MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	AT	3	6	8	13	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003065	GT	4	8	182	189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003065	TA	3	6	263	268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003065	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003065	TA	3	6	303	308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003065	GT	3	6	1749	1754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003065	TA	3	6	2069	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003065	CG	3	6	2323	2328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003065	AT	3	6	3135	3140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003065	TG	3	6	3450	3455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003065	AG	3	6	5680	5685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003065	CA	3	6	8617	8622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_003065	TG	4	8	8666	8673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003065	CT	3	6	10184	10189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_003065	AT	3	6	11548	11553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003065	TA	3	6	13033	13038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003065	GT	3	6	14150	14155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003065	AT	4	8	14325	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003065	GT	3	6	21220	21225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003065	CG	4	8	22980	22987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_003065	GC	3	6	23005	23010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003065	AT	3	6	24819	24824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003065	GT	3	6	31210	31215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003065	GC	3	6	39275	39280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_003065	CG	3	6	52123	52128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_003065	CG	4	8	57375	57382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_003065	CG	3	6	58626	58631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_003065	AG	4	8	61308	61315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003065	GT	3	6	65204	65209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003065	AC	3	6	66155	66160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_003065	GC	3	6	66215	66220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_003065	GC	3	6	66308	66313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_003065	GC	3	6	84312	84317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_003065	TA	3	6	95913	95918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003065	GC	3	6	96950	96955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_003065	TC	3	6	97771	97776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003065	TA	3	6	101678	101683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003065	CG	3	6	116261	116266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003065	CG	3	6	120429	120434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_003065	GC	3	6	130118	130123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_003065	CG	3	6	139221	139226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_003065	TC	3	6	139269	139274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_003065	AG	3	6	140235	140240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003065	TC	3	6	140331	140336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_003065	AC	3	6	140809	140814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_003065	CG	4	8	158251	158258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_003065	GC	4	8	159884	159891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_003065	CA	3	6	165742	165747	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_003065	CT	4	8	172433	172440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_003065	GA	3	6	172466	172471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003065	TG	3	6	174777	174782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003065	GC	3	6	175985	175990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_003065	GC	3	6	178193	178198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_003065	AT	3	6	178208	178213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003065	GC	3	6	179171	179176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_003065	CG	3	6	180653	180658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_003065	AC	3	6	180724	180729	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_003065	GC	3	6	183386	183391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_003065	AG	3	6	183692	183697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003065	GA	3	6	193478	193483	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003065	GA	3	6	194443	194448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003065	GT	3	6	195787	195792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003065	TG	3	6	195806	195811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003065	AC	3	6	210111	210116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_003065	GC	3	6	210527	210532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_003065	GC	3	6	210942	210947	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.