MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 2624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003065	TGA	2	6	157066	157071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161983
2002	NC_003065	GAG	2	6	157093	157098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161983
2003	NC_003065	TTG	2	6	157200	157205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161983
2004	NC_003065	TCA	2	6	157229	157234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161983
2005	NC_003065	CGG	2	6	157631	157636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161984
2006	NC_003065	GGC	2	6	157709	157714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161984
2007	NC_003065	TCG	2	6	157741	157746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161984
2008	NC_003065	TTC	2	6	157759	157764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161984
2009	NC_003065	AAG	2	6	157797	157802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161984
2010	NC_003065	CGT	2	6	158026	158031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161984
2011	NC_003065	TCG	3	9	158086	158094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161984
2012	NC_003065	CAT	2	6	158186	158191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161984
2013	NC_003065	GAA	2	6	158216	158221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161984
2014	NC_003065	GTT	2	6	158226	158231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161984
2015	NC_003065	ATG	2	6	158325	158330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119957
2016	NC_003065	TTC	2	6	158672	158677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119957
2017	NC_003065	TCG	2	6	158818	158823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119957
2018	NC_003065	TAC	2	6	158856	158861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119957
2019	NC_003065	TTG	2	6	158929	158934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119957
2020	NC_003065	GTG	2	6	158946	158951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119957
2021	NC_003065	ACG	2	6	158962	158967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119957
2022	NC_003065	TCG	2	6	159013	159018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119957
2023	NC_003065	ATC	2	6	159066	159071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119957
2024	NC_003065	GAC	2	6	159087	159092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119957
2025	NC_003065	AAG	2	6	159178	159183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119957
2026	NC_003065	AAG	2	6	159195	159200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119957
2027	NC_003065	GAA	2	6	159257	159262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119957
2028	NC_003065	GAG	2	6	159348	159353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119957
2029	NC_003065	TAT	2	6	159420	159425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119957
2030	NC_003065	TGA	4	12	159445	159456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119957
2031	NC_003065	AGG	2	6	159742	159747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119957
2032	NC_003065	GAT	2	6	159827	159832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119957
2033	NC_003065	CAA	2	6	159842	159847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119957
2034	NC_003065	ATC	2	6	159984	159989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161985
2035	NC_003065	TCG	2	6	160033	160038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161985
2036	NC_003065	CAG	2	6	160190	160195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161985
2037	NC_003065	TTA	2	6	160220	160225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159161985
2038	NC_003065	AGC	2	6	160233	160238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161985
2039	NC_003065	TCT	2	6	160292	160297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161985
2040	NC_003065	TGA	2	6	160414	160419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161985
2041	NC_003065	CGA	2	6	160424	160429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161985
2042	NC_003065	ACG	2	6	160452	160457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161985
2043	NC_003065	TCT	2	6	160475	160480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161985
2044	NC_003065	GGA	2	6	160481	160486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161985
2045	NC_003065	GCG	2	6	160563	160568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161985
2046	NC_003065	TCG	2	6	160588	160593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161985
2047	NC_003065	TTG	2	6	160614	160619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159161985
2048	NC_003065	GAC	2	6	160680	160685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161985
2049	NC_003065	GCC	2	6	160691	160696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161985
2050	NC_003065	TTA	2	6	160748	160753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159161985
2051	NC_003065	CTT	2	6	160871	160876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119959
2052	NC_003065	GTC	2	6	160994	160999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119959
2053	NC_003065	CCA	2	6	161055	161060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119959
2054	NC_003065	GGC	2	6	161257	161262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119959
2055	NC_003065	GAT	2	6	161296	161301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119959
2056	NC_003065	GTT	2	6	161345	161350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119959
2057	NC_003065	TCA	2	6	161487	161492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119959
2058	NC_003065	CGT	2	6	161554	161559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119959
2059	NC_003065	ACC	2	6	161665	161670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119959
2060	NC_003065	CGC	2	6	161763	161768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119959
2061	NC_003065	GAT	2	6	161857	161862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119959
2062	NC_003065	GAT	2	6	161874	161879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119959
2063	NC_003065	ATG	2	6	161920	161925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119960
2064	NC_003065	TCA	2	6	161945	161950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119960
2065	NC_003065	GCA	2	6	162016	162021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119960
2066	NC_003065	TCG	2	6	162203	162208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119960
2067	NC_003065	ATC	2	6	162223	162228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119960
2068	NC_003065	GCA	2	6	162229	162234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119960
2069	NC_003065	CCG	2	6	162237	162242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119960
2070	NC_003065	GCC	2	6	162250	162255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119960
2071	NC_003065	TGC	2	6	162353	162358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119960
2072	NC_003065	GCA	2	6	162381	162386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119960
2073	NC_003065	TCG	2	6	162743	162748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119960
2074	NC_003065	CGC	2	6	162845	162850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119961
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2076	NC_003065	GCA	2	6	162943	162948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119961
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2081	NC_003065	CAT	2	6	163266	163271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119961
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2084	NC_003065	TCG	2	6	163347	163352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119961
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2089	NC_003065	CAC	2	6	163588	163593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119961
2090	NC_003065	ACT	2	6	163617	163622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119961
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2092	NC_003065	CGG	2	6	163780	163785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161986
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2102	NC_003065	CCG	2	6	164919	164924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223347
2103	NC_003065	GAT	2	6	165012	165017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223347
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2105	NC_003065	GCG	2	6	165283	165288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119964
2106	NC_003065	GCG	2	6	165339	165344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119964
2107	NC_003065	GGA	2	6	165478	165483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119964
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2115	NC_003065	CAG	2	6	165731	165736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119964
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2119	NC_003065	GGA	2	6	166265	166270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161987
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2238	NC_003065	GTC	2	6	181292	181297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119781
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2477	NC_003065	CGC	2	6	200631	200636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223312
2478	NC_003065	CGC	2	6	200639	200644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223312
2479	NC_003065	TCA	2	6	200650	200655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223312
2480	NC_003065	CAA	2	6	200746	200751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41223312
2481	NC_003065	GAA	2	6	200817	200822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41223312
2482	NC_003065	CTT	2	6	200887	200892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223312
2483	NC_003065	CGG	2	6	200912	200917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223312
2484	NC_003065	AGC	2	6	200948	200953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223312
2485	NC_003065	CCT	2	6	201059	201064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	41223312
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2487	NC_003065	TAT	2	6	201224	201229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41223312
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2489	NC_003065	TTA	2	6	201502	201507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41223312
2490	NC_003065	ATT	2	6	201544	201549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	41223312
2491	NC_003065	CAA	2	6	201657	201662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	41223312
2492	NC_003065	GCC	2	6	201663	201668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223312
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