MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 501

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	GATC	2	8	932	939	25 %	25 %	25 %	25 %	41223314
2	NC_003065	CAGT	2	8	1448	1455	25 %	25 %	25 %	25 %	41223314
3	NC_003065	ATGT	2	8	2665	2672	25 %	50 %	25 %	0 %	16119814
4	NC_003065	GGGC	2	8	2980	2987	0 %	0 %	75 %	25 %	16119814
5	NC_003065	TTGT	2	8	3027	3034	0 %	75 %	25 %	0 %	16119814
6	NC_003065	AATG	2	8	3638	3645	50 %	25 %	25 %	0 %	159161953
7	NC_003065	GCCA	2	8	3885	3892	25 %	0 %	25 %	50 %	159161953
8	NC_003065	TTGT	2	8	4002	4009	0 %	75 %	25 %	0 %	159161953
9	NC_003065	AAGA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	159161953
10	NC_003065	ACCA	2	8	4501	4508	50 %	0 %	0 %	50 %	159161953
11	NC_003065	GCTG	2	8	4849	4856	0 %	25 %	50 %	25 %	159161953
12	NC_003065	GGAG	2	8	5030	5037	25 %	0 %	75 %	0 %	159161953
13	NC_003065	CTTT	2	8	5058	5065	0 %	75 %	0 %	25 %	159161953
14	NC_003065	CCAG	2	8	6423	6430	25 %	0 %	25 %	50 %	16119816
15	NC_003065	ATGC	2	8	7795	7802	25 %	25 %	25 %	25 %	16119817
16	NC_003065	TTCA	2	8	7918	7925	25 %	50 %	0 %	25 %	16119817
17	NC_003065	GGTT	2	8	8180	8187	0 %	50 %	50 %	0 %	16119817
18	NC_003065	CCTG	2	8	8263	8270	0 %	25 %	25 %	50 %	16119817
19	NC_003065	TGCA	2	8	8838	8845	25 %	25 %	25 %	25 %	16119818
20	NC_003065	TGTT	2	8	9175	9182	0 %	75 %	25 %	0 %	16119818
21	NC_003065	CCTT	2	8	9251	9258	0 %	50 %	0 %	50 %	16119818
22	NC_003065	TTCT	2	8	9316	9323	0 %	75 %	0 %	25 %	16119818
23	NC_003065	CCCA	2	8	10621	10628	25 %	0 %	0 %	75 %	16119819
24	NC_003065	AACG	2	8	10685	10692	50 %	0 %	25 %	25 %	16119819
25	NC_003065	AGGC	2	8	10763	10770	25 %	0 %	50 %	25 %	16119819
26	NC_003065	ATTC	2	8	10981	10988	25 %	50 %	0 %	25 %	16119819
27	NC_003065	CATG	2	8	11377	11384	25 %	25 %	25 %	25 %	16119819
28	NC_003065	CGAT	2	8	11646	11653	25 %	25 %	25 %	25 %	16119820
29	NC_003065	GTCT	2	8	11774	11781	0 %	50 %	25 %	25 %	16119820
30	NC_003065	CCTG	2	8	11795	11802	0 %	25 %	25 %	50 %	16119820
31	NC_003065	TGCC	2	8	12088	12095	0 %	25 %	25 %	50 %	16119820
32	NC_003065	GATT	2	8	12185	12192	25 %	50 %	25 %	0 %	16119820
33	NC_003065	CCGG	2	8	12298	12305	0 %	0 %	50 %	50 %	16119820
34	NC_003065	TTCC	2	8	12838	12845	0 %	50 %	0 %	50 %	16119820
35	NC_003065	TTGC	3	12	13678	13689	0 %	50 %	25 %	25 %	16119821
36	NC_003065	ACGT	2	8	13737	13744	25 %	25 %	25 %	25 %	16119821
37	NC_003065	GGAA	2	8	13844	13851	50 %	0 %	50 %	0 %	16119821
38	NC_003065	TCCT	2	8	13939	13946	0 %	50 %	0 %	50 %	16119821
39	NC_003065	AGGA	2	8	14651	14658	50 %	0 %	50 %	0 %	16119822
40	NC_003065	AGGC	2	8	14761	14768	25 %	0 %	50 %	25 %	16119822
41	NC_003065	TGAC	2	8	14861	14868	25 %	25 %	25 %	25 %	16119822
42	NC_003065	GTAG	2	8	15291	15298	25 %	25 %	50 %	0 %	16119822
43	NC_003065	GTCG	2	8	15469	15476	0 %	25 %	50 %	25 %	16119822
44	NC_003065	CATG	2	8	15674	15681	25 %	25 %	25 %	25 %	16119822
45	NC_003065	AGTG	2	8	16689	16696	25 %	25 %	50 %	0 %	16119823
46	NC_003065	GCGT	2	8	17433	17440	0 %	25 %	50 %	25 %	16119823
47	NC_003065	GGGA	2	8	17566	17573	25 %	0 %	75 %	0 %	16119823
48	NC_003065	GAAA	2	8	17874	17881	75 %	0 %	25 %	0 %	16119823
49	NC_003065	TCTG	2	8	18257	18264	0 %	50 %	25 %	25 %	16119823
50	NC_003065	TTTC	2	8	18432	18439	0 %	75 %	0 %	25 %	16119823
51	NC_003065	CAAG	2	8	19555	19562	50 %	0 %	25 %	25 %	41223315
52	NC_003065	GAGG	2	8	19622	19629	25 %	0 %	75 %	0 %	41223315
53	NC_003065	ATCT	2	8	19630	19637	25 %	50 %	0 %	25 %	41223315
54	NC_003065	GTTG	2	8	19798	19805	0 %	50 %	50 %	0 %	41223315
55	NC_003065	GATT	2	8	20807	20814	25 %	50 %	25 %	0 %	16119825
56	NC_003065	GCCA	2	8	21037	21044	25 %	0 %	25 %	50 %	16119825
57	NC_003065	CATC	2	8	21938	21945	25 %	25 %	0 %	50 %	16119826
58	NC_003065	ATGC	2	8	23371	23378	25 %	25 %	25 %	25 %	16119827
59	NC_003065	GCAT	2	8	23477	23484	25 %	25 %	25 %	25 %	16119827
60	NC_003065	ATCA	2	8	23900	23907	50 %	25 %	0 %	25 %	16119827
61	NC_003065	GATC	2	8	24296	24303	25 %	25 %	25 %	25 %	16119827
62	NC_003065	CGAT	2	8	27141	27148	25 %	25 %	25 %	25 %	41223317
63	NC_003065	GCCG	2	8	27283	27290	0 %	0 %	50 %	50 %	41223318
64	NC_003065	GACT	2	8	28396	28403	25 %	25 %	25 %	25 %	16119831
65	NC_003065	GTCC	2	8	28791	28798	0 %	25 %	25 %	50 %	16119831
66	NC_003065	CGGC	2	8	29540	29547	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
67	NC_003065	GGAA	2	8	29838	29845	50 %	0 %	50 %	0 %	16119832
68	NC_003065	TGCA	2	8	30071	30078	25 %	25 %	25 %	25 %	16119833
69	NC_003065	TTCG	2	8	30960	30967	0 %	50 %	25 %	25 %	16119833
70	NC_003065	ACGC	2	8	30970	30977	25 %	0 %	25 %	50 %	16119833
71	NC_003065	GATC	2	8	32045	32052	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
72	NC_003065	TCGA	2	8	32109	32116	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
73	NC_003065	GGTG	2	8	32633	32640	0 %	25 %	75 %	0 %	16119834
74	NC_003065	CCTG	2	8	32763	32770	0 %	25 %	25 %	50 %	16119834
75	NC_003065	GACG	2	8	32915	32922	25 %	0 %	50 %	25 %	16119834
76	NC_003065	ATGC	2	8	33390	33397	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
77	NC_003065	GCGT	2	8	33478	33485	0 %	25 %	50 %	25 %	16119834
78	NC_003065	GCCG	2	8	33641	33648	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
79	NC_003065	ACGG	2	8	34020	34027	25 %	0 %	50 %	25 %	16119835
80	NC_003065	CCGA	2	8	34269	34276	25 %	0 %	25 %	50 %	16119835
81	NC_003065	GAGC	2	8	34334	34341	25 %	0 %	50 %	25 %	16119835
82	NC_003065	GCGA	2	8	34345	34352	25 %	0 %	50 %	25 %	16119835
83	NC_003065	TCGG	2	8	35241	35248	0 %	25 %	50 %	25 %	16119835
84	NC_003065	CAGC	2	8	35594	35601	25 %	0 %	25 %	50 %	16119835
85	NC_003065	GCCG	2	8	35685	35692	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
86	NC_003065	AACG	2	8	36950	36957	50 %	0 %	25 %	25 %	16119837
87	NC_003065	AAGC	2	8	37066	37073	50 %	0 %	25 %	25 %	16119837
88	NC_003065	CCGC	2	8	39071	39078	0 %	0 %	25 %	75 %	41223319
89	NC_003065	GTCC	2	8	39441	39448	0 %	25 %	25 %	50 %	41223320
90	NC_003065	GTTT	2	8	39616	39623	0 %	75 %	25 %	0 %	41223320
91	NC_003065	GGGT	2	8	40033	40040	0 %	25 %	75 %	0 %	41223320
92	NC_003065	TTCC	2	8	40690	40697	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
93	NC_003065	TGGC	2	8	40753	40760	0 %	25 %	50 %	25 %	159161955
94	NC_003065	CCTT	2	8	40791	40798	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
95	NC_003065	CTGC	2	8	40808	40815	0 %	25 %	25 %	50 %	159161955
96	NC_003065	CGAC	2	8	41122	41129	25 %	0 %	25 %	50 %	159161955
97	NC_003065	CAGA	2	8	41447	41454	50 %	0 %	25 %	25 %	16119842
98	NC_003065	CGTC	2	8	41875	41882	0 %	25 %	25 %	50 %	16119843
99	NC_003065	GTCC	2	8	41930	41937	0 %	25 %	25 %	50 %	16119843
100	NC_003065	CCGG	2	8	42071	42078	0 %	0 %	50 %	50 %	16119843
101	NC_003065	TCGT	2	8	42342	42349	0 %	50 %	25 %	25 %	16119843
102	NC_003065	CGCT	2	8	42572	42579	0 %	25 %	25 %	50 %	16119843
103	NC_003065	GTCA	2	8	43073	43080	25 %	25 %	25 %	25 %	41223322
104	NC_003065	TGGG	2	8	43352	43359	0 %	25 %	75 %	0 %	41223322
105	NC_003065	ACGG	2	8	43997	44004	25 %	0 %	50 %	25 %	41223323
106	NC_003065	TCCG	2	8	44035	44042	0 %	25 %	25 %	50 %	41223323
107	NC_003065	CGGG	2	8	44888	44895	0 %	0 %	75 %	25 %	16119846
108	NC_003065	CCGA	2	8	45459	45466	25 %	0 %	25 %	50 %	16119847
109	NC_003065	ACAT	2	8	45555	45562	50 %	25 %	0 %	25 %	16119847
110	NC_003065	GGCG	2	8	45728	45735	0 %	0 %	75 %	25 %	16119847
111	NC_003065	ACGA	2	8	46106	46113	50 %	0 %	25 %	25 %	16119847
112	NC_003065	GCTG	2	8	46925	46932	0 %	25 %	50 %	25 %	16119849
113	NC_003065	GGCA	2	8	47408	47415	25 %	0 %	50 %	25 %	16119850
114	NC_003065	GTCC	2	8	47724	47731	0 %	25 %	25 %	50 %	16119850
115	NC_003065	GAGC	2	8	47830	47837	25 %	0 %	50 %	25 %	16119850
116	NC_003065	CTCC	2	8	48009	48016	0 %	25 %	0 %	75 %	16119850
117	NC_003065	GCCG	2	8	48274	48281	0 %	0 %	50 %	50 %	16119850
118	NC_003065	GGAA	2	8	49089	49096	50 %	0 %	50 %	0 %	16119850
119	NC_003065	GTCG	2	8	49417	49424	0 %	25 %	50 %	25 %	16119850
120	NC_003065	CCAG	2	8	49453	49460	25 %	0 %	25 %	50 %	16119850
121	NC_003065	CGTT	2	8	50374	50381	0 %	50 %	25 %	25 %	159161957
122	NC_003065	ATCG	2	8	50629	50636	25 %	25 %	25 %	25 %	159161957
123	NC_003065	GTGC	2	8	51021	51028	0 %	25 %	50 %	25 %	159161957
124	NC_003065	GAGG	2	8	51537	51544	25 %	0 %	75 %	0 %	16119854
125	NC_003065	GCGA	2	8	51589	51596	25 %	0 %	50 %	25 %	16119854
126	NC_003065	CTGG	2	8	52440	52447	0 %	25 %	50 %	25 %	159161958
127	NC_003065	ACGG	2	8	52477	52484	25 %	0 %	50 %	25 %	159161958
128	NC_003065	CCGA	2	8	52829	52836	25 %	0 %	25 %	50 %	159161958
129	NC_003065	TGAC	2	8	52912	52919	25 %	25 %	25 %	25 %	159161958
130	NC_003065	CCAA	2	8	53616	53623	50 %	0 %	0 %	50 %	16119856
131	NC_003065	ATCC	2	8	53885	53892	25 %	25 %	0 %	50 %	16119856
132	NC_003065	GCGG	2	8	55733	55740	0 %	0 %	75 %	25 %	16119857
133	NC_003065	TGCC	2	8	55810	55817	0 %	25 %	25 %	50 %	16119857
134	NC_003065	GACC	2	8	56032	56039	25 %	0 %	25 %	50 %	16119857
135	NC_003065	GACG	2	8	56302	56309	25 %	0 %	50 %	25 %	159161959
136	NC_003065	TTCG	3	12	56759	56770	0 %	50 %	25 %	25 %	159161959
137	NC_003065	TGAC	2	8	56915	56922	25 %	25 %	25 %	25 %	159161959
138	NC_003065	GGGC	2	8	57002	57009	0 %	0 %	75 %	25 %	159161959
139	NC_003065	CGTC	2	8	57096	57103	0 %	25 %	25 %	50 %	159161959
140	NC_003065	CAGG	2	8	57564	57571	25 %	0 %	50 %	25 %	16119859
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