MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 2968

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003065	CGA	2	6	36982	36987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119837
502	NC_003065	GAT	2	6	37019	37024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
503	NC_003065	TGA	3	9	37084	37092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
504	NC_003065	TCC	2	6	37150	37155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119837
505	NC_003065	GAA	2	6	37162	37167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119837
506	NC_003065	GCT	2	6	37191	37196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119837
507	NC_003065	GCC	2	6	37226	37231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119837
508	NC_003065	GAT	2	6	37235	37240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
509	NC_003065	GAC	2	6	37308	37313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119837
510	NC_003065	GTA	2	6	37358	37363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
511	NC_003065	GCG	2	6	37387	37392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119837
512	NC_003065	TGA	2	6	37399	37404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
513	NC_003065	GAA	2	6	37428	37433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119837
514	NC_003065	TTC	2	6	37443	37448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119837
515	NC_003065	ACA	2	6	37479	37484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119837
516	NC_003065	GAG	2	6	37493	37498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119837
517	NC_003065	CGT	2	6	37520	37525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119837
518	NC_003065	CGG	2	6	37531	37536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119837
519	NC_003065	GAT	2	6	37559	37564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119837
520	NC_003065	CTC	2	6	37588	37593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119838
521	NC_003065	GGA	2	6	37644	37649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119838
522	NC_003065	TCG	2	6	37700	37705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119838
523	NC_003065	CGA	2	6	37748	37753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
524	NC_003065	GGC	2	6	37821	37826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119838
525	NC_003065	GCT	2	6	37882	37887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119838
526	NC_003065	GCA	2	6	38039	38044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
527	NC_003065	CCG	2	6	38053	38058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119838
528	NC_003065	GAT	2	6	38073	38078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
529	NC_003065	AAC	2	6	38100	38105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119838
530	NC_003065	GCA	2	6	38161	38166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119838
531	NC_003065	GAT	2	6	38181	38186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
532	NC_003065	TCA	2	6	38222	38227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119838
533	NC_003065	AGT	2	6	38275	38280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119838
534	NC_003065	CGT	2	6	38382	38387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223319
535	NC_003065	GGC	2	6	38434	38439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223319
536	NC_003065	TCT	2	6	38477	38482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223319
537	NC_003065	TTG	2	6	38555	38560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	41223319
538	NC_003065	ACG	2	6	38639	38644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223319
539	NC_003065	CAT	2	6	38683	38688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223319
540	NC_003065	GTC	2	6	38852	38857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223319
541	NC_003065	GAG	2	6	38875	38880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41223319
542	NC_003065	CGC	2	6	38932	38937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223319
543	NC_003065	ATG	2	6	38939	38944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	41223319
544	NC_003065	CAT	2	6	38946	38951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223319
545	NC_003065	CGA	2	6	38997	39002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223319
546	NC_003065	GAA	2	6	39205	39210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	41223319
547	NC_003065	CTT	2	6	39337	39342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
548	NC_003065	CAC	2	6	39428	39433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
549	NC_003065	CCA	2	6	39487	39492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
550	NC_003065	TCG	2	6	39519	39524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223320
551	NC_003065	GCT	3	9	39574	39582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223320
552	NC_003065	CCG	2	6	39585	39590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223320
553	NC_003065	GGC	2	6	39608	39613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	41223320
554	NC_003065	GAC	2	6	39836	39841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223320
555	NC_003065	CTT	2	6	39844	39849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
556	NC_003065	TCT	2	6	40020	40025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223320
557	NC_003065	CCA	2	6	40027	40032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223320
558	NC_003065	CGC	2	6	40131	40136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_003065	GCA	2	6	40169	40174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_003065	CCG	2	6	40188	40193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_003065	TTC	2	6	40201	40206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_003065	AGG	2	6	40355	40360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_003065	CAG	2	6	40369	40374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161955
564	NC_003065	CAC	2	6	40775	40780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159161955
565	NC_003065	GCC	2	6	40817	40822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161955
566	NC_003065	CGC	2	6	40925	40930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161955
567	NC_003065	GCG	2	6	40942	40947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161955
568	NC_003065	AGT	2	6	40971	40976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161955
569	NC_003065	TCG	2	6	41026	41031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161955
570	NC_003065	ACT	2	6	41047	41052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161955
571	NC_003065	TTC	2	6	41116	41121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159161955
572	NC_003065	CCG	2	6	41136	41141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161955
573	NC_003065	GCA	2	6	41222	41227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119842
574	NC_003065	TCG	2	6	41407	41412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119842
575	NC_003065	CGA	2	6	41424	41429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119842
576	NC_003065	TCC	2	6	41460	41465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119842
577	NC_003065	GTT	2	6	41523	41528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119842
578	NC_003065	CAG	2	6	41540	41545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119842
579	NC_003065	TCC	2	6	41713	41718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119843
580	NC_003065	GCC	2	6	41891	41896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119843
581	NC_003065	GAT	2	6	41924	41929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119843
582	NC_003065	GAC	2	6	41939	41944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119843
583	NC_003065	GAC	2	6	42158	42163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119843
584	NC_003065	GAA	2	6	42203	42208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119843
585	NC_003065	TCC	2	6	42210	42215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119843
586	NC_003065	GCG	2	6	42273	42278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119843
587	NC_003065	GCG	2	6	42330	42335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119843
588	NC_003065	GCG	2	6	42405	42410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119843
589	NC_003065	CGT	2	6	42614	42619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119843
590	NC_003065	CTG	2	6	42623	42628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119843
591	NC_003065	ATG	2	6	42639	42644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119843
592	NC_003065	AGA	2	6	42757	42762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119843
593	NC_003065	CGA	2	6	42778	42783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119843
594	NC_003065	CCT	3	9	42841	42849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119843
595	NC_003065	CAC	2	6	42940	42945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223322
596	NC_003065	GTG	2	6	42948	42953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	41223322
597	NC_003065	GAC	2	6	43025	43030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223322
598	NC_003065	TCT	2	6	43066	43071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223322
599	NC_003065	CCA	2	6	43195	43200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223322
600	NC_003065	CGC	2	6	43220	43225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223322
601	NC_003065	ATC	2	6	43463	43468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	41223323
602	NC_003065	TCT	2	6	43575	43580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	41223323
603	NC_003065	GCC	2	6	43605	43610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223323
604	NC_003065	GCT	2	6	43647	43652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223323
605	NC_003065	GTC	2	6	43808	43813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	41223323
606	NC_003065	ACC	2	6	43814	43819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223323
607	NC_003065	CCG	2	6	43874	43879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223323
608	NC_003065	ACC	2	6	43943	43948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	41223323
609	NC_003065	CGC	2	6	43950	43955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223323
610	NC_003065	GGA	2	6	44140	44145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	41223323
611	NC_003065	CGA	2	6	44175	44180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223323
612	NC_003065	GCA	2	6	44186	44191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223323
613	NC_003065	GCG	3	9	44321	44329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119846
614	NC_003065	TGC	2	6	44348	44353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119846
615	NC_003065	CGA	2	6	44438	44443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119846
616	NC_003065	TGT	2	6	44444	44449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119846
617	NC_003065	TTC	2	6	44473	44478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119846
618	NC_003065	GAG	3	9	44494	44502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119846
619	NC_003065	AGC	2	6	44548	44553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119846
620	NC_003065	CAC	2	6	44583	44588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119846
621	NC_003065	CTG	2	6	44670	44675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119846
622	NC_003065	CGA	2	6	44717	44722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119846
623	NC_003065	ATC	2	6	44788	44793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119846
624	NC_003065	GCC	3	9	44821	44829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119846
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1000	NC_003065	GTA	2	6	71296	71301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119873

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