003078	GACCC	2	10	783724	783733	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_003078	AGCGC	3	15	793019	793033	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
92	NC_003078	CGCTG	2	10	793045	793054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_003078	CGCAA	2	10	800761	800770	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_003078	ATTAG	2	10	802103	802112	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003078	AACGG	2	10	802186	802195	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_003078	GCCGG	2	10	810672	810681	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_003078	ATGAA	2	10	818764	818773	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003078	CGGGA	2	10	822550	822559	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_003078	GAGAA	2	10	825379	825388	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003078	CGAAG	2	10	825399	825408	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_003078	GCGCG	2	10	828116	828125	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_003078	ATTTT	2	10	831036	831045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003078	GCTCT	2	10	841574	841583	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_003078	GTCTT	2	10	849992	850001	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_003078	CGGAG	2	10	850077	850086	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
106	NC_003078	GGGTC	2	10	850588	850597	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_003078	CCGCC	2	10	860371	860380	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
108	NC_003078	CGCCC	2	10	870873	870882	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
109	NC_003078	GATGC	2	10	892449	892458	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_003078	TCGGC	2	10	896806	896815	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
111	NC_003078	CCGCA	2	10	908072	908081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_003078	CAAAT	2	10	936706	936715	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_003078	CCCGA	2	10	950506	950515	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_003078	GCTCT	2	10	963903	963912	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_003078	TGAAG	2	10	966325	966334	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003078	ATAAA	2	10	980345	980354	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003078	CCGCC	2	10	998325	998334	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_003078	ACGTC	2	10	998424	998433	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_003078	TCGCA	2	10	1023191	1023200	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_003078	CGACC	2	10	1025632	1025641	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_003078	CCGGA	2	10	1042451	1042460	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_003078	TGCCC	2	10	1100245	1100254	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_003078	CCGGA	2	10	1106637	1106646	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_003078	GCGGG	2	10	1107266	1107275	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
125	NC_003078	CAAGG	2	10	1111977	1111986	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_003078	CGCAC	2	10	1126765	1126774	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_003078	GCACT	2	10	1141952	1141961	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_003078	TCCGA	2	10	1143041	1143050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_003078	CTGAT	2	10	1167843	1167852	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_003078	CCGCG	2	10	1168024	1168033	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
131	NC_003078	CTCCC	2	10	1203313	1203322	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
132	NC_003078	GGTCG	2	10	1222823	1222832	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_003078	TGCGG	2	10	1230145	1230154	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_003078	ACGCG	2	10	1232547	1232556	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_003078	GTCCC	2	10	1233298	1233307	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_003078	CCGGC	2	10	1241300	1241309	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
137	NC_003078	AAAAC	2	10	1243954	1243963	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_003078	CGACC	2	10	1268058	1268067	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_003078	TTTGT	2	10	1272296	1272305	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003078	GGTCG	2	10	1287789	1287798	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_003078	ATTGA	2	10	1288525	1288534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003078	GCCGC	2	10	1291360	1291369	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_003078	TAGCG	2	10	1319022	1319031	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_003078	GCAGC	2	10	1334982	1334991	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
145	NC_003078	CCGAT	2	10	1341682	1341691	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_003078	CGCAA	2	10	1369275	1369284	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_003078	CGGCC	2	10	1387325	1387334	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
148	NC_003078	TGCAA	2	10	1391127	1391136	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_003078	CCTCC	2	10	1397027	1397036	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
150	NC_003078	TGCTC	2	10	1427691	1427700	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
151	NC_003078	TCGAC	2	10	1441305	1441314	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_003078	CGGCG	2	10	1455830	1455839	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
153	NC_003078	TTCAA	2	10	1511019	1511028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_003078	CTGCC	2	10	1525553	1525562	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
155	NC_003078	GGCAG	2	10	1525712	1525721	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
156	NC_003078	GGCTG	2	10	1532352	1532361	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_003078	TGCCC	2	10	1532978	1532987	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
158	NC_003078	CTTCG	2	10	1586031	1586040	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_003078	CTTTG	2	10	1586745	1586754	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_003078	AGGAA	2	10	1606835	1606844	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_003078	CTGCA	2	10	1620453	1620462	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
162	NC_003078	GACCG	2	10	1633664	1633673	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_003078	CGGCC	2	10	1638349	1638358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
164	NC_003078	TCGGC	2	10	1665085	1665094	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
165	NC_003078	CGGCA	2	10	1681377	1681386	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.