MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	GATA	3	12	329	340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003065	AGCA	2	8	1558	1565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_003065	AGAA	2	8	1707	1714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003065	TAAA	2	8	3187	3194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003065	GAAA	2	8	5285	5292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003065	CTTT	2	8	6067	6074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_003065	ACAG	2	8	7420	7427	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_003065	AAAT	2	8	8444	8451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003065	GTTT	2	8	8458	8465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003065	CATA	2	8	8586	8593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_003065	AGGC	2	8	13248	13255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_003065	AATT	2	8	13338	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003065	TGAT	2	8	13360	13367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003065	TAAA	2	8	16070	16077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003065	ATCA	2	8	16191	16198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_003065	TTGA	2	8	16208	16215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003065	GTTA	2	8	16336	16343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003065	CGAA	2	8	20329	20336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_003065	AATT	2	8	21368	21375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003065	GCAA	2	8	21447	21454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_003065	TATT	2	8	21515	21522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003065	GATC	2	8	22954	22961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_003065	ATAA	2	8	23077	23084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003065	GATT	2	8	31525	31532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003065	CAAT	2	8	31541	31548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_003065	TTCA	2	8	35794	35801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_003065	CATT	2	8	40152	40159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003065	ACAG	2	8	53493	53500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003065	TCGT	2	8	58672	58679	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_003065	GAAA	2	8	70498	70505	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003065	GCGG	2	8	95873	95880	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_003065	TGTT	2	8	95948	95955	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003065	GTCA	2	8	101425	101432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_003065	CTTT	2	8	101625	101632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_003065	GTGC	2	8	116228	116235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003065	AGCG	2	8	119045	119052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_003065	TGAA	2	8	119081	119088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003065	GGAA	2	8	119101	119108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003065	CGCT	2	8	120340	120347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_003065	CCCA	2	8	120365	120372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_003065	CCTT	2	8	120410	120417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003065	AAGG	2	8	125644	125651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003065	GGTC	2	8	129960	129967	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_003065	GCAA	2	8	130004	130011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_003065	GCCC	2	8	130312	130319	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_003065	CAGT	2	8	133321	133328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_003065	CGGT	2	8	133468	133475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_003065	AGCA	2	8	135166	135173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_003065	CTGG	2	8	138358	138365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_003065	GGAC	2	8	139397	139404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_003065	GGAA	2	8	143796	143803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003065	TGTC	2	8	152825	152832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_003065	TTTC	2	8	155260	155267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_003065	CTTT	2	8	167389	167396	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_003065	TGAC	2	8	171992	171999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_003065	TCAG	2	8	172159	172166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_003065	CCGA	2	8	172456	172463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_003065	GGCA	2	8	175556	175563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_003065	ATGA	2	8	177206	177213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003065	CAGC	2	8	177263	177270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_003065	GCCG	2	8	179112	179119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_003065	GAAA	2	8	179129	179136	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003065	CCGA	2	8	179201	179208	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_003065	CCGA	2	8	183832	183839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003065	AAAT	2	8	195904	195911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003065	CGAT	2	8	199928	199935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_003065	TTGA	2	8	210083	210090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003065	CTTC	2	8	210949	210956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_003065	TGGC	2	8	214223	214230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.